Проект Magnus Ducatus Lituaniae

[sanych_85]

Не соответствуют. Более того Давидски для целей своего паневропейского проекта удалил большую часть оркнейцев из выборки,оставив только пару штук. У них всех близкое родство, что не может не сказаться на результатах.

Я вел речь о Вашем проекте, смотрите сами, оркнейцы на 100% в Admixture соответствуют NWE компоненту
https://spreadsheets.google.com/spreadsheet/ccc?key=0Aqn7iMc2P-yQdFc5VmhIbzlOWDc0VG9MRG9ka0xjMkE&hl=en_US#gid=0

[I2a1a]

Если в этом смысле, то да.
Впрочем у меня, как и у всех остальных, названия компонент носят весьма условный характер.

[I2a1a]

PCA plots
http://magnusducatus.blogspot.com/2011/06/pca-plots-for-reference-populations-and.html

[sanych_85]

Все-таки использование вологодских русских в качестве реперных очень непоказательно. И данные 23 and me, и тесты Вадима и Polako показывают, что реальные   русские участники проектов  зачастую значительно ближе беларусам, литовцам и украинцам нежели реперным вологодцам. Интересно было бы увидеть результаты если бы в качестве реперных использовались бы русские Орловской или Тульской области (оптимальный на мой взгляд выбор).

[mouglley]

Зато эти вологжане близки части северо-восточных русских.
Думаю, как реперная точка они превосходны!.
Просто необходимо всегда напоминать, что они - представители лишь части огромного русского этноса.

[sanych_85]

Зато эти вологжане близки части северо-восточных русских.

Зато они очень не близки всем остальным русским. Опять таки это лишь мое мнение, если нация более-менее однородна, как литовцы, то не так важно откуда будут взяты данные для рэперной литовской популяции, из Клайпеды или Каунаса. Но вот с Россией ситуация иная, вологодцы, поволжцы , смоляне и куряне могут отличаться друг от друга очень прилично. И чтобы видеть более-менее целостную картину по России либо необходимо  выделять несколько русских реперных групп, либо выделять одну усредненную между всеми.
Хотя с другой стороны, в качестве контраста, вологодцы подходят идеально.

[I2a1a]

Все-таки использование вологодских русских в качестве реперных очень непоказательно. И данные 23 and me, и тесты Вадима и Polako показывают, что реальные   русские участники проектов  зачастую значительно ближе беларусам, литовцам и украинцам нежели реперным вологодцам. Интересно было бы увидеть результаты если бы в качестве реперных использовались бы русские Орловской или Тульской области (оптимальный на мой взгляд выбор).

Кроме вологодских русских из HGDP, и я и Давидски используем двух русских из Твери. Что касается реперных русских с Орловщины и Тамбовщины  то по мере поступления  данных от жителей центральной полосы России можно создать "синтетические" реперные точки, или как их называет Диенекес - "зомби".

[sanych_85]

Кроме вологодских русских из HGDP, и я и Давидски используем двух русских из Твери

А можно узнать ID этих тверитян?

[I2a1a]

GSM536913
GSM536914

http://130.14.29.110/projects/geo/query/acc.cgi

[Wladzislaw]

Но вот с Россией ситуация иная, вологодцы, поволжцы , смоляне и куряне могут отличаться друг от друга очень прилично.

Смоленская губерния.

Великорусские уезды:

Бельский
Вяземский
Гжатский
Сычевский
Юхновский

Белорусские уезды:

Дорогобужский
Духовщинский
Ельнинский
Краснинский
Поречьский
Рославльский
Смоленский

Соловьев Я. А. Сельско-хозяйственная статистика Смоленской губернии. Москва, 1855.

====

Смотреть со стр. 92.

[I2a1a]

Начал подготавливать свой новый датасет для анализа ADMIXTURE, STRUCTURE, LAMP.
Первым делом, после обработки данных в программе PLINK, проверил общий русско-литовско-украинско-белоруско-польский кластер на прочность с помощью MDS/PCA анализа.

Расклад состава кластеров в терминах референсных популяций следущий

"Русские":
V164
V163
V207 ( )

Переходный кластер смешанных восточных славян -  между "белорусами" и "русскими" (смесь белорусов+русских, а также украинцы и их смесь с русскими и белорусами):

V219
V165
V186
V187
V161
V189

субкластер смешанных восточных славян с более заметным украинским компонентом
V185
V201
V202
V205
V215
V196

Кластер "беларусов" (включая жителей западной Польши)
V188
V158
V157
V174

Переходный кластер между "беларусами" и "литовцами"
V162
V214
V210
V220


Кластер "литовцев"

V191
V192
V184
V211
V216
V183
V190
V218
V170

Кластер "поляков"
V169
V205
V160
V208
V180
V187
V181
V176
V177

[Аббат Бузони]

Спасибо, интересно

[I2a1a]

Когда появяться результаты анализа Admixture, Lamp, Structure и Frappe -будет еще веселей.

[Аббат Бузони]

Когда появяться результаты анализа Admixture, Lamp, Structure и Frappe -будет еще веселей.

Жду с нетерпением.

[I2a1a]

Результаты unsupervised анализа ADMIXTURE для референсов + всех участников до V222.