АвторТема: Harappa Ancestry Project  (Прочитано 16671 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6333
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1337/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #15 : 18 Май 2012, 07:55:26 »
Он не всех берет. Я когда-то писала, просила включить рез-ты мужа (у него F-мито), получила ответ:
Цитировать
I am not sure how useful my project results would be for him. I am focused on South Asia and don't even break down European ancestry into East/West or North/South.
Zack Ajmal

Возможно приоритеты поменялись. Вышеприведенная ссылка из его блога появилась несколько дней назад. А мито и игрек для него действительно не аргумент - его интересуют аутосомы.

Оффлайн Людмила

  • Сообщений: 995
  • Рейтинг +151/-1
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #16 : 18 Май 2012, 11:28:15 »
Просто, если мито F, можно было предполагать когда-то Ю-В Азию. Но на самом деле по аутосомам все красно - европеец. Азия вымылась. Вы пишете -жаль, наших мало в участниках. Нас не берут в этот проект.

Оффлайн vnik

  • Сообщений: 242
  • Страна: de
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: H16
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #17 : 21 Май 2012, 11:04:56 »
В Gedmatch теперь тоже можно воспользоваться данным калькулятором. Вот мои результаты в HarappaWorld Admixture Proportions: Baloch 8.70%, Caucasian 10.15%, NE-Euro 52.32%, Siberian 8.24%, Mediterranean 15.98%. Подскажите, а кто такие Baloch?

Онлайн Asmat headhunter

  • Биохимическая субстанция
  • Сообщений: 14689
  • Страна: id
  • Рейтинг +956/-35
  • И того казака те тунгусы пальмами тут искололи
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #18 : 21 Май 2012, 11:21:05 »
Подскажите, а кто такие Baloch?

Белуджи.

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 443
  • Страна: us
  • Рейтинг +29/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #19 : 09 Июнь 2012, 17:34:34 »
Есть ещё более интересная новость - Зак сделал свой калькулятор. Некоторые уже воспользовались.

Population   
S-Indian   -   
Baloch   7.40%
Caucasian   6.75%
NE-Euro   63.16%
SE-Asian   -   
Siberian   1.07%
NE-Asian   -   
Papuan   0.31%
American   0.33%
Beringian   0.68%
Mediterranean   20.30%
SW-Asian   -   
San   -   
E-African   -   
Pygmy   -   
W-African   -   

Оффлайн Eugene

  • Охта
  • Сообщений: 6778
  • Страна: th
  • Рейтинг +1082/-41
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #20 : 21 Август 2012, 14:21:44 »
Вот мой Harappa


#   Population   Percent
1   NE-Euro   60.51
2   Mediterranean   14.68
3   Caucasian   8.68
4   Baloch   6.36
5   Siberian   3.57
6   SW-Asian   2.9
7   S-Indian   1.36
8   American   1.2
9   Beringian   0.59
10   Papuan   0.14


#   Population (source)   Distance
1   mordovian (yunusbayev)   4.46
2   ukranian (yunusbayev)   5.35
3   belorussian (behar)   5.36
4   russian (hgdp)   5.96
5   russian (behar)   5.98
6   lithuanian (behar)   11.62
7   slovenian (xing)   13.3
8   hungarian (behar)   15.17
9   n-european (xing)   16.81
10   utahn-white (hapmap)   18.02

Он посчитал, что я мордвин  ;D

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19891
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1826/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #21 : 21 Август 2012, 14:47:46 »
Натуральный мордвин, во всей стране такой один.

Оффлайн Eugene

  • Охта
  • Сообщений: 6778
  • Страна: th
  • Рейтинг +1082/-41
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #22 : 21 Август 2012, 14:51:47 »
Натуральный мордвин, во всей стране такой один.
А у Вас кто по Оракулу, как у Эрзя?

Оффлайн Аббат Бузони

  • ...
  • Сообщений: 19891
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1826/-60
  • Y-ДНК: I1-SHTR7+
  • мтДНК: H16-a1-T152C!
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #23 : 21 Август 2012, 15:20:01 »
Я полукровка, до эрзя нос не дорос. Свои данные я не смотрел, интернетом нынче обделен. 

Оффлайн Jonik

  • Сообщений: 443
  • Страна: us
  • Рейтинг +29/-0
  • Y-ДНК: N1c1 (L591+)
  • мтДНК: I1a1a
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #24 : 21 Август 2012, 17:08:20 »
Вот мой Harappa


******
Он посчитал, что я мордвин  ;D

Moi Harappa:
Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 NE-Euro 63.16
2 Mediterranean 20.3
3 Baloch 7.4
4 Caucasian 6.75
5 Siberian 1.07
6 Beringian 0.68
7 American 0.33
8 Papuan 0.31

Single Population Sharing:

# Population (source) Distance
1 belorussian (behar) 5.54
2 ukranian (yunusbayev) 7.43
3 lithuanian (behar) 9.32
4 mordovian (yunusbayev) 9.67
5 russian (hgdp) 10.05
6 n-european (xing) 13.42
7 slovenian (xing) 13.77
8 utahn-white (hapmap) 14.2
9 hungarian (behar) 15.36
10 orcadian (hgdp) 16.2
11 utahn-white (1000genomes) 16.43
12 british (1000genomes) 17.24
13 finnish (1000genomes) 23.32
14 chuvash (behar) 23.82
15 french (hgdp) 24.49
16 romanian (behar) 31.02
17 bulgarian (yunusbayev) 32.04
18 spaniard (behar) 36.59
19 spaniard (1000genomes) 37.55
20 italian (hgdp) 37.73

Mixed Mode Population Sharing:

#   Primary Population (source) Secondary Population (source) Distance
1   72.7% lithuanian (behar) +  27.3% french (hgdp) @  1.64
2   80% lithuanian (behar) +  20% spaniard (behar) @  1.96
3   59.3% lithuanian (behar) +  40.7% n-european (xing) @  2.06
4   80.5% lithuanian (behar) +  19.5% spaniard (1000genomes) @  2.15
5   75.9% belorussian (behar) +  24.1% orcadian (hgdp) @  2.16
6   80.6% lithuanian (behar) +  19.4% italian (hgdp) @  2.21
7   87.2% lithuanian (behar) +  12.8% sardinian (hgdp) @  2.22
8   64.4% lithuanian (behar) +  35.6% utahn-white (1000genomes) @  2.51
9   62.8% lithuanian (behar) +  37.2% hungarian (behar) @  2.52
10   77.9% belorussian (behar) +  22.1% british (1000genomes) @  2.69
11   60.4% lithuanian (behar) +  39.6% slovenian (xing) @  2.98
12   77.7% belorussian (behar) +  22.3% utahn-white (1000genomes) @  3.03
13   82.8% lithuanian (behar) +  17.2% tuscan (hapmap) @  3.09
14   65.9% lithuanian (behar) +  34.1% british (1000genomes) @  3.14
15   74.2% belorussian (behar) +  25.8% n-european (xing) @  3.2
16   83.1% lithuanian (behar) +  16.9% tuscan (1000genomes) @  3.32
17   91.1% belorussian (behar) +  8.9% basque (hgdp) @  3.36
18   90.9% belorussian (behar) +  9.1% spain-basc (henn2012) @  3.39
19   64.1% n-european (xing) +  35.9% finnish (1000genomes) @  3.7
20   83.6% lithuanian (behar) +  16.4% spain-basc (henn2012) @  3.7


Оффлайн Eugene

  • Охта
  • Сообщений: 6778
  • Страна: th
  • Рейтинг +1082/-41
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #25 : 21 Август 2012, 17:19:06 »
# Population (source) Distance
1 belorussian (behar) 5.54
2 ukranian (yunusbayev) 7.43
3 lithuanian (behar) 9.32
4 mordovian (yunusbayev) 9.67
5 russian (hgdp) 10.05
Получается, что у Вас первый "belorussian (behar) 5.54 " по генетической дистанции стоит дальше чем мой второй " ukranian (yunusbayev)   5.35" и третий "belorussian (behar)   5.36"
Мордвин на Вас не хватило  :)

Оффлайн sanych_85

  • Сообщений: 370
  • Страна: ru
  • Рейтинг +27/-0
  • Y-ДНК: E1b1b1a1b
  • мтДНК: H, H6a1b (по отцу)
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #26 : 21 Август 2012, 20:36:16 »
У меня вот, что получилось:

Я
Population (source)   Distance
mordovian (yunusbayev)   5.4
belorussian (behar)   5.46
ukranian (yunusbayev)   6.36
russian (hgdp)   6.49
russian (behar)   7.66
lithuanian (behar)   10.23
slovenian (xing)   13.84
n-european (xing)   15.31
hungarian (behar)   15.5
utahn-white (hapmap)   16.23
utahn-white (1000genomes)   18.33
orcadian (hgdp)   18.36
british (1000genomes)   19.29
chuvash (behar)   19.68
finnish (1000genomes)   22.25
romany (harappa)   22.5
french (hgdp)   25.84
romanian (behar)   30.13
bulgarian (yunusbayev)   31.28
spaniard (behar)   37.78


Мама

Population (source)   Distance
belorussian (behar)   4.99
mordovian (yunusbayev)   5.17
russian (hgdp)   6.21
ukranian (yunusbayev)   6.39
russian (behar)   6.87
lithuanian (behar)   9.75
slovenian (xing)   14.21
hungarian (behar)   15.95
n-european (xing)   16.03
utahn-white (hapmap)   16.98
utahn-white (1000genomes)   19.08
orcadian (hgdp)   19.16
chuvash (behar)   19.92
british (1000genomes)   20.06
finnish (1000genomes)   21.77
romany (harappa)   23.18
french (hgdp)   26.54

Отец

#   Population (source)   Distance
1    ukranian (yunusbayev)    3.17
2    belorussian (behar)    7.4
3    mordovian (yunusbayev)    7.64
4    russian (behar)    8.5
5    slovenian (xing)    8.95
6    russian (hgdp)    10.53
7    hungarian (behar)    10.61
8    n-european (xing)    12.96
9    utahn-white (hapmap)    14.24
10    lithuanian (behar)    14.65
11    utahn-white (1000genomes)    16.03
12    orcadian (hgdp)    17.32
13    british (1000genomes)    17.42
14    romany (harappa)    18.77
15    chuvash (behar)    19.8
16    french (hgdp)    22.19
17    romanian (behar)    25.07
18    bulgarian (yunusbayev)    26.1
19    finnish (1000genomes)    26.66
20    italian (hgdp)


Оффлайн Alex AXe

  • Сообщений: 319
  • Страна: ua
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: J1 Z1842+ CTS1460-
  • мтДНК: I1a1c
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #27 : 08 Ноябрь 2012, 19:27:14 »
Вот мои результаты:

1   NE-Euro   44.66
2   Caucasian   18.54
3   Mediterranean   16.59
4   Baloch   11.58
5   Siberian   5.21
6   NE-Asian   1.8
7   Beringian   0.93
8   Papuan   0.3
9   American   0.21
10   SW-Asian   0.12
11   San   0.07



Тут неоригинально. Венгр, как всегда.  :)

Single Population Sharing:
1   hungarian (behar)   11.04
2   slovenian (xing)   11.46
3   romanian (behar)   14.7
4   romany (harappa)   14.81
5   ukranian (yunusbayev)   15.15
6   bulgarian (yunusbayev)   15.99
7   mordovian (yunusbayev)   17.73
8   n-european (xing)   18.98
9   chuvash (behar)   19.23
10   russian (behar)   20.04
11   utahn-white (hapmap)   20.19
12   utahn-white (1000genomes)   20.51
13   belorussian (behar)   20.86
14   french (hgdp)   21.27
15   russian (hgdp)   21.73
16   british (1000genomes)   22.24
17   orcadian (hgdp)   23.52
18   italian (hgdp)   25.89
19   tuscan (hgdp)   27.46
20   tuscan (hapmap)   27.55



Тут, в принципе, нормально. В смысле, не очень фантастично:

Mixed Mode Population Sharing:
1       68.9%    ukranian (yunusbayev)    +    31.1%    nogai (yunusbayev)    @    4.88
2       75.5%    slovenian (xing)    +    24.5%    nogai (yunusbayev)    @    5.01
3       72.9%    ukranian (yunusbayev)    +    27.1%    turkmen (yunusbayev)    @    5.11
4       66.3%    mordovian (yunusbayev)    +    33.7%    turk-aydin (hodoglugil)    @    5.42
5       76.7%    hungarian (behar)    +    23.3%    nogai (yunusbayev)    @    5.46
6       54.5%    lithuanian (behar)    +    45.5%    turk-aydin (hodoglugil)    @    5.5
7       75.5%    ukranian (yunusbayev)    +    24.5%    turkish (harappa)    @    5.6
8       77.6%    slovenian (xing)    +    22.4%    tajik (yunusbayev)    @    5.66
9       72%    mordovian (yunusbayev)    +    28%    turkish (harappa)    @    5.67
10       70.3%    ukranian (yunusbayev)    +    29.7%    turk-aydin (hodoglugil)    @    5.68
11       77.1%    slovenian (xing)    +    22.9%    stalskoe (xing)    @    5.8
12       78.3%    slovenian (xing)    +    21.7%    urkarah (xing)    @    5.83
13       70.4%    mordovian (yunusbayev)    +    29.6%    turk-istanbul (hodoglugil)    @    5.87
14       70.5%    ukranian (yunusbayev)    +    29.5%    stalskoe (xing)    @    5.92
15       79.6%    slovenian (xing)    +    20.4%    turkmen (yunusbayev)    @    5.92
16       79.3%    hungarian (behar)    +    20.7%    urkarah (xing)    @    5.93
17       71.5%    mordovian (yunusbayev)    +    28.5%    turk-kayseri (hodoglugil)    @    5.94
18       75.8%    ukranian (yunusbayev)    +    24.2%    azeri (harappa)    @    5.98
19       55.4%    romanian (behar)    +    44.6%    mordovian (yunusbayev)    @    6.02
20       76.7%    ukranian (yunusbayev)    +    23.3%    iranian (harappa)    @    6.03

Оффлайн grimsvotn

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6572
  • Страна: aq
  • Рейтинг +1860/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belarussian borderline cluster (minor line of Krivichi/Radimichi?)
  • мтДНК: T1a1y1 G4596A RU-UA
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #28 : 11 Июнь 2013, 13:43:25 »
Мои:

#   Population   Percent
1    NE-Euro    59.36
2    Mediterranean    17.7
3    Caucasian    10.13
4    Baloch    8.87
5    Siberian    1.98
6    Papuan    1.18
7    American    0.39
8    SW-Asian    0.38

Single Population Sharing:

#   Population (source)   Distance
1    belorussian (behar)    3.45
2    ukranian (yunusbayev)    3.45
3    lithuanian (behar)    4.69
4    russian (hgdp)    10.74
5    mordovian (yunusbayev)    10.74
6    slovenian (xing)    12.67
7    hungarian (behar)    12.67
8    n-european (xing)    14.56
9    utahn-white (1000genomes)    14.56
10    utahn-white (hapmap)    14.56
11    russian (behar)    17.31
12    british (1000genomes)    17.83
13    orcadian (hgdp)    17.83
14    chuvash (behar)    20.71
15    finnish (1000genomes)    21.73
16    bulgarian (yunusbayev)    27.17
17    romanian-a (behar)    27.17
18    french (hgdp)    27.42
19    romany (harappa)    28.31
20    spaniard (behar)    35.09

Mixed Mode Population Sharing:

#       Primary Population (source)    Secondary Population (source)    Distance
1        78.6%   ukranian (yunusbayev)    +    21.4%   mordovian (yunusbayev)    @    1.91
2        78.6%   ukranian (yunusbayev)    +    21.4%   russian (hgdp)    @    1.91
3        78.6%   belorussian (behar)    +    21.4%   mordovian (yunusbayev)    @    1.91
4        78.6%   belorussian (behar)    +    21.4%   russian (hgdp)    @    1.91
5        88.5%   ukranian (yunusbayev)    +    11.5%   chuvash (behar)    @    2.18
6        88.5%   belorussian (behar)    +    11.5%   chuvash (behar)    @    2.18
7        93.2%   lithuanian (behar)    +    6.8%   turk-aydin (hodoglugil)    @    2.36
8        95.9%   ukranian (yunusbayev)    +    4.1%   selkup (rasmussen)    @    2.43
9        95.9%   belorussian (behar)    +    4.1%   selkup (rasmussen)    @    2.43
10        97.3%   ukranian (yunusbayev)    +    2.7%   dolgan (rasmussen)    @    2.48
11        97.3%   belorussian (behar)    +    2.7%   dolgan (rasmussen)    @    2.48
12        93.4%   lithuanian (behar)    +    6.6%   uzbek (behar)    @    2.49
13        96.7%   ukranian (yunusbayev)    +    3.3%   ket (rasmussen)    @    2.51
14        96.7%   belorussian (behar)    +    3.3%   ket (rasmussen)    @    2.51
15        97.9%   belorussian (behar)    +    2.1%   nganassan (rasmussen)    @    2.54
16        97.9%   ukranian (yunusbayev)    +    2.1%   nganassan (rasmussen)    @    2.54
17        97.8%   ukranian (yunusbayev)    +    2.2%   evenki (rasmussen)    @    2.54
18        97.8%   belorussian (behar)    +    2.2%   evenki (rasmussen)    @    2.54
19        97.7%   belorussian (behar)    +    2.3%   yakut (hgdp)    @    2.58
20        97.7%   ukranian (yunusbayev)    +    2.3%   yakut (hgdp)    @    2.58
« Последнее редактирование: 11 Июнь 2013, 16:36:34 от grimsvotn »

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8781
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5057/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Harappa Ancestry Project
« Ответ #29 : 03 Июль 2013, 07:34:18 »
Zack Ajmal выложил в своем блоге обновление Оракула для Harappa World (команда HarappaOracle). Более подробно о запуске программ для R в теме "Полезные ссылки".
Лично для меня точность явно выросла (с "заметно хуже среднего" на "обычный средний уровень"  ;D ).
Исходные данные:
1    NE-Euro    58.75
2    Mediterranean    17.51
3    Baloch    7.68
4    Siberian    5.7
5    Caucasian    4.31
6    S-Indian    1.7
7    SW-Asian    1.51
8    Beringian    1.19
9    American    1.15
10    NE-Asian    0.28
11    E-African    0.21

Было (вариант, который сейчас на Gedmatch):

#   Population (source)   Distance
1    belorussian (behar)    8.63
2    ukranian (yunusbayev)    8.63
3    lithuanian (behar)    8.8
4    russian (hgdp)    10.27
5    mordovian (yunusbayev)    10.27
6    n-european (xing)    16.36
7    utahn-white (1000genomes)    16.36
8    utahn-white (hapmap)    16.36
9    british (1000genomes)    17.04
10    orcadian (hgdp)    17.04

#       Primary Population (source)    Secondary Population (source)    Distance
1        88.2%   lithuanian (behar)    +    11.8%   yukaghir (rasmussen)    @    4.21
2        63.8%   mordovian (yunusbayev)    +    36.2%   orcadian (hgdp)    @    4.27
3        63.8%   mordovian (yunusbayev)    +    36.2%   british (1000genomes)    @    4.27
4        63.8%   russian (hgdp)    +    36.2%   british (1000genomes)    @    4.27
5        63.8%   russian (hgdp)    +    36.2%   orcadian (hgdp)    @    4.27
6        89.8%   lithuanian (behar)    +    10.2%   ket (rasmussen)    @    4.6
7        87.7%   lithuanian (behar)    +    12.3%   selkup (rasmussen)    @    4.61
8        91.9%   lithuanian (behar)    +    8.1%   dolgan (rasmussen)    @    4.72
9        93%   lithuanian (behar)    +    7%   evenki (rasmussen)    @    4.73
10        93.6%   lithuanian (behar)    +    6.4%   nganassan (rasmussen)    @    4.81

Стало:

 [1,] "mordovian_yunusbayev_15"     "7.0662"
 [2,] "russian_hgdp_25"             "7.6918"
 [3,] "ukranian_yunusbayev_20"      "8.6338"
 [4,] "belorussian_behar_9"         "9.1909"
 [5,] "russian_behar_2"             "10.7446"
 [6,] "lithuanian_behar_10"         "13.2315"
 [7,] "slovenian_xing_25"           "13.9541"
 [8,] "n-european_xing_25"          "14.2379"
 [9,] "utahn-white_hapmap_18"       "15.1342"
[10,] "hungarian_behar_19"          "15.2513"

 [1,] "85.4% russian_hgdp_25 + 14.6% spain-basc_henn2012_20"             
 [2,] "14.1% basque_hgdp_24 + 85.9% russian_hgdp_25"                     
 [3,] "29.1% british_1000genomes_99 + 70.9% russian_hgdp_25"             
 [4,] "69.9% russian_hgdp_25 + 30.1% utahn-white_1000genomes_100"       
 [5,] "30.1% orcadian_hgdp_15 + 69.9% russian_hgdp_25"                   
 [6,] "67.3% russian_hgdp_25 + 32.7% utahn-white_hapmap_18"             
 [7,] "34% n-european_xing_25 + 66% russian_hgdp_25"                     
 [8,] "83.7% russian_hgdp_25 + 16.3% spaniard_1000genomes_98"           
 [9,] "22.8% french_hgdp_28 + 77.2% russian_hgdp_25"                     
[10,] "83.4% russian_hgdp_25 + 16.6% spaniard_behar_12"

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.