JT, mtDNA

[grimsvotn]

Древний натуфиец с мтДНК JT у китайцев на древе полных сиквенсов:

https://mongolia.theytree.com/mttree/JT

В то время как на YFull есть два современных образца из этого узла: https://www.yfull.com/mtree/JT/

[Valery]

То есть они утверждают, что у натуфийцев была некая третья базальная ветвь JT.

Вот пока не уверен.

Average Depth: 1

это по всему геному в среднем
мт обычно покрыта очень неплохо, могут быть десятки раз при среднем 1
но таки пока я бы считал вероятность ошибки большой
покуда нет подробных репортов про тесты на качество этого образца

[Valery]

а если у него банально не прочитали нужное число снипов J и T но при этом забабахали на дерево?
даже такую версию сходу нельзя отвергать

[grimsvotn]

а если у него банально не прочитали нужное число снипов J и T но при этом забабахали на дерево?
даже такую версию сходу нельзя отвергать

Да я вот что-то тоже начал сомневаться в этом

[grimsvotn]

То есть они утверждают, что у натуфийцев была некая третья базальная ветвь JT.

Вот пока не уверен.

Average Depth: 1

это по всему геному в среднем
мт обычно покрыта очень неплохо, могут быть десятки раз при среднем 1
но таки пока я бы считал вероятность ошибки большой
покуда нет подробных репортов про тесты на качество этого образца

У меня некоторый скепсис насчет китайского theytree и того, какие снипы они считают филогенетически важными для отнесения к тому или иному субкладу.

Например, образец AU45028 (представитель оранг асли из Малайзии, регион Пера) у них почему-то помещен в  K2b*, в то время как на Yfull он определен как P*:

https://www.theytree.com/tree/K2-M526

Мито-образец AU45179 из Узбекистана (кушанская эпоха) у них T1a-T152C!, хотя в самой статье он заявлен как Т1а1 (то есть, кодирующую авторы все-таки посмотрели и выудили оттуда 9899, определяющую Т1а1 как Т1а1):

https://www.theytree.com/sample/f1b2544b91539993c794d49ac14ee44e.html (сама работа: https://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msab216/6329832 )

Пока для пост-ямников характерны мито-линии Т1а1, не Т1а1'3 или Т1а (эти две ассоциируются с неолитическими земледельцами, но не со "степью") ;-)

Я уже молчу про древние  R1 из Китая: https://www.theytree.com/tree/R1

Но есть и хорошие новости)) Китайцы внесли на theytree игрекДНК тяньюанского человека - K2b (возрастом более 40 тыс лет):

https://www.theytree.com/sample/1cbea6136688a2696720e43563c4767f.html

Плюс, несколько образцов доавстронезийского населения из Малайзии и Филиппин (аэта, агти и пр.) из гаплогруппы S, наравне с М являющейся основной игрекДНК линией Папуа Новой Гвинеи: https://www.theytree.com/tree/S
Что лишний раз доказывает некое аутосомное сходство жителей данного maritime региона ЮВА с папуасами (правда, с расхождением почти в 40 тыс лет)))

P.S. кстати, версия о происхождении узла K2b (бывший MNOPS)  на территории Сунды ещё актуальна, интересно?)

[Valery]

Что лишний раз доказывает некое аутосомное сходство жителей данного maritime региона ЮВА с папуасами (правда, с расхождением почти в 40 тыс лет)))

это как уравнять современного евро с кроманьоном

[grimsvotn]

Убой)) Типа того.
В частности, здесь рассматривалась данная проблема:

Multiple migrations to the Philippines during the last 50,000 years
https://www.pnas.org/doi/10.1073/pnas.2026132118

Плюс, обсуждалось в подкасте у Разиб Хана с приглашённым гостем - о генетике Филиппин:
https://podcasts.google.com/feed/aHR0cHM6Ly91bnN1cGVydmlzZWRsZWFybmluZy5saWJzeW4uY29tL3Jzcw/episode/Njc2MzBlZDctOTM3ZS00YWQyLTllZTEtMTE5YTY0YjM4YTE4?ep=14