Субклад Q1b-L275 и нисходящие субклады (новости проекта)

[Шад]

Q1b или Q-М378 - это редкий субклад гаплогруппы Q.
На филогенетическом древе Q1b предшествует Q1-P36.2, которому в свою очередь предшествует непосредственно материская гаплогруппа Q (М242).
То есть для того, что идентифицировать человека в качестве имеющего субклад Q1b, необходимо, чтобы у него был положительный результат по трем снипам (SNP) М242+, P36.2+, М378+. Хотя в большинстве случаев, субклад достаточно точно прогнозируется по STR-маркерам, а тесты на снипы делаются в случае необходимости (такая возможность предусмотрена на FTDNA).
В свою очередь субклад Q1b делится на три субклада, которым соответствуют SNP-мутации L245, L272, L315.

Происхождение Q1b достаточно загадочно и относительно его имеются достаточно противоречивые версии. Собственно обсуждению этого вопроса и будет посвящена эта тема форума. В качестве единственного (пока) представителя Q1b на форуме я обобщу здесь всю доступную информацию по данному вопросу. Надеюсь, что будет интересное обсуждение.

Полезная информация о изучении (обсуждении) Q1b.
Ссылки на проекты FTDNA, в которых присутствуют гаплотипы Q1b:
http://www.familytreedna.com/public/yDNA_Q/   - для всех Q, имеется несколько разделов с Q1b;
http://www.familytreedna.com/public/Jewish_Q/ - для евреев с гаплогруппой Q
http://www.familytreedna.com/public/AshinaRoyalDynasty/ - для тех, кто считает Q1b гаплгруппой потомков древнетюркского рода Ашины, правящей динатии Тюркутского и Хазарского кагантов
http://www.familytreedna.com/public/Turkic/ - для тех, кто просто ищет тюркские корни гаплогруппы Q
http://www.familytreedna.com/public/russiadna/ - для всех, чьи предки жили на территории современной России, СССР и Российской империи (для Q это также подходит)

Для владеющих английским: Ashkenazi-Q. Это группа на Yahoo Groups, объединяющая ашкеназов с соответствующей гаплогруппой. (Простите за тавтологию).

[VVR]

То есть для того, что идентифицировать человека в качестве имеющего субклад Q1b, необходимо, чтобы у него был положительный результат по трем снипам (SNP) М242+, P36.2+, М378+. Хотя в большинстве случаев, субклад достаточно точно прогнозируется по STR-маркерам, а тесты на снипы делаются в случае необходимости (такая возможность предусмотрена на FTDNA).

Не совсем точно. Дерево гаплогрупп меняется. М378+ это на данный момент Q1b1. Чтобы идентифицировать человека как Q1b вполне достаточно одного снипа. На данный момент это L275+ или L314+. Естественно, все предшествующие по дереву снипы у него тоже должны быть. И не только Q1 и Q, но и Р,К,IJK,F,CF(xDE),CF и BT. Всего я насчитал 72 снипа для Q1b*(на данный момент).
Дерево гаплогруппы Q - http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpQ.html

[napobo3]

Два моих Серебряных из проекта Балановских - тоже Q1b1-М378+ (по предиктору).
http://genofond.ru/default3.aspx?s=0&p=549
http://www.ysearch.org/search_view.asp?uid=K2SZY&viewuid=K2SZY&p=0
http://www.ysearch.org/search_view.asp?uid=TZZ3V&viewuid=TZZ3V&p=0

[Шад]

Интересно, что все Q1b имеют DYS495 равный нулю. (Примечание: в первоначальном тексте допущена описка, правильно - DYS425).

Ниже ссылка на посвященную этому обстоятельству статью: http://www.jogg.info/51/files/Rein.htm

Данный эффект происходит при рекомбинации ДНК и называется RecLOH (recombinational loss of heterosygosity). Этот признак наследуется потомками. Несмотря на отклонение от генетической нормы никаких патологий, связанных с нулевым значением не выявлено.

Кроме Q1b такой "сбой" (делеция) наблюдается  Е1b1, I1, I2, H1, G2a, G2c, J2, J2 и R1b1. Есть соответствующий проект на FTDNA http://www.familytreedna.com/public/null425/ где присутствуют перечисленные гаплотипы.

[Аббат Бузони]

Я удивился когда увидел у Panshin (I1) DYS511=0 интересно, как у других гг с этим маркером.

[Шад]

То есть для того, что идентифицировать человека в качестве имеющего субклад Q1b, необходимо, чтобы у него был положительный результат по трем снипам (SNP) М242+, P36.2+, М378+. Хотя в большинстве случаев, субклад достаточно точно прогнозируется по STR-маркерам, а тесты на снипы делаются в случае необходимости (такая возможность предусмотрена на FTDNA).

Не совсем точно. Дерево гаплогрупп меняется. М378+ это на данный момент Q1b1. Чтобы идентифицировать человека как Q1b вполне достаточно одного снипа. На данный момент это L275+ или L314+. Естественно, все предшествующие по дереву снипы у него тоже должны быть. И не только Q1 и Q, но и Р,К,IJK,F,CF(xDE),CF и BT. Всего я насчитал 72 снипа для Q1b*(на данный момент).
Дерево гаплогруппы Q - http://www.isogg.org/tree/ISOGG_HapgrpQ.html

Спасибо за замечание. Это действительно так.
Но на FTDNA пока используется более старая версия дерева YCC (The Y Chromosome Consortium). Так имея L245+ я у них обозначен как Q1b1. А по ISOGG 2011 я должен быть Q1b1a.
Думаю, что в ближайшее время эта коллизия разрешится.

Кстати, сейчас ожидаю завершения тестов по снипам L272 и L315. Снип L272 зафиксирован в Италии (Сицилия), L315 характерен для группы ашкеназов, имевших общего предка в пределах 500 лет.

[Овод]

Интересно, что все Q1b имеют DYS495 равный нулю.

Поправка - DYS425.

[Шад]

Интересно, что все Q1b имеют DYS495 равный нулю.

Поправка - DYS425.

Спасибо. Поправка принята. Действительно DYS425. Зарапортовался:)

[wertner]

Кроме Q1b такой "сбой" наблюдается  Е1b1, I1, I2, H1, G2a, G2c, J2, J2 и R1b1. Есть соответствующий проект на FTDNA http://www.familytreedna.com/public/null425/ где присутствуют перечисленные гаплотипы.

Все E1b1b1-M35 имеют делецию в DYS 425.
Иногда появляются гаплотипы E1b1b1 с DYS 425 = 12, но после перепроверки у них тоже становится DYS 425 = 0.

[Шад]

22.05. 148637- Q1b1a*(Польша) - снипов не обнаружено
25.05. 172625-Q1b1(Европа-?)-не обнаружено
2.06.  138817-Q1b1a(Латвия)-не обнаружено

Последние новости по снипам из WTI. К сожалению, у участников проекта с Q1b новых снипов не обнаружено:(

[Шад]

Считаю необходимым разместить в этой теме ссылки на обсуждение в другой ветви форума работы китайских исследователей (Zhong et al.), в которой представлены данные по генотипам уйгуров из Синьцзяна.
 
Extended Y-chromosome investigation suggests post-Glacial migrations of modern humans into East Asia via the northern route (обзор)

По следующей ссылке можно найти полный текст работы и комментарий уважаемого JaG

Полный текст с прилагаемым табличным материалом:
1) Текст.
2) Table S1: Populations sampled in this study and those from the literature.
3) Table S2: Distribution of Y-chromosome haplogroups in all the populations.
4) Справочник по маркерам.

Обсуждение.
Мой комментарий (http://forum.molgen.org/index.php/topic,1853.msg88717.html#msg88717):

В таблице (Table S2d: Distribution of Y-chromosome haplogroups in all the populations) действительно указаны два уйгура из Синьцзяна (по материалам данного исследования) и два генотипа по данным Сенупты (Sengupta, 2006) - из пакистанских провинций Синд и Хазаристан (1 из 21 и 1 из 25 соответственно).
Может я не прав (поправьте), но именно единственное (?) исследование Сенгупты с такой малорепрезентативной выборкой легло в основу статьи в Википедии о распространенности Q1b среди синдхов и хазарейцев.
Мне сложно сказать, кого тестировал Сенгупта и Ко, но на проектах FTDNA есть представители Q1b, указывающие место происхождения из Средней Азии (!), Индии и Пакистана. Таким образом, учитывая незначительный процент Q1b, в выборках это подтверждает скорее выход представителей этой группы из Центральной Азии в Пакистан/Индию , а не местное происхождение. Тем более, что по одному пакистанцу эта информация подтверждена семейным преданием (его предок прибыл в на территорию современного Пакистана из Бухары).  Средняя Азия в 6-7 веках контролировалась тюрками (Тюркский каганат), потомки которых могли попасть в Индию и в тот период, и позже - с Газневидами и монголами (к войскам которых присоединились представители многих народов). Поэтому я бы не спешил исключать тюрское происхождение Q1b.

Вывод JaG (http://forum.molgen.org/index.php/topic,1853.msg88838.html#msg88838) также воспроизвожу полностью

"пока не найдены ни одна этническая группа или географическая область, где бы Q1b была среди основных гаплогрупп, а не в категории "прочие".
По известным мне данным (включая эту работу) в Южной Сибири, Саяно-Алтае, Монголии, Северном Китае Q1b отсутствует. Т.е. в ядре ранних тюрок ее, очевидно, не было.
В регионах со значительным присутствием субкладов Q1a ее нет, т.е. они разошлись давно и не контактировали, в экспансии в Северо-восточную Азию, а затем и в Америку, в Ледниковый период и позже, Q1b не участвовала.
Спорадическое присутствие на большой территории тюркскими миграциями объяснить невозможно, особенно на фоне N1b и Q1a2, которые достаточно надежно к этим миграциям "привязываются". Конечно, Q1b могли быть ими подхвачены и разбросаны, но об интеграции в какой-либо тюркский этнос свидетельств нет.
Мне это напоминает ситуацию с L*,L1,L2 - не ясен исходный регион и процессы распространения. Возможно, будущие данные по Узбекистану, Таджикистану, Афганистану, а также более глубокие исследования в Пакистане и Северной Индии, укажут на исходный регион Q1b.

[Шад]

Ссылка на исследование Polarity and Temporality of High-Resolution Y-Chromosome Distributions in India Identify Both Indigenous and Exogenous Expansions and Reveal Minor Genetic Influence of Central Asian Pastoralists (2006) Sengupta et al.

http://forum.molgen.org/index.php/topic,2626.0.html

Эта работа интересна тем, что в ней впервые зафиксированы два гаплотипа со снипом M378 (правда в тексте опечатка и М378 назван Q1a. По выборке в Пакистане n=176 зафиксировано 2 гаплотипа (1,14%). По выборкам Индии (n=728) и Восточной Азии (n=175) не зафиксировано ни одного гаплотипа со снипом М378. Именно эти данные цитируются в Википедии (в статье про гаплогруппу Q) и в китайском исследовании Extended Y-chromosome investigation suggests post-Glacial migrations of modern humans into East Asia via the northern route.

[Centurion]

правда в тексте опечатка и М378 назван Q1a

Не опечатка. Просто в 2006 г., когда вышла статья была другая номенклатура ГГ.

[wertner]

Шад, если еще не видели, то обязательно посмотрите сайт ISOGG: http://www.isogg.org/tree
Там самая свежая классификация гаплогрупп и история номенклатуры с 2006 года. Помогает при чтении старых статей.

[Шад]

Шад, если еще не видели, то обязательно посмотрите сайт ISOGG: http://www.isogg.org/tree
Там самая свежая классификация гаплогрупп и история номенклатуры с 2006 года. Помогает при чтении старых статей.

Спасибо. Увидел.
До 2008 года М378 обозначалось как Q1a.