АвторТема: МолГен-вики  (Прочитано 46546 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн kaa76

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 632
  • Страна: ru
  • Рейтинг +215/-0
  • Y-ДНК: R-L1029
  • мтДНК: U5a2a2
Re: МолГен-вики
« Ответ #90 : 14 Июль 2011, 00:29:06 »
Филогенетическое дерево (древо) — графическое изображение хода исторического развития групп организмов с общим происхождением.

сиквенс ("черновой", отдельных фрагментов молекулы)- первичная аминокислотная или нуклеотидная последовательность ДНК (от англ. sequence — последовательность), линейное символьное описание, которое сжато поясняет атомную структуру ее молекулы.

Занёс в вики. Смотреть в категории термин (можно ткнуть в облако меток в правой панели).

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10108
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1389/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: МолГен-вики
« Ответ #91 : 14 Июль 2011, 10:14:39 »
Филогенетическое дерево (древо) — графическое изображение хода исторического развития групп организмов с общим происхождением.

в каком смысле графическое? Если в смысле, представление графом, но не обязательно картинкой - согласен. "Представление какого-либо эволюционного процесса деревом (то есть связным графом без циклов). При этом каждый узел дерева, кроме корня, имеет единственного непосредственного предшественника - своего родителя. Используется для представления эволюции видов и отдельных генов."

ИМХО здесь не должно быть ничего за пределами школьного курса.



сиквенс ("черновой", отдельных фрагментов молекулы)- первичная аминокислотная или нуклеотидная последовательность ДНК (от англ. sequence — последовательность), линейное символьное описание, которое сжато поясняет атомную структуру ее молекулы.

Три замечания. 1. Читатель может еще не представлять что такое первичная, вторичная, третичная итд структура цепи днк/белка. 2. "которое сжато поясняет атомную структуру ее молекулы" - не структуру атомов а порядок следования элементарных "звеньев" цепи - нуклеотидов. 3. Я бы добавил в конце: "Биоинформатики работают с сиквенсами как с обычными строчками в алфавите, буквами которого являются нуклеотиды (или аминокислоты)."



Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10108
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1389/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: МолГен-вики
« Ответ #92 : 14 Июль 2011, 10:24:31 »
Пара слов про то что мне жутко не нравится в стиле подачи материала у АК - который в общем непревзойденный мастер популяризации.

Он постоянно и системно избегает биологической терминологии, даже простейшей. Он лопнет но не скажет "развитие генов". Будет длиннющая и никчемнейшая лекция по поводу того с чем работает или не работает "днк-генеалогия". В итоге он настолько засрет мозг своему читателю, так тот сам не сможет внятно объяснить только окончившему школу человеку что такое эволюция генеалогических локусов.

Я настаиваю что на самом начальном этапе, при определении первых понятий нельзя отбрасывать слово "ген". Нужно настойчиво формировать интуитивное понимание слов "ген" и его вариант - "аллель" и в этих терминах объяснять все. Чтобы не было фраз вроде "Вась а Вась оказывается у китайцев нет гена перерабатывающего алкоголь!" Ну а потом уже объяснить что есть собственно гены а есть некодирующая днк, в связи с чем надо по-тихому заменить ген на "участок" или "локус".

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10108
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1389/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: МолГен-вики
« Ответ #93 : 14 Июль 2011, 10:35:42 »
Еще момент.

Надеюсь все уважаемые коллеги ясно понимают что слова "маркер" (в смысле как им у нас злоупотребляют) в Вики быть не должно?

Маркёр - термин популяционной генетики, означает просто признак чего-то. NB! Хотя словарных варианта два - с е и ё, профессиональное произношение - с Ё!

Локус - произвольный участок ДНК. Может представляться в виде нуклеотидной последовательности (сиквенса). Варианты последовательности на данном участке у разных индивидов называются аллелями (NB! "аллель" - слово мужского рода!) Можно рассматривать локусы состоящие из любого числа последовательно расположенных нуклеотидов, даже из одного.

Слово маркер в значении "локус" - калька с безграмотного словоупотребления американских генеалогов! Hi there! New to this! Here are my markers: DYZ....What does this mean? Who am I then? :) Друзья, избавляйтесь от этого пока не поздно!

Администрации даже советую подключить php-код извещающий пишущего о том что у него выскочило это страшное слово :)
« Последнее редактирование: 14 Июль 2011, 11:18:48 от Valery »

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2405
  • Рейтинг +760/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: МолГен-вики
« Ответ #94 : 14 Июль 2011, 11:38:49 »
Полагаю, что возможность избавиться от жаргонного "маркер" безвозвратно утеряна. На глазах рождается еще одно значение этого слова. Ничего не поделаешь - все пользуются термином "маркер" в значении "Y-STR локус".

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10108
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1389/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: МолГен-вики
« Ответ #95 : 14 Июль 2011, 12:15:03 »
Полагаю, что возможность избавиться от жаргонного "маркер" безвозвратно утеряна. На глазах рождается еще одно значение этого слова. Ничего не поделаешь - все пользуются термином "маркер" в значении "Y-STR локус".

Что значит "утеряна"? С дурными привычками следует бороться :)

Оффлайн kaa76

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 632
  • Страна: ru
  • Рейтинг +215/-0
  • Y-ДНК: R-L1029
  • мтДНК: U5a2a2
Re: МолГен-вики
« Ответ #96 : 14 Июль 2011, 12:59:15 »
Администрации даже советую подключить php-код извещающий пишущего о том что у него выскочило это страшное слово :)

Можно внести это слово в список плохих, в смысле матерных  ;D

Оффлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 14536
  • Страна: id
  • Рейтинг +940/-35
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: МолГен-вики
« Ответ #97 : 14 Июль 2011, 13:00:19 »
Что значит "утеряна"? С дурными привычками следует бороться :)

Вы пурист. :)

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19884
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1821/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: МолГен-вики
« Ответ #98 : 14 Июль 2011, 13:02:26 »
Тупо банить за его использование.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10108
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1389/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: МолГен-вики
« Ответ #99 : 14 Июль 2011, 13:19:19 »
Тупо банить за его использование.

угу, у меня уже есть стоп-лист для бана:

Мордовия, маркер, Анатолий Алексеевич..

И все довольны :)

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19884
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1821/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: МолГен-вики
« Ответ #100 : 14 Июль 2011, 13:29:29 »
Мордовия-то чем не угодила?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10108
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1389/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: МолГен-вики
« Ответ #101 : 14 Июль 2011, 13:40:03 »
Мордовия-то чем не угодила?


О чудо! Ты наконец уверовал что Мордовия действительно существует в реальности?  ;D

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19884
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1821/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: МолГен-вики
« Ответ #102 : 14 Июль 2011, 13:42:08 »
Валер, ты выпил? Где же я по твоему кровушку собирал?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10108
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1389/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: МолГен-вики
« Ответ #103 : 14 Июль 2011, 13:45:20 »
Где же я по твоему кровушку собирал?

Это я у тебя должен спросить )

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19884
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1821/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: МолГен-вики
« Ответ #104 : 14 Июль 2011, 13:49:37 »
Любишь ты мне периодически приписать что-то эдакое. :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.