АвторТема: Как рассчитать возраст общего предка  (Прочитано 19774 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн alexisАвтор темы

  • Сообщений: 92
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
  • Russian in E1b1b1b2a1d*
  • Y-ДНК: E-Y38758
  • мтДНК: N1b1b2
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #45 : 15 Сентябрь 2011, 16:17:17 »
Непременно попробую.

Однако, как скачут гаплотипы по веткам в зависимости от их длины.
« Последнее редактирование: 16 Сентябрь 2011, 15:35:57 от alexis »

Оффлайн alexisАвтор темы

  • Сообщений: 92
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
  • Russian in E1b1b1b2a1d*
  • Y-ДНК: E-Y38758
  • мтДНК: N1b1b2
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #46 : 27 Сентябрь 2011, 10:48:41 »
Дорогой Farroukh!

Я построил деревья отдельно для D2, затем отдельно для D1 и D2, затем отдельно для C, D1 и D2. На всех я помещаюсь одинаково - возле Саваров.

Так что у кого-то из нас неточность при построении обособленного древа D2 (если на моём древе я помещаюсь у Саваров, а на Вашем - у армян).  ???

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 16948
  • Страна: az
  • Рейтинг +5794/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #47 : 27 Сентябрь 2011, 12:48:05 »
Алексей, поздравляю с освоением Мурки!

Что же до разных древ, то это обычное дело, и причин может быть много. В первую очередь имеет значение состав выборки и длина гаплотипов. Вы можете получить разные деревья для 37- и 67-маркёрных выборок, а также добавляя или убирая отдельные гаплотипы.

Наш брат Вадим Урасин рекомендует следующее: добавить в выборку гаплотип из соседнего субклада. Например, возьмите кого-нибудь из  E1b1b1c* или даже E1b1b1a3.

Введение диверсанта должно более стабилизировать древо. Попробуйте и опубликуйте их здесь. У меня сейчас под рукой просто нет Мурки.

Оффлайн alexisАвтор темы

  • Сообщений: 92
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
  • Russian in E1b1b1b2a1d*
  • Y-ДНК: E-Y38758
  • мтДНК: N1b1b2
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #48 : 27 Сентябрь 2011, 13:45:58 »
Интересное предложение! Добавил 74277 Lindo из E1b1b1a3*-D. И получилось, что я, Савары, Тамбис, Колхамиро и Руссо в одной ветке, а Хачерян и Атечан в параллельной!  ;)

Значит, всё-таки (скорее всего) евреи мне ближе, чем армяне?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10072
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1369/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #49 : 27 Сентябрь 2011, 13:48:20 »
Интересное предложение! Добавил 74277 Lindo из E1b1b1a3*-D. И получилось, что я, Савары, Тамбис, Колхамиро и Руссо в одной ветке, а Хачерян и Атечан в параллельной!  ;)

Значит, всё-таки (скорее всего) евреи мне ближе, чем армяне?


а что на консенсусном дереве? И сколько деревьев всего?

Оффлайн alexisАвтор темы

  • Сообщений: 92
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
  • Russian in E1b1b1b2a1d*
  • Y-ДНК: E-Y38758
  • мтДНК: N1b1b2
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #50 : 27 Сентябрь 2011, 14:02:24 »
Valery, а что такое "консенсусное" древо?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 16948
  • Страна: az
  • Рейтинг +5794/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #51 : 27 Сентябрь 2011, 14:13:43 »
Алексей, постройте 12, 25, 37 и 67 маркёрные деревья - в данном случае, чем короче гаплотип, тем больше самих гаплотипов, ведь не используя короткие, но уникальные 12-маркёрные гаплотипы мы лишаем себя возможности получить наиболе достоверную информацию.

Касательно евреев. Те из них, что якобы близки вам - это сефарды. В Россию они могли попасть лишь через волну переселенцев-ашкеназов. Ашкеназов в данном кластере нет вообще - учтите, что евреи весьма охотно тестируются, и если бы кластер был полностью еврейским, то их было бы там несколько десятков человек. Вы писали, что как минимум с 18 века ваш род осознавал себя русскими. Массовое появление ашкеназов в России относится к 18 веку, жили эти люди в местечках, и весьма обособленно. Массовое крещение было позже, в 19-20 веках.

Кстати, знаете закон Био - Савара - Лапласа? Этот Савар, оказывается, из наших.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10072
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1369/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #52 : 27 Сентябрь 2011, 14:16:52 »
Valery, а что такое "консенсусное" древо?

Это типа "согласование" всех топологий которые были построены. Оно обычно беднее (и часто бесполезно) но ближе к истине. В мурке файл консенсуса имеет суффикс "_cons", ищите.

Но это имеет смысл только если деревьев было много. Судя по тому файлу который Вы выложили, это не так, там выходит только одна топология. Может добавить еще данных?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10072
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1369/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #53 : 27 Сентябрь 2011, 14:22:02 »
alexis, пометьте имя чужого гаплотипа префиксом n@ чтобы он не учитывался при подсчете возраста кластера.

Оффлайн alexisАвтор темы

  • Сообщений: 92
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
  • Russian in E1b1b1b2a1d*
  • Y-ДНК: E-Y38758
  • мтДНК: N1b1b2
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #54 : 27 Сентябрь 2011, 14:46:44 »
alexis, пометьте имя чужого гаплотипа префиксом n@ чтобы он не учитывался при подсчете возраста кластера.

Поставил префикс, вот древо. И консенсусное.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10072
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1369/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #55 : 27 Сентябрь 2011, 14:47:47 »
Цитировать
И получилось, что я, Савары, Тамбис, Колхамиро и Руссо в одной ветке, а Хачерян и Атечан в параллельной!

смотрел на деревья но разницы по-моему никакой кроме того что при добавлении чужака установился другой корень. Дерево-то по сути то же самое.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10072
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1369/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #56 : 27 Сентябрь 2011, 14:52:08 »
А вот новое (в последнем посте) отличается.

Попроьуйте увеличить точность учитывая что у Вас мало гаплотипов это получится быстро.


-b 500 -f "NOFU|NS3|STAPPR|FH" -m 0.6 -n 500 -l 20

Оффлайн alexisАвтор темы

  • Сообщений: 92
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
  • Russian in E1b1b1b2a1d*
  • Y-ДНК: E-Y38758
  • мтДНК: N1b1b2
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #57 : 27 Сентябрь 2011, 14:53:27 »
Алексей, постройте 12, 25, 37 и 67 маркёрные деревья - в данном случае, чем короче гаплотип, тем больше самих гаплотипов, ведь не используя короткие, но уникальные 12-маркёрные гаплотипы мы лишаем себя возможности получить наиболе достоверную информацию.
Спасибо, очень интересно. Непременно попробую.

Вы писали, что как минимум с 18 века ваш род осознавал себя русскими. Массовое появление ашкеназов в России относится к 18 веку, жили эти люди в местечках, и весьма обособленно. Массовое крещение было позже, в 19-20 веках.
Выходит, евреи с большой долей вероятности отпадают?

Кстати, знаете закон Био - Савара - Лапласа? Этот Савар, оказывается, из наших.
Надо же!

Оффлайн alexisАвтор темы

  • Сообщений: 92
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
  • Russian in E1b1b1b2a1d*
  • Y-ДНК: E-Y38758
  • мтДНК: N1b1b2
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #58 : 27 Сентябрь 2011, 15:07:39 »
Попроьуйте увеличить точность учитывая что у Вас мало гаплотипов это получится быстро.


-b 500 -f "NOFU|NS3|STAPPR|FH" -m 0.6 -n 500 -l 20
Вот результат.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 16948
  • Страна: az
  • Рейтинг +5794/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Как рассчитать возраст общего предка
« Ответ #59 : 27 Сентябрь 2011, 15:13:59 »
Цитировать
Выходит, евреи с большой долей вероятности отпадают?
Да, более чем. Дело в том, что многие еврейсские линии на территории Российской империи сохранились и не были уничтожены во времена Холокоста. Если бы у вас был реальный еврейский бэкграунд, то вы были в целиком ашкеназийском кластере, как это было с Алексеем Ляшком.

Цитировать
Надо же!
Помимо Савара, к E1b1b1c1 относятся Ф. Коппола и А. Челентано.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.