АвторТема: Коррекция дерева J2a  (Прочитано 31225 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн kaa76

  • Сообщений: 631
  • Страна: ru
  • Рейтинг +214/-0
  • Y-ДНК: R-L1029
  • мтДНК: U5a2a2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #15 : 08 Январь 2013, 21:08:03 »
Ещё изменения:



Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #16 : 08 Январь 2013, 23:32:56 »
Как раз наше Древо и посылалось координатором проекта J2-L24 to   Т. Krahn. Почти все снипы, найденные в нашей группе по GENO2.0 приняты FT.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #17 : 11 Январь 2013, 21:11:22 »


Вроде получилось присоединить нарисованное мною Древо по GENO2.0 результатам J2-L24 (на сегодня). Анализ проводила довольно большая команда во главе с А.Абурто.

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #18 : 11 Январь 2013, 21:35:42 »
А почему L254 помечен вопросительным знаком?

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #19 : 11 Январь 2013, 21:57:36 »
Я дала именно те результаты, которые мы получили из GENO2.0. По ним  L229 и L254 у людей, которые определены в FT как +, в GENO2.0 вышли -.  У одного члена субклада L70 много возвратных мутаций. У моего мужа 171488 дополнительный снип CTS8690, который не поместили пока на Древо в FT (в его описании сначала было - найден в О-группе, сейчас указано- в О и J группах). А все остальное без натяжек.
P.S. После L590 можно дорисовать  L589, но этот человек  не тестировался в GENO2.0 (наш голландско-немецкий собрат, итак молодец - у него и нашли эти 2 снипа в WTY).

Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #20 : 11 Январь 2013, 23:24:32 »
Спасибо. Чем же тогда F659 лучше CTS8690? Его нашли в О3. То есть он не UEP, в отличие от L254.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #21 : 12 Январь 2013, 09:35:12 »
Да я не знаю, по какой причине CTS8690 не нанесли. Может быть потому, что пока не известно точное его нахождение, он может быть и на шаг ниже - в L590 L589.  Спасибо, что указали про F659, я не знала. что он тоже в О группе.
Это вопросы к Томасу, как видите, на свою схему я нанесла все. Может быть оба эти маркеры ненадежны, увидим.

Сегодня Chris R. прислал ссылку - неожиланные результаты для L26: Z2221+ Z2227-
http://figshare.com/articles/J2a_M410_subclades_and_clusters_overview/106387
« Последнее редактирование: 12 Январь 2013, 09:42:00 от Людмила »

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #22 : 12 Январь 2013, 21:18:25 »
 Спросила у Томаса о CTS8690. Тут же получила ответ -

There was no special reason. I just can't keep up with all the changes
that are coming in.
In fact I guess that CTS8690 is more stable than F659 and I have ordered
primers for both markers to find out.

Сейчас вижу, этот снип уже и на его Древе.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #23 : 12 Январь 2013, 23:15:26 »

Дорисовала L589, возможные позиции CTS8690, F659 и нового члена L70.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #24 : 18 Январь 2013, 08:36:34 »

Изменение положения снипа PF7437 - он общий для L70 группы.
Добавлены новые члены в L70 и L254.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #25 : 21 Январь 2013, 08:33:03 »


Исправлены собственные ошибки относительно представителя  L70 с наибольшим количеством мутаций. Обратных несколько поубавилось. Часть новых перешла в ранее определенные.

Оффлайн kaa76

  • Сообщений: 631
  • Страна: ru
  • Рейтинг +214/-0
  • Y-ДНК: R-L1029
  • мтДНК: U5a2a2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #26 : 02 Февраль 2013, 23:36:49 »

Насколько я знаю, если FTDNA помещает SNP в черновик - они почти готовы этот SNP запустить в продажу.





Оффлайн JaG

  • Сообщений: 504
  • Страна: fm
  • Рейтинг +131/-0
  • Y-ДНК: J2a-L556 (Y13511+)
  • мтДНК: H5c2
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #27 : 03 Февраль 2013, 00:06:22 »
Критерии, по которым Томас решает добавлять ли тот или иной снип на дерево и в какой позиции, мне не суждено понять  ???

А наивные клиенты снова поведутся на мусорный снип  >:(

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #28 : 08 Февраль 2013, 00:21:35 »
Добавился еще 1 снип на нашем Древе, в кластере "Cohen" - F3515. Он также найден в гаплогруппе О3, поэтому еще требует подтверждения.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 1007
  • Рейтинг +151/-1
Re: Коррекция дерева J2a
« Ответ #29 : 12 Февраль 2013, 22:42:43 »

Внутри кластера PF5366+PF5368+ нашлась новая ветвь с 11 новыми снипами-PF5348 PF5350 PF5351 PF5357 PF5367 PF5380 PF5381 PF5389 PF5390 PF5400 PF5402

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.