Ветвь N-CTS10760 (xVL29)

[Nimissin]

В работе Karmin et al (2015) опубликован гаплотип из новой ветви в составе N-L392. Он имеет мутацию CTS10760, которая есть также у всех VL29+, но не имеет самой мутации VL29. Таким образом, гаплотип образует новую ветвь N-CTS10760 (xVL29). Авторы почему-то маркируют новую ветвь мутацией F4134, хотя она первоначально была открыта фуданьцами в гаплогруппе O3.
Донор образца - русский из Пинеги. 

[mouglley]

Спасибо.
Очень интересно с точки зрения возможного маршрута попадания VL29 в Европу. Надо подождать ещё результатов ребяток  N1с-CTS10760(xVL29) и тогда можно будет переименовывать вторую основную европейскую ветку N1c.
Знать бы ещё СТР этого донора, тогда бы можно было бы рекомендовать кому-то пройти тест на этот снип.

[Nimissin]

К статье приложены STR гаплотипы.

[mouglley]

11-ти маркерный для образца 14416?
К сожалению, для меня он малоинформативен.

[Nimissin]

STR гаплотипы 23-маркерные.

[Nimissin]

Исчезли посты по гаплотипу ФТДНА 321007. В рабочие дни не успел посмотреть имеющиеся данные. Ветвь N-CTS10760 (xVL29), по-видимому, редкая. Кроме того, ее гаплотипы достаточно трудно отличить от других гаплотипов ветви N-L1026 по 17-23 маркерам научных выборок. Без типирования на молодые мутации не обойтись. Пока можно провести только сравнение с образцом русского из Пинеги (14416) из работы Karmin et al (2015). В последовательности 23 локусов (19, 389I, 389II, 390, 391, 392, 393, 385a,b, 438, 439, 437, 448, 456, 458, 635, H4, 481, 533, 549, 570, 576, 643) образец 14416 имеет следующие значения тандемных повторов:

14-14-30-23-11-14-14-11,13-10-10-14-19-15-17-22-12(11)-20-11-11-19-17-11.

Образец 321007 можно сравнивать по 19 локусам:

14-14-30-23-11-14-14-12,13-10-10-14-19-15-16-X-12(11)-20-X-X-20-17-X.

Отличие в 3 локусах из 19-ти. Это около 800 лет до ближайшего общего предка.

[Месут]

Получается N1c в Европе расходится на две большие ветки: N-CTS10760 (в т.ч. VL29) и N-Z1936. Казалось бы, эти две ветки должны быть ближе между собой чем другие, не европейские. Но сугубо азиатские ветки B197 (Чукотка, Сибирь, Монголия) и B479 (Дальний Восток) образуют с Z1936 сестринскую к CTS10760 ветку. Фантастика! Но если присмотреться то увидим 4800 лет расхождения у всех этих четырех веток, расположенных, казалось бы, на разных уровнях. Значит разошлись эти ветки не западнее района совр. Алтая, Тувы, Прибайкалья, Забайкалья

[guanchzhou]

Я из ветки CTS10760 (xVL29) -> Y28526 -> Y32731 -> Y192174. Из совпаденцев один из Коми, два из Перми, один из Швеции.