АвторТема: Якуты N1c1  (Прочитано 165152 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Якуты N1c1
« Ответ #30 : 27 Январь 2010, 00:39:12 »
Так мы эти материалы уже обсуждали.. правда там была докторская дисс. француза... видимо теперь превратили в статью.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 10663
  • Страна: tt
  • Рейтинг +2057/-46
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Якуты N1c1
« Ответ #31 : 27 Январь 2010, 00:49:27 »
правда там была докторская дисс. француза...
Ну так и по сравнению с французским английский почти родным кажется. :)

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2240
  • Рейтинг +659/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Якуты N1c1
« Ответ #32 : 27 Январь 2010, 11:45:06 »
Спасибо, уважаемый Zastrug, за ссылку!
Эта статья содержит основные положения диссертации Сильвена Амори (2007) с небольшими дополнениями. Считаю, что французы проделали очень большую и полезную работу для более глубокого понимания происхождения якутов-саха. К сожалению, за 2 с лишним года после защиты диссертации не устранены небольшие огрехи в части исследования Y-хромосом.
1. Гаплотип YAKa26 отнесен к гаплогруппе К(хN,O,P). На самом деле гаплотип совпадает с модальным гаплотипом N1b. Из работы видно, что снип Р43 не определяли. Более корректно было бы указать гаплогруппу К(xN1c,O,P) или K(xTAT,O,P).
2. В статье указано, что гаплогруппа образцов YAKa49 и YAKa57 не установлена, но аллель С в снипе ТАТ-С отсутствует. А по значениям STR маркеров YAKa49 и YAKa57 с очень большой вероятностью относятся к гаплогруппе N1c1, которая как раз определяется по мутации Т -> С. YAKa49 близок к модальному гаплотипу N1c1 (в целом по гаплогруппе), а YAKa57 по 9 маркерам совпадает с гаплотипом N1c1 из работы Пакендорф и др. (2006).

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2240
  • Рейтинг +659/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Якуты N1c1
« Ответ #33 : 28 Январь 2010, 10:43:55 »
В рамках логистической модели роста численности популяции авторы выдвинули 2 альтернативных предположения о переселении предков якутов-саха на Среднюю Лену:
1) Очень маленькая группа (50-100 чел.) переселилась около 800-1000 г.г. Затем численность росла с темпом 0.6-0.9 % в год.
2) Более многочисленная группа мигрировала между 1294 (распад Монгольской империи) и 1400 годами. Темп роста населения до 1632 г. 1.5-2 %.
В статье указано, что численность коневодов-викингов, заселивших Исландию, росла с темпом около 1 % в год.
По моим прикидкам, между 1650 и 2000 г.г. средний темп роста численности саха составлял около 0.7 % в год.
« Последнее редактирование: 24 Ноябрь 2012, 04:26:40 от Nimissin »

Оффлайн mouglley

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Якуты N1c1
« Ответ #34 : 28 Январь 2010, 19:05:57 »
А эти две волны миграций предков якутов как-то заметны по гаплотипам всех работ про якутов?

Сам не перепроверял, но насколько помню и гаплотипы и Вашу опубликованную работу по ним, он идут одному роду-N1c1*, жившему где-то 1200-1400 лет назад.

На мой взгляд, переселение рода, генетически близкого к уже обитающему на какой-то территории менее вероятна, чем приход иного, но близкого по "национальной" принадлежности рода.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2240
  • Рейтинг +659/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Якуты N1c1
« Ответ #35 : 29 Январь 2010, 14:03:54 »
А эти две волны миграций предков якутов как-то заметны по гаплотипам всех работ про якутов?
Это альтернативные варианты численных расчетов. Первый вариант для меня выглядит более правдоподобным. 9-12 вв. - период малого климатического оптимума. Проверил средний темп роста численности исландцев с 900 по 2000 годы, получилось 0.5 % в год. Что-то намудрили французы с 1 %...

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2240
  • Рейтинг +659/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Якуты N1c1
« Ответ #36 : 01 Март 2010, 06:15:23 »
В обзоре по гаплогруппам якутов (http://rjgg.molgen.org/index.php/RJGGRE/article/view/37) Адамов приводит данные француженок Катерины Тевэ и Морганы Жибер из базы YHRD.org. Их статья, наконец, опубликована:
Catherine Th?ves, Patricia Balaresque, Larissa E. Evdokimova, Innokentevich V. Timofeev, Anatoly N. Alekseev, Andr? Sevin, Eric Crub?zy, Morgane Gibert. Population genetics of 17 Y-chromosomal STR loci in Yakutia. Forensic Science International: Genetics. DOI: 10.1016/j.fsigen.2010.01.018
http://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(10)00026-8/abstract
« Последнее редактирование: 01 Март 2010, 06:25:08 от Nimissin »

Оффлайн mouglley

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Якуты N1c1
« Ответ #37 : 01 Март 2010, 09:13:33 »
Ага, ещё одна ссылка:
Population genetics of 17 Y-chromosomal STR loci in Yakutia Catherine Th?vesa,  Patricia Balaresque, Larissa E. Evdokimova, Innokentevich V. Timofeev, Anatoly N. Alekseev, Andr? Sevin, Eric Crub?zy and Morgane Gibert
Цитировать
Abstract

Haplotype and allele frequencies of 17 Y-chromosomal short tandem repeat (Y-STR) markers in a population sample of 133 Yakut male volunteers from two regions: Central (n = 41) and Western Yakutia (n = 92) were determined using the AmpFlSTR Yfiler PCR Amplification Kit (Applied Biosystems). A total of 65 haplotypes were identified in the Yakut population, with 15 haplotypes in Central sample and 54 haplotypes in Western sample. Haplotype diversity values of 0.79 and 0.96, and average gene diversity values of 0.14 and 0.41 were calculated for Central and Western samples, respectively. The Fst distances between both our Yakut populations with other Russian, Siberian and Chinese populations were represented by MDS plot. The graphical view demonstrated close distances between most Yakut populations and differences with other Siberian populations.

Оффлайн АнТюр

  • Сообщений: 544
  • Рейтинг +50/-125
Re: Якуты N1c1
« Ответ #38 : 01 Март 2010, 11:01:54 »
Наверно уже обсуждали. Но на всякий случай дам ссылку.

Genetic analysis of human remains found in two eighteenth century Yakut graves at At-Dabaan

http://www.springerlink.com/content/nj6w0da9kub21et0/?p=c63cf0ed00af410fadee0f81c1f9fc14&pi=2

Fran?ois-Xavier Ricaut1, 2  , Sergei Kolodesnikov3, Christine Keyser-Tracqui1, Anatoly Nikoyevich Alekseev4, Eric Crub?zy2 and Bertrand Ludes1,

Abstract  We extracted DNA from three skeletons belonging to the Yakut population, which were excavated from the At-Dabaan site (dating back 300 years) in the Sakha Republic (Russia). Ancient DNA was analyzed by autosomal STRs (short tandem repeats) and by the sequencing of the hypervariable region 1 (HV1) of the mitochondrial DNA (mtDNA) control region. The results showed that these three skeletons were not close relatives but probably linked to the same clan structure. Comparison of their haplotypes with the haplotypes of 8,774 Eurasian individuals suggested a relative specificity and continuity of part of the Yakut mitochondrial gene pool during the last 3 centuries.

Keywords  Siberia - Sakha - Ancient DNA - Mitochondrial DNA - Autosomal STRs

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10574
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Якуты N1c1
« Ответ #39 : 16 Ноябрь 2010, 15:57:10 »
На всякий случай, если у кого-то еще нет статьи

Population genetics of 17 Y-chromosomal STR loci in Yakutia



Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19392
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1578/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Якуты N1c1
« Ответ #40 : 16 Ноябрь 2010, 17:38:05 »
Может тему сделаем, где выкладывать гаплотпы из работ. Сами гаплопы закачивать в box, там они хранятся вечно, а в теме давать ссылку, название работы и страну/народ.

Оффлайн Centurion

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9708
  • Страна: ru
  • Рейтинг +569/-2
Re: Якуты N1c1
« Ответ #41 : 16 Ноябрь 2010, 17:56:24 »
Может тему сделаем, где выкладывать гаплотпы из работ. Сами гаплопы закачивать в box, там они хранятся вечно, а в теме давать ссылку, название работы и страну/народ.
А может не надо?  :)

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19392
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1578/-58
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: Якуты N1c1
« Ответ #42 : 16 Ноябрь 2010, 18:06:50 »
Почему?

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2240
  • Рейтинг +659/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Якуты N1c1
« Ответ #43 : 17 Ноябрь 2010, 07:01:55 »
На всякий случай, если у кого-то еще нет статьи

Population genetics of 17 Y-chromosomal STR loci in Yakutia



Спасибо, Вадим! С количеством гаплотипов авторы переборщили.
В таблице Table S1 есть пять пар идентичных гаплотипов:
ht19 и ht27,
ht18 и ht23,
ht22 и ht31,
ht40 и ht44,
ht4 и ht10.
Авторы из 133 Y-хромосом типировали 65 гаплотипов. На самом деле по 17 маркерам Yfiler обнаруживается 60 разных гаплотипов.

Обзор и анализ имеющихся данных по Y-STR гаплотипам якутов N1c1 на завершающей стадии. Готовил его почти два года...

Оффлайн VovanX

  • Группа: ученые-генетики
  • Сообщений: 72
  • Рейтинг +26/-0
  • пляшите с бубном правильно!
  • Y-ДНК: I2a2-M423
Re: Якуты N1c1
« Ответ #44 : 27 Апрель 2011, 12:17:59 »
К вопросу о гаплотипах из статьи Catherine Theves. Несколько гаплотипов имеют очень странный размер по DYS 385b (19). Это гаплотипы под номерами 13, 46 и 57. По совокупности значений в остальных STR эти образцы являются типичными N1c, O2 и С3 соответственно. Осмелюсь предположить в этих трех случаях ошибку генотипирования. В 13 гаплотипе должен быть р-р 11-13, но 11 пик, скорее всего, недоамплифицировался и образец не переделывался. В гаплотипе 57 или то-же самое и р-р тогда 11-12, или 12-12. Размер 19 связан либо с неспецифичным пиком по какому-то из локусов, праймер которого мечен той-же краской или с учетом, вместо пика продукта STR, аберрантного пика маркера молекулярного веса, возникающего при слишком высокой его концентрации в образце на форезе.     

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100