АвторТема: Semargl.me: он-лайн сервис для анализа данных по Y-ДНК  (Прочитано 148301 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Murzalar

  • Сообщений: 4283
  • Страна: ru
  • Рейтинг +346/-1
  • Y-ДНК: I1
  • мтДНК: U5
Тобишь надо сначало в Ysearch его внести?
Да.
Благодарю.

Оффлайн zea78

  • SevskGen.ru
  • Сообщений: 1542
  • Страна: ru
  • Рейтинг +750/-3
  • будем искать
  • Y-ДНК: R1a-YP418*
  • мтДНК: U8a1a1b1*
Кто подскажет, почему в базе Семаргла карта на айпэде перестала отображаться?

Онлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5659
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3571/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Кто подскажет, почему в базе Семаргла карта на айпэде перестала отображаться?
С гуглокартой сейчас есть некоторые проблемы. Бесплатно они разрешают ей пользоваться до достижения определенного порога запросов, по крайней мере так было раньше. Сейчас запросы к картам выполняются значительно дольше. Может это связано с превышением порога бесплатных запросов, а может немного поменялось API. Будет время, займусь этим вопросом. Может сделаю свой картографический сервер и отвяжусь от гугла.

Оффлайн grimsvotn

  • МЖМ Y-DNA: I1-L1248 > Y20842 > I-Y21569 Scandinavia > Germanic tribes > BY86574 Late Scandinavian migrants? Russia-Sweden-Finland
  • Сообщений: 5942
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1572/-1
  • W.Slavic 49%, Magyar 18%, E.Slavic 12%, Baltic 21%
    • I1-L1248 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-FGC11627 Zarubintsy culture > Y220521 - (Principality of Smolensk?) RU-BY borderline cluster
  • мтДНК: T1a1 RU-UA-IRL- T9899C - Bronze Age tribes > (Yamna steppe pastoralists / Pontic-Caspian steppe?) G4596A - Kievan Rus' era migrations(?)
Друзья, можете создать в базе новую пoдгруппу - FGC11555 (внутри L1280)?
Включить туда тех, у кого этот снип положителен ;)

Оффлайн grimsvotn

  • МЖМ Y-DNA: I1-L1248 > Y20842 > I-Y21569 Scandinavia > Germanic tribes > BY86574 Late Scandinavian migrants? Russia-Sweden-Finland
  • Сообщений: 5942
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1572/-1
  • W.Slavic 49%, Magyar 18%, E.Slavic 12%, Baltic 21%
    • I1-L1248 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-FGC11627 Zarubintsy culture > Y220521 - (Principality of Smolensk?) RU-BY borderline cluster
  • мтДНК: T1a1 RU-UA-IRL- T9899C - Bronze Age tribes > (Yamna steppe pastoralists / Pontic-Caspian steppe?) G4596A - Kievan Rus' era migrations(?)
Да, все FGC11555+ здесь, на 2 или 3 страничке:
https://www.familytreedna.com/public/R1a/

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5416
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1816/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
ждем :) чувствуется нехватка! :)

Оффлайн Белгородец

  • Сообщений: 118
  • Страна: ru
  • Рейтинг +44/-0
  • Y-ДНК: I1-Z63-PR683
  • мтДНК: U4a2g
                           Здравствуйте!
На сайте Семаргла есть возможность строить филогенетические деревья, см. http://www.semargl.me/en/dna/ydna/tools/build-tree-and-asd-pairs/
При построении деревьев есть возможность не рассматривать палиндромы DYS464, DYS385 и CDY.
        Результаты без учета и с учетом палиндромов получаются весьма и весьма отличающимися...
        Понятно, что палиндромы менее надежны, чем одиночные маркеры, но насколько?
Какой из вариантов дерева (без палиндромов, с 1, 2 или 3 палиндромами) получается наиболее надежным?
« Последнее редактирование: 09 Октябрь 2014, 06:01:10 от Белгородец »

Онлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5659
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3571/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Понятно, что палиндромы менее надежны, чем одиночные маркеры, но насколько?
Какой из вариантов дерева (без палиндромов, с 1, 2 или 3 палиндромами) получается наиболее надежным?
Вопрос не в надежности, а самой специфике мутаций в палиндромных маркерах. Есть RecLOH, дупликация, делеция. Если подобные мутации произошли в палиндромном маркере, то он может отличаться сразу на несколько шагов от обычного, но это все равно является одной мутацией. Именно поэтому я сделал возможность исключать палиндромные маркеры из расчетов. Если гаплотипы с нестандартными мутациями в палиндромных маркерах есть в вашей выборке используемой для построения дерева, то конечно же правильным будет исключить эти маркеры из расчетов.

Оффлайн Аббат Бузони

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19773
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1767/-58
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Участника 335451 уберите из группы S2078*, так как он отдалился от меня (276034, S2078*) на 15 мутаций на 37 маркерах, что уже чересчур много для дальних родственников. К тому же у этого участника пока нет результатов тестов на снипы.
Это лучше к Аббат Бузони обратиться.

Сделано. Белогорец, не всегда могу оперативно внести изменения, поэтому пишите прошу писать сюда, когда будет вопросы по гг I
http://forum.molgen.org/index.php/topic,7258.0.html

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15183
  • Страна: az
  • Рейтинг +4549/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Залогиниваюсь в Семрагл.ме, но не вижу заветной кнопочки для добавления гаплотипа в базу. Причина?

Оффлайн Панк

  • Сообщений: 1367
  • Страна: ua
  • Рейтинг +673/-1
Почему гт с Positive SNP:   Y2910,
находится в субкладе R1a-CTS3402+, Y33+, CTS8816+, Y1392+, Y2902+ (Volga-Carpathian) Ungrouped
а не R1a-CTS3402+, Y33+, CTS8816+, Y1392+, Y2902+, Y2910+ (East Volga-Carpathian) (Y2910+ or predicted +)
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/57602/

Аналогично для
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/60662/
только западная подветвь

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9369
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2669/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Почему гт с Positive SNP:   Y2910,
находится в субкладе R1a-CTS3402+, Y33+, CTS8816+, Y1392+, Y2902+ (Volga-Carpathian) Ungrouped
а не R1a-CTS3402+, Y33+, CTS8816+, Y1392+, Y2902+, Y2910+ (East Volga-Carpathian) (Y2910+ or predicted +)
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/57602/

Аналогично для
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/60662/
только западная подветвь
Потому что ветви вручную выставляются. И если было изменение в гаплотипе (новый снип, к примеру), то надо это заметить и опять вручную изменить ветвь.
Спасибо за замечание! Исправил.

Вообще, будем рады замечаниям по гаплотипам в базе Семаргла. База разрастается и не всегда успеваем реагировать на конкретные гаплотипы. Будем рады, если ваши замечания вы запостите в профильных (гаплотипных) темах/разделах. Тогда админы, отвечающие за эти гаплгруппы в базе Семаргла оперативно внесут изменения.

Онлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5659
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3571/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Почему гт с Positive SNP:   Y2910,
находится в субкладе R1a-CTS3402+, Y33+, CTS8816+, Y1392+, Y2902+ (Volga-Carpathian) Ungrouped
а не R1a-CTS3402+, Y33+, CTS8816+, Y1392+, Y2902+, Y2910+ (East Volga-Carpathian) (Y2910+ or predicted +)
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/57602/

Аналогично для
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/60662/
только западная подветвь
Я только начал разбивать ВК ветвь на подветви. Там много еще не отнесенных гаплотипов. Появится время - продолжу.

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5416
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1816/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Можно было бы попросить внести и YP418 в карты снипов на Семаргле?

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5416
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1816/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
1. Можно было бы попросить внести и YP418 в карты снипов на Семаргле?

2. И можно было заодно и попросить отобразить в Семаргле  всех позитивных на этот снип из R1a Project?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.