АвторТема: Субклад Q1b-L275 и нисходящие субклады (новости проекта)  (Прочитано 85062 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7124
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #180 : 05 Август 2012, 19:22:20 »
Мне, вообще, с самого начала, понравился подход уважаемого DMXX к исследованиям.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #181 : 05 Август 2012, 22:30:41 »
Мне, вообще, с самого начала, понравился подход уважаемого DMXX к исследованиям.

В его блоге много интересного. Жаль, что только сегодня обратил внимание - на англоязычном МолГене тема про его исследования обсуждается давно: http://eng.molgen.org/viewtopic.php?f=3&t=174

Оффлайн Робот Вертнера

  • Сообщений: 8623
  • Страна: ru
  • Рейтинг +150/-0
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #182 : 27 Август 2012, 04:29:07 »
Новый сосед участника проекта; по 37 маркерам; участник Q; Q1b; Mansyrev; Russian Federation; 182773 219847 230429 197154 теперь на расстоянии 1 от Q; Q1b; Syundyukov; Russian Federation; 230426

Оффлайн Valikhan

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 2194
  • Страна: kz
  • Рейтинг +102/-1
  • Ysearch 63CDM. Mitosearch EEVT3
    • Turkic World
  • Y-ДНК: N1c1d1 - L1034 (L1032, L1033)
  • мтДНК: B5a1a
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #183 : 28 Август 2012, 07:35:22 »
Интересный гаплотип 185660 жалайыр 14 22 13 10 12-17 11 12 12 14 14 31
Предиктор Урасина относит его к T1b 60%, но ему подтвердили снипом M242 Q. Скорее всего Q1b.
M242+, L275-
Сюрприз.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #184 : 28 Август 2012, 08:09:09 »
Интересный гаплотип 185660 жалайыр 14 22 13 10 12-17 11 12 12 14 14 31
Предиктор Урасина относит его к T1b 60%, но ему подтвердили снипом M242 Q. Скорее всего Q1b.
M242+, L275-
Сюрприз.

Ну почему же? Я как-то изначально в Q1b при таком гаплотипе не сильно верил.
Следующий снип - за вами:)
« Последнее редактирование: 28 Август 2012, 09:01:56 от Шад »

Оффлайн Valikhan

  • Группа N
  • *
  • Сообщений: 2194
  • Страна: kz
  • Рейтинг +102/-1
  • Ysearch 63CDM. Mitosearch EEVT3
    • Turkic World
  • Y-ДНК: N1c1d1 - L1034 (L1032, L1033)
  • мтДНК: B5a1a
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #185 : 28 Август 2012, 12:55:52 »
Интересный гаплотип 185660 жалайыр 14 22 13 10 12-17 11 12 12 14 14 31
Предиктор Урасина относит его к T1b 60%, но ему подтвердили снипом M242 Q. Скорее всего Q1b.
M242+, L275-
Сюрприз.

Ну почему же? Я как-то изначально в Q1b при таком гаплотипе не сильно верил.
Следующий снип - за вами:)
На Q1a он тоже как-то не похож.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #186 : 31 Август 2012, 19:01:39 »
Субклад Q1b, Q1b1a; Luigi D'Orazio, b.a. 1770  Serramonacesca, Italy; Italy; 237760 (на расстоянии 15 от Q1; Q1b; Silver; Russian Federation; 70579)

Darazio попадает в кластер Сentral Europe (CE). DYS395S=15-17

Оффлайн Робот Вертнера

  • Сообщений: 8623
  • Страна: ru
  • Рейтинг +150/-0
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #187 : 12 Октябрь 2012, 21:27:40 »
Новый гаплотип или маркеры; 111 маркеров; Q1b1; Q1b; Abdullin; Kazakhstan; 193005 (на расстоянии 40 от Q1b1a; Q1b; Shockey; Switzerland; 115454)

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #188 : 23 Октябрь 2012, 23:05:33 »
Продолжаю уточнение дерева Q1b.
По ходу обсуждения решил сделать некоторые обощения:

Теоретически можно оттолкнуться от ВБОП ашкеназов... Но это будет явная подгонка под заведомо ожидаемый результат.
Наиболее вероятный возраст узла -  1100 лет+/50 лет. Но это привязка к дате начала распада Хазарского каганата. Версия наиболее вероятная, но не бесспорная.
Хотелось бы не делать подгонку под эту дату, а откалибровав Ро на других данных ее проверить.
Для Ро=165* (последняя версия дерева) получаем начало ашкеназской ветви на 1500 yo. То ли это погрешности филогении, то ли ошибочное Ро, то ли указание на наличие предка, жившего до исторической эпохи каганата в Персии или степях Евразии (в зависимости от того какую версию происхождения иудейских Q1b в каганате мы предпочтем)... 

Вторая "интересная" точка - это ответвление на будущую ашкеназскую ветвь и ветвь берберских евреев, которая уже представлена несколькими гаплотипами. Можно конечно допустить, что религия связала эти гаплотипы случайно, но можно и предположить наличие общего предка.
Для Ро=165* этот узел находится на глубине 3,6 kyo. Получается что-то сходящееся к временам Исхода. Что опять таки похоже на правду.
Интересно, что на этом же узле находится несколько гаплотипов арабов и армян. А чуть раньше его на 300 лет глубже - гаплотипы иракских арабов и дагестанских Q1b. Причем я предполагаю, что иракские арабы это выходцы из племен болотных арабов.
Общий возраст дерева получился 5,3 kyo. От корня отдельно (и раздельно) уходят ветви индо-пакистанцев, казахов,  татарских мурз Бутакидов. А также уже упомянутые швейцарцы.
Итого - корень дерева Q1b оказался в 4 тысячелетии до нашей эры. В очень интересный диапазон дат:
Цитировать
3761 год до н. э. — дата сотворения мира по иудейскому календарю.
3182 год до н. э. — дата сотворения мира по исламскому календарю.
В полночь 23 января 3102 года до н. э. началась Кали-юга.
Можно по разному относиться к хронологии, но схождение важных дат в таком относительно узком диапазоне что-то явно означает.
Полагаю, что начальная точка расселения Q1b связана с Южным Ираком - Месопотамией. С какой из этнических групп она была связана - сложно сказать. Междуречье - это такой перекресток исторических путей, что ни одна из версий появления Q1b в Хазарском каганате не опровергается. Это могли быть семиты, а могли быть шумеры. Могли быть и кутии.

Короче из всего клубка связанных с Q1b исторических загадок самыми загадочными выглядят швейцарцы. Являясь самыми близкими к предковым Q1b1a-L245 они в итоге оказались в центре Европы.

________________________
* Ро=165 это среднее арифметическое между двумя рекомендациями: уважаемого VVR и уважаемого Valery. Абсолютно ненаучный метод определения Ро, но лучшего я пока не придумал:)

Оффлайн Робот Вертнера

  • Сообщений: 8623
  • Страна: ru
  • Рейтинг +150/-0
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #189 : 20 Ноябрь 2012, 18:38:03 »
Новый сосед участника проекта; по 37 маркерам; участник Q1b1a; Q1b; Michelson; Lithuania; QS4JZ 115493 теперь на расстоянии 4 от Q; Q1b; Abraham Fearer; Lithuania; 253178

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #190 : 30 Ноябрь 2012, 22:38:16 »
Интересный гаплотип 185660 жалайыр 14 22 13 10 12-17 11 12 12 14 14 31
Предиктор Урасина относит его к T1b 60%, но ему подтвердили снипом M242 Q. Скорее всего Q1b.
M242+, L275-
Сюрприз.

Ну почему же? Я как-то изначально в Q1b при таком гаплотипе не сильно верил.
Следующий снип - за вами:)
На Q1a он тоже как-то не похож.

А он не может иметь дунганское происхождение? У дунган 7,5% Q1a1
См.: http://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_Q-M120_(Y-DNA

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #191 : 06 Декабрь 2012, 00:22:00 »
Y-chromosome variation in Tajiks and Iranians // Annals of Human Biology, Posted online on November 30, 2012. (doi:10.3109/03014460.2012.747628)

Malyarchuk et al.

High genetic diversity was observed in the populations studied. Six of 12 haplogroups were common in Persians, Kurds and Tajiks, but only three haplogroups (G-M201, J-12f2 and L-M20) were the most frequent in all populations, comprising together  60% of the Y-chromosomes in the pooled data set. Analysis of genetic distances between Y-STR haplotypes revealed that the Kurds showed a great distance to the Iranian-speaking populations of Iran, Afghanistan and Tajikistan. The presence of Indian-specific haplogroups L-M20, H1-M52 and R2a-M124 in both Tajik samples from Afghanistan and Tajikistan demonstrates an apparent genetic affinity between Tajiks from these two regions.

http://informahealthcare.com/doi/abs/10.3109/03014460.2012.747628



Злюсь когда в очередной раз вижу Q-M242. По информативности это аналогично R-M207:)

Пришлось добыть табличку с STR-маркерами от Malyarchuk et al.

Получается вот что.
Персияне
Q-L275
Q-L275
Q-L275
Таджики
Q-M346 (L53-)?
Q-M25?

Совпаденцы перса (образец № 1 по таблице): http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50174/
Собственно сам Persian 1: http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/50174/

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #192 : 26 Январь 2013, 00:25:59 »
Хазареец Q1b-M378

Цитировать
Хазарейцы как народ произошел от монгольских отрядов, которые остались в Афганистане. Согласно Рашид ад-Дину Никудерийская орда возникает не из чагатайских, а из джучидских отрядов Бату и Орды, также находившихся в армии Хулагу. В 1262 г. из-за конфликта между Берке-ханом и Хулагу джучиды в хулагидской армии оказались под угрозой уничтожения. Часть из них прорвалась на север к Берке, часть ушла к мамлюкам на запад, а часть, спасаясь от преследований, ушла на восток – в Хорасан. Здесь они заняли области от Газны до Мултана и Лахора. Имя старшего амира джучидов было Никудер [1]. Основываясь на том, что именно потомки Орда-эджена именовали себя царями Газны и Бамиана (хотя фактически не контролировали данные территории), можно предположить, что хазарейцы и их предки некудерийцы были потомками тумена Кули, сына Орда-эджена. Как мы знаем в походе Хулагу в Иран участвовали три тумена от джучидов: Тутар, сын Мингкадара, сын Бувала, сына Джучи во главе тумена от Западного крыла улуса Джучи, Балакан, сын Шибана, сына Джучи, во главе тумена от центра улуса Джучи и Кули, сын Орда-эджена, от восточного крыла улуса Джучи. В тумен Кули входили помимо войск улуса Орда-эджена, войска улусов Тука-Тимура, Шингкума, Сингкума и Удура, которые входили в Восточное крыло улуса Джучи. Говоря простым языком, хазарейцы являются мини-копией населения восточного крыла улуса Джучи 13 века.

Сами хазарейцы называют себя "хазара", от персидского "тысяча". Говоря о современных хазарейцах, мы хотели бы отметить, что хазарейцы - ираноязычные шииты монгольского происхождения, населяющие центральный Афганистан (по различным данным 8-10 % от общей численности населения страны, что примерно равно от 2,8 до 3,8 миллионов хазарейцев, живущих в Афганистане). Наиболее крупные племена хазарейцев такие, как джунгури, проживают на обширной территории западных районов — Хазариджате (Центральный Афганистан), в южной части страны (Узурган), на севере (племя данкундов), северо-востоке (данвали, як-ауланги, шейх-али) и на востоке (бехсуд)
Подробнее: http://turan.info/forum/showpost.php?p=124031&postcount=1

Совпаденцы по базе Семаргла: http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50424/
Ашкеназов много, так как маркеров мало. И на таком количестве все совпаденцы:)
Поэтому обращаю внимание на таки совпаденцев внутри региона:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/47961/ Behram Bashir Khan
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/42209/ Al Hasnawi
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/49531/ пуштун с Haber, 2012 sample code 75, 80
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/49527/ таджик с Haber, 2012 sample code 61
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/5338/ Suraj Bhan Singh Gurgoan, India India (RAJPUT CASTE oral tradition)

Итого. Хазарейцы Q1b как минимум представители большой региональной миграции. Возможно, не сводящейся к тысяче Чингисхана, так как она рассеяна по многим центрально-азиатским популяциям.

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #193 : 27 Январь 2013, 19:27:52 »
Продолжение по мотивам данных Малярчука.
Однозначно все три иранских перса попадают к Q1b-L275, распространенной от Аравии до Индии. К сожалению, по 12 маркерам очень сложно определить субклад, так как даже L245+ и L245- весьма схожи по филогении.
Пока можно достаточно уверенно сказать, что это Q1b-L275...
См. совпаденцев:
# 1 http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50174/
Обращает на себя внимание exact match с Розенблатом (218444 Rosenblat) и расхождение на одном маркере с 193005 Addullin
#22 http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50433/
exact match with 158843 Joseph, на одном маркере опять 193005 Addullin
Интересно, что на двух маркерах совпаденец аварец из коллекции образцов Балановских.
#49 http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50432/
Тут вблизи никого нет. На 2 и 3 маркерах соответственно Chopra и Arif Khan Akhunzada.

Что касается таджиков из той же работы, то они столь же ожидаемо отнеслись к Q1a3. Опять же  без близких совпаденцев даже на 12 маркерах. Скорее всего имеем дело с пока не попавшими в коммерческие базы нативными центральноазиатскими ветвями.
#24 http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50435/
#31 http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50434/
Для сравнения таджик из Haber et al (2012)
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/49527/
явно принадлежит к Q1b-L275. В ближайших совпаденцах - пуштуны Q1b, ашкеназы и иранские-иракские Q1b.

Ребекка Канада воздержалась от комментариев по поводу TMRCA еврейского кластера Q1b и центральноазиатских и индийских Q1b. Сказала, что ждет обновления дерева снипов.
Цитировать
I am waiting for the new YCC tree so that we may do better TMRCA with SNPs and not STRs.

Хотя в свете истории с L342 у меня уже возникают сомнения в адекватности придания снипам решающего веса над СТР-маркерами в филогенетических построениях. Конечно все верно. Но только если снип надёжен:) Где гарантия, что L245 надёжен? Если нет, то казахские Q1b могут вернуться в L245+ (вернее в составе другого более точного снипа), что более соответствует филогении по СТР-маркерам. Хотя возможно это просто гомоплазия... которая часто случается на 12  маркерах в других гаплогруппах.
В любом случае, персидские Q1b будут как минимум M378 (xL245). То есть ближайшими родственниками Аскара.
« Последнее редактирование: 27 Январь 2013, 22:43:21 от Шад »

Оффлайн ШадАвтор темы

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6316
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1275/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Q1b (проект Ашина)
« Ответ #194 : 02 Февраль 2013, 22:45:21 »
Y-Chromosome and mtDNA Genetics Reveal Significant Contrasts in Affinities of Modern Middle Eastern Populations with European and African Populations

Badro et al., 2013
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0054616

Цитировать
Abstract

The Middle East was a funnel of human expansion out of Africa, a staging area for the Neolithic Agricultural Revolution, and the home to some of the earliest world empires. Post LGM expansions into the region and subsequent population movements created a striking genetic mosaic with distinct sex-based genetic differentiation. While prior studies have examined the mtDNA and Y-chromosome contrast in focal populations in the Middle East, none have undertaken a broad-spectrum survey including North and sub-Saharan Africa, Europe, and Middle Eastern populations. In this study 5,174 mtDNA and 4,658 Y-chromosome samples were investigated using PCA, MDS, mean-linkage clustering, AMOVA, and Fisher exact tests of FST's, RST's, and haplogroup frequencies. Geographic differentiation in affinities of Middle Eastern populations with Africa and Europe showed distinct contrasts between mtDNA and Y-chromosome data. Specifically, Lebanon's mtDNA shows a very strong association to Europe, while Yemen shows very strong affinity with Egypt and North and East Africa. Previous Y-chromosome results showed a Levantine coastal-inland contrast marked by J1 and J2, and a very strong North African component was evident throughout the Middle East. Neither of these patterns were observed in the mtDNA. While J2 has penetrated into Europe, the pattern of Y-chromosome diversity in Lebanon does not show the widespread affinities with Europe indicated by the mtDNA data. Lastly, while each population shows evidence of connections with expansions that now define the Middle East, Africa, and Europe, many of the populations in the Middle East show distinctive mtDNA and Y-haplogroup characteristics that indicate long standing settlement with relatively little impact from and movement into other populations.

Citation: Badro DA, Douaihy B, Haber M, Youhanna SC, Salloum A, et al. (2013) Y-Chromosome and mtDNA Genetics Reveal Significant Contrasts in Affinities of Modern Middle Eastern Populations with European and African Populations. PLoS ONE 8(1): e54616. doi:10.1371/journal.pone.0054616

Editor: David Caramelli, University of Florence, Italy

Received: June 21, 2012; Accepted: December 13, 2012; Published: January 30, 2013

Статья в открытом доступе. Можно скачать табличку с Y-STR.

Странно, что на эту работу вообще не обратили внимание. Она интересна тем, что содержит беспрецедентный по объему свод данных по некоторым популяциям Европы, Северной Африки и Ближнего Востока.

Q1b зафиксировано у трех словаков:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/50452/
Petrejcikova E, Sotak M, Bernasovska J, Bernasovsky I, Rebala K, et al. (2011) Allele frequencies and population data for 11 Y-chromosome STRs in samples from Eastern Slovakia. Forensic science international Genetics 5: e53–62.
H004 H005 H006
Полагаю, что это словаки, имеющие предка по мужской линии - ашкеназа. Не доказуемый факт на 10 маркерах. Но самое логичное объяснение.
Совпаденцы:
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50452/

у трех турков (это старые данные "Excavating Y-chromosome haplotype strata in Anatolia" (2003) Cengiz Cinniog˘lu et al, №337-339)
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/kit/44999/
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/44999/
Тут ничего нового. Эти образцы были ещё в августе 2011 года идентифицированы мною как Q1b.
http://forum.molgen.org/index.php/topic,2546.msg98387.html#msg98387
Образцы относятся к Центрально-Анатолийскому и Восточно-Анатолийскому регионам. И предположительно ассоциируются с тюрками-афшарами.

сириец, два ливанца и четыре иорданца.
Судя по близости гаплотипов это один генетический массив. Тем более и территориальный разброс минимален.
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50454/          сириец
http://www.semargl.me/ru/dna/ydna/nearest-neighbors/50456/          ливанец
Обращает на себя внимание близость к этим гаплотипам достаточно широкого списка Q1b имеющих армянское (из Турции) происхождение (178717 Corlu), либо принадлежащих к сефардским общинам Ближнего Востока и Северной Африки. Оговорюсь, что близость на 10 маркерах дает большую почву для предположений, чем для гипотез. Но пока определённых выводов из ближневосточных данных по Q1b у меня нет.
Хотя их редкость на Ближнем Востоке скорее свидетельствует о заносе их с Востока, нежели об автохтонности. Но для такого ответственного вывода слишком мало материала.
« Последнее редактирование: 02 Февраль 2013, 22:52:51 от Шад »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.