Проект Magnus Ducatus Lituaniae

[I2a1a]

Вообщем, если кому-либо известны подходящие кандидаты,

Есть человек, у которого дедушка (т.е. 1/4 генов) происходит из Волковысского уезда (и все предки этого дедушки оттуда же; документально проверено до 1790-х). Кит на этого человека в настоящий момент находится на пути в 23andme (отправлен 3 дня назад). Или нужен человек, все предки которого из изучаемой местности?

Отлично, у меня бабушка происходит из Волковысского уезда.
Обязательно подключю его к проекту.

[I2a1a]

Проекту требуются помощь программистов.
Необходимо конвертировать данные из форматов HapMap, HGDP, форматов данных использованных в статье Бехара.

[I2a1a]

Ув.форумчане,

Я знаю что среди Вас есть весьма опытные программисты.
Нужна помощь в обработке больших текстовых файлов размером 200-400 мегабайтов (это генотипы из статьи Бехара) и трансформации их в заданный формат ped (спецификацию сообщу позже).
Задачу можно решить методом string parsing  c помощью средств языков C, Perl, Python или каким-нибудь shell-скриптом (команды awk,sed,sort,join).

[mladshij]

Отлично, у меня бабушка происходит из Волковысского уезда.
Обязательно подключю его к проекту.

Ну тогда, как вам данные понадобятся - пишите мне. Вышлю (если к тому времени 23andme уже успеют всё сделать).

[Людмила]

I2a2a
Ответьте, пожалуйста, возьмете ли в проект данные человека, как я уже писала, с происхождением из Полоцкого воеводства (пока известно до 1724 г.), однофамильцы с более глубокой родословной- Литва. У меня сейчас заказан  один тест  23andme, думала использовать для другого человека, но если намечается такой проект и нас возьмут, я бы переиграла.

[I2a1a]

Возьмут.
Не переживайте.

[Людмила]

Тогда хорошо. Все-таки это совсем другое дело, когда твои результаты проанализируют специалисты. Отдам тогда тест потомку полоцкого ловчего

[I2a1a]

Благодаря Давиду Веселовскому (Eurogenes) получил первые 156 референса, включая литовцев и белоруссов. За что ему низкий поклон и бардзо дзенкуй.

Грек молчит как партизан, а пакистанец Зак послал меня вежливо за пивом.

[I2a1a]

Также отдельное спасибо Леону за помощь.

[napobo3]

Благодаря Давиду Веселовскому (Eurogenes) получил первые 156 референса, включая литовцев и белоруссов. За что ему низкий поклон и бардзо дзенкуй.

Грек молчит как партизан, а пакистанец Зак послал меня вежливо за пивом.

Нужен доброволец/ица для переписки с потенциальными участниками - приглашать их в проект, получать согласие на использование их геномов и т.д.

[Valery]

пакистанец Зак послал меня вежливо за пивом.

это Разиб что ли?

[I2a1a]

Кто такой Разиб?

[Valery]

Кто такой Разиб?

содержит блог джиникспрешн уж лет 10 наверное

[I2a1a]

Нет, вроде бы другой.
Тот кто ведет проект Хараппа.

[I2a1a]

Итак, готовы первые результаты.
Не буду утомлять людей матрицами, лучше размещу картинки.

Вот результаты анализа выборки из 159 индивидов (156 референсов и 3 клиента 23andme).