Якуты N1c1

[Nimissin]

Посмотрел сырые данные образца игрек-хромосомы N4b2 (Кёрдюгенский воин http://igi.ysn.ru/files/otdel/arh_etno/sotrudniki/alexeev/POGREBENIYE.PDF).
Аллели в позициях мутаций уровня M2126/P298 в количестве 15 штук.
В 12 позициях - производный аллель (мутация есть),
в 2 позициях - не прочитано,
в позиции Z4809 (hg19: 5425348 G A) - предковый аллель (мутации нет).
Игрек-хромосома образца N4b2 находилась на ветви, отошедшей от ствола гаплогруппы N-M2126 незадолго до разделения на ветви M2019 и L392/L1026.
Таким образом, это была третья, отдельная ветвь.

Более точное положение игрек-хромосомы Кёрдюгенского воина на генеалогическом дереве YFull:



Ветвь N4b2 отошла от современной ветви N-L1026 незадолго до появления мутации L392.

[Nimissin]

РСА анализ аутосомных снипов показал, что Кёрдюгенский воин был ближе к современным нганасанам. А современные якуты на той же диаграмме ближе к древнему населению Прибайкалья.

Положение Кёрдюгенского воина на диаграмме отмечено чёрной стрелкой.
Якуты - внутри зелёного эллипса, красным эллипсом отмечено положение нганасан и юкагиров.

[Nimissin]

В работе о игрек-хромосоме древних хазар https://link.springer.com/article/10.1134/S1022795421040049
опубликован гаплотип образца 1566 (первая половина VIII века н.э., раскопан в Ростовской области). В формате Y-STR локусов 19, 389I, 389II, 390, 391, 392, 393, 385a,b, 438, 439, 437, 448, 456, 458, 635, H4:

14-14,15-31-23-11-16-14-11,13-11-10-14-19-15-17-22-11
Гаплотип, без сомнения, из гаплогруппы N-M2019. N-M2019 YTree (yfull.com). Авторы отмечают редкую дупликацию в локусе DYS389I.
 
Дупликации в локусе DYS389 в этой ветви не так уж и редки.
1) Marmara Region, Turkey [Turkish]:
15-13,14-30-23-11-15-15-11,13-11-10-14-19-14-17-23-12
2) Henan, China [Hui]:
14-13,14-29,31-23-11-15-15-11,13-11-10-14-19-14-17-22-11
3) Yunnan, China [Hui]:
14-13,14-30-23-11-15-14-11,13-11-10-14-19-14-17-22-12
4) Ningxia, China [Hui]:
14-14-30,31-23-11-15-15-11,12-11-10-14-19-14-17-22-12
5) Turkey [Turkish]:
15-14-30,32-23-11-15-15-11,13-11-11-14-19-14-16-23-12
6) Czech Republic [Czech]:
14-14-30,32-23-11-15-15-11,13-11-10-14

[Nimissin]

Работа китайских ученых Hu et al (2015) о гаплогруппе N-M231 прояснила картину распространенности большой "якутской" ветви N-M2019.
 http://arxiv.org/abs/1504.06463
Давайте сначала посчитаем. Образцы парагруппы N-M231 были отобраны из большой выборки в 6918 образцов, состоящей из граждан Китая - хань из разных регионов, монголов (из разных племен АРВМ), множества сино-тибетских народов и т.д. Всего было отобрано 513 образцов, это 7.4 % от общей численности выборки. Полученная частота N-M231 согласуется с результатами прежних исследований. В обзорной работе Zhong et al (2010, n = 3826) доля N-M231 была оценена в 6 %. В статье Guo et al (2014, n = 1079) - 64/1079 = 5.9 %.
В работе Guo et al (2014) из 64-х образцов в гаплогруппу N-M46/Tat попали 14 образцов. Частота гаплогруппы N-Tat в Китае по этим данным 14/1079 = 1.3 %.
Авторы Hu et al (2015) обнаружили мутацию Tat в 85 образцах. Частоту этой мутации можно приближенно оценить как 85/6918 = 1.2 %. Приближенно - в связи с тем, что из 513 образцов удалось просниповать 440, остальные оказались непригодны из-за длительного хранения (так написано!). Тем не менее, результаты по частоте N-Tat в Китае у Hu et al (2015) и Guo et al (2014) вполне согласуются друг с другом.
В этих 85 образцах отражается широкое разнообразие различных ветвей с начальной мутацией Tat в Китае:
M178 (xF3331) 22 образца, знак "х" означает отсутствие мутации, в данном случае есть мутация M178, но нет сыновней мутации F3331,
F3331 (xL839) 19 образцов,
L839 (xF3271) 9 образцов,
F3271 (xF2288) 29 образцов,
F2288 6 образцов.
Интересующие нас образцы N-M2019 попадают в градацию L839 (xF3271) - вот так вычурно выбрали снипы авторы.
Их всего 9 и не все они с мутацией M2019. Тут на помощь приходят данные по 17-ти Y-STR локусам. По ним можно распознать гаплотипы большой "якутской" ветви. Из 9 гаплотипов в ветвь N-M2019 уверенно попадают пять. Из 85 образцов только 5 оказались дальними родственниками якутов-саха по мужской линии. Напомню, что ветвь N-M2019 образовалась около 5 тысяч лет назад. То есть речь идет о весьма отдаленном родстве, даже внутри самой ветви N-M2019. Из пяти мужчин только двое оказались этническими хань. Остальные трое - буряты из Хулун Буира. Вероятность обнаружить образцы N-M2019  в Китае ничтожна: 5/6918 = 0.07 %! И предки этих мужчин, похоже, были чужаками среди земледельцев-хань.

Вот и наступил час истины. Для разгадки проблемы происхождения народа саха генетические данные из Китая мало чем помогут. Во всяком случае - в ближайшее время. Слишком редко встречаются среди китайцев наши отдаленные родственники.

Компанией 23Mofang опубликованы данные по гаплогруппе N-M2019. 23Mofang - быстро растущий коммерческий старт-ап, действующий на рынке генетического тестирования. На начало 2021 года у этой компании было около 500 тыс. пользователей.
К настоящему времени среди заказчиков выявлено 426 образцов с гаплогруппой игрек-хромосомы N-M2019. Таким образом, эта гаплогруппы весьма редка в Китае, с частотой около 0.09 %.

Распределение по ветвям:
N-M2019 (xM2058) 2 %,
N-M2058 (xMF36044, M2016, A9408) 8 %,
N-MF36044 0.2 %,
N-M2016 4 %,
N-A9408 86 %.
Этнические хань преобладают во всех ветвях, за исключением N-M2016 и N-PH1612 (в составе N-A9408).

Распределение гаплогруппы N-PH1612 (20 образцов) по регионам:
Синьцзян 5,
Континентальный Китай 6,
Дунбей 3,
этнические корейцы 5,
Нинся-Хуэйский АР 1.

Распределение гаплогруппы N-M2016 (17 образцов) по регионам:
Синьцзян 6,
Внутренняя Монголия 5
Континентальный Китай 5,
Нинся-Хуэйский АР 1.

Не выявлено ни одного образца с гаплогруппой N-M1993/M1987, в которой находится якутская ветвь N-M1982.

Мой вывод, сделанный в 2015 году, подтвердился. Новых данных о родственниках якутов-саха по мужской линии в Китае так и не появилось. Есть только три образца бурятов из Хулун Буира, ветвь которых разошлась с якутской около 2300 лет назад. Ближе пока никого нет.

[Farroukh]

Уважаемый Нимиссин!

Говорил это при очных встречах, повторю ещё раз
Ваш труд не должен пропасть даром. Напишите научно-популярную книгу по генетической этногенеалогии на примере этногенеза якутов в части мужских линий. Там можно привлечь всё - сопоставьте снип M1993 с легендарным Эллэем, призвать в помощь дДНК, историю с археологией. Это была бы конкурентная вещь и без фричества а-ля АК.

[Nimissin]

Уважаемый Нимиссин!

Говорил это при очных встречах, повторю ещё раз
Ваш труд не должен пропасть даром. Напишите научно-популярную книгу по генетической этногенеалогии на примере этногенеза якутов в части мужских линий. Там можно привлечь всё - сопоставьте снип M1993 с легендарным Эллэем, призвать в помощь дДНК, историю с археологией. Это была бы конкурентная вещь и без фричества а-ля АК.

Уважаемый Фаррух, а результата-то всей этой работы нет. Тайна происхождения народа саха не раскрыта. Буду кайлить дальше 

[Valery]

интересно, откуда гг N-A9408 у ливанца из Бейрута GS000020396 из статьи Кармин. У нас китайских образцов нет, поэтому на нашем дереве аутгрупом M2016 работает этот ливанец.

[Asmat headhunter]

Тайна происхождения народа саха не раскрыта.

Мой вывод, сделанный в 2015 году, подтвердился. Новых данных о родственниках якутов-саха по мужской линии в Китае так и не появилось. Есть только три образца бурятов из Хулун Буира, ветвь которых разошлась с якутской около 2300 лет назад. Ближе пока никого нет.

Пока похоже на общность неустановленного уровня (группа? семья? изолят?), которая перешла на языки тюркской и монгольской групп. Но может быть неверно.

[Nimissin]

интересно, откуда гг N-A9408 у ливанца из Бейрута GS000020396 из статьи Кармин. У нас китайских образцов нет, поэтому на нашем дереве аутгрупом M2016 работает этот ливанец.

Полагаю, она пришла в Ливан с турками.

[Valery]

а, вижу турка, болгарина и хорвата на YFull. Тогда сходится.

Таки иногда жаль, что YFull не дружит с платформой комплит дженомикс - можно было бы увидеть место карминовских образцов у них.

[Valery]

Прверил, он ближайший родственник турка и венгра с YFull, вот его приват ниже M2058 (с поправкой на мой кривоватый коллинг CG):


02890144(PH106) G>C               
06052899 T>C               
06398458 T>C               
06400223 C>T               
06779239(PH187) A>C               
07840457(F16310) G>A               
07905539(F16406) T>A               
07981758(M2149/Z4850) A>T               
08329785(F16907) C>T               
09400181(A9407) T>A               
13552947 C>A               
14083215(A9408) G>A               
14312514(PH1110) A>G               
15122362(PH1612) C>T               
15357519(F19724) T>C               
15782544(F20150) T>A               
15924855(PH1896) T>C               
15998116(PH1956) T>C               
16037395(PH1978) A>T               
16463977(F20718) G>T               
16469918(F20720/FGC65424) G>T               
16500799(CTS5841/M2046) T>C               
16561315(F20828) T>C               
16694689(PH2459) T>G               
16844036(F21122) A>G               
16874306(F21160) A>G               
16994673(CTS6587/M2213) A>G               
17048950(A9410) C>T               
17064743(A9411) G>A               
17113344(PH2833) T>C               
17749060(A9412) G>T               
18077350(PH3669) G>A               
18186663(F22552/FGC65420) C>A               
18226901(CTS8823/M2073) T>G               
18414413 G>A               
19001450(F23165) C>G               
19018994(CTS9674/M2079) T>C               
22063914(A9413) G>A               
22229722(BY3874/E172) A>T               
22262701(BY12139) A>T               
22270561(FGC17178) C>T               
22318233 G>A               
22457892(YFS033298/ZS1596) C>A               
22472713(Z4994) A>C               
22484333(BY12381) A>G               
22484341 A>T               
22664764(F25347) T>G               
23210614(Z5030) C>T               
23567068(A9414) G>A               
28680881(CTS12717/M5052/PF1930) G>T         

(поз. в сборке 37)      

[G-Man]

Компанией 23Mofang опубликованы данные по гаплогруппе N-M2019. 23Mofang - быстро растущий коммерческий старт-ап, действующий на рынке генетического тестирования. На начало 2021 года у этой компании было около 500 тыс. пользователей.
К настоящему времени среди заказчиков выявлено 426 образцов с гаплогруппой игрек-хромосомы N-M2019. Таким образом, эта гаплогруппы весьма редка в Китае, с частотой около 0.09 %.

Там ведь не только мужчины?  В этих 500 тыс. 

[Nimissin]

Компанией 23Mofang опубликованы данные по гаплогруппе N-M2019. 23Mofang - быстро растущий коммерческий старт-ап, действующий на рынке генетического тестирования. На начало 2021 года у этой компании было около 500 тыс. пользователей.
К настоящему времени среди заказчиков выявлено 426 образцов с гаплогруппой игрек-хромосомы N-M2019. Таким образом, эта гаплогруппы весьма редка в Китае, с частотой около 0.09 %.

Там ведь не только мужчины?  В этих 500 тыс.

Да. Заказывают мтДНК, какие-то аутосомные тесты. К сожалению, дифференцированного распределения не нашел.
Согласен с Вами, 0.09 % - это только оценка порядка величины.

[Nimissin]

Аа.  А я подумал это кто-то из хулун-буирских бурят. Кстати почему их нет на Уфулл?

Появились на дереве YFull:
https://www.yfull.com/tree/N-M2016/

Правда, не совсем там, где нужно. Они все-таки образуют отдельную ветвь, отделившуюся от якутской M1982/M1993 раньше, около 2300 лет назад.

[sygyssab]

 Спасибо