АвторТема: YFULL.com - Интерпретация вашего полного сиквенса mtDNA  (Прочитано 36919 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Навля

  • R1a-Y2902
  • Сообщений: 501
  • Страна: cs
  • Рейтинг +192/-1
  • Y-ДНК: R1a-Z645-Z280-Y2902-Y35272
  • мтДНК: HV4a1-a*
Вот есть у меня совпадение близкое с научным образцом.
Как узнать ФИО и другие сведения этого научного образца?

https://www.yfull.com/mtree/H11a2a2b/

Оффлайн raia

  • Сообщений: 126
  • Страна: ru
  • Рейтинг +230/-3
  • Y-ДНК: e
  • мтДНК: Т2b4
поищите эти аксешны тут
Спасибо, как раз там и смотрела в первую очередь, но не понятно чьи это клоны и откуда ???...

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Вот есть у меня совпадение близкое с научным образцом.
Как узнать ФИО и другие сведения этого научного образца?

https://www.yfull.com/mtree/H11a2a2b/

Ничего себе! Возраст ближайшего общего предка в генеалогических пределах ~75-225 лет!

Это какие результаты нужно иметь, чтобы получить такой возраст в mt-ДНК!

Если подняться на уровень выше - H11a2a2, то возраст в пределах ~225-425 лет, т.е. исторического периода, получился у британца, поляков, русских, финнов, чешского немца и даже одного армянина!

Das is fantastisch!)))

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 6835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3620/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1e-pre T16093C T16311T
Это какие результаты нужно иметь, чтобы получить такой возраст в mt-ДНК!

Если подняться на уровень выше - H11a2a2, то возраст в пределах ~225-425 лет, т.е. исторического периода, получился у британца, поляков, русских, финнов, чешского немца и даже одного армянина!

Das is fantastisch!)))
Сарказм ощущаю я словах в этих ::) (хотя, возможно, он и не подразумевался)

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5658
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3567/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Вот есть у меня совпадение близкое с научным образцом.
Как узнать ФИО и другие сведения этого научного образца?

https://www.yfull.com/mtree/H11a2a2b/
По указанной Валерой ссылке можно через поиск найти подробности по некоторым научным мито.
В данном примере:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KY670995.1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KY671059.1
Мы видим что эти два образца из Тульской области. Другой информации по ним нет, на то они и анонимные научные образцы. Хорошо хоть что указали область, а не только страну.
Статья:
Mitogenomic diversity in Russians and Poles
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28633069/
Я попрошу чтоб указали на дереве для этой статьи в добавок к стране регионы. При их наличии конечно.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5658
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3567/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
поищите эти аксешны тут
Спасибо, как раз там и смотрела в первую очередь, но не понятно чьи это клоны и откуда ???...
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3322232/
"A “Copernican” Reassessment of the Human Mitochondrial DNA Tree from its Root"
Это статья Бехара из FTDNA. Насколько я помню, в статье не указана страна происхождения доноров. Это не дубли.

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5658
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3567/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Вот есть у меня совпадение близкое с научным образцом.
Как узнать ФИО и другие сведения этого научного образца?

https://www.yfull.com/mtree/H11a2a2b/

Ничего себе! Возраст ближайшего общего предка в генеалогических пределах ~75-225 лет!

Это какие результаты нужно иметь, чтобы получить такой возраст в mt-ДНК!

Если подняться на уровень выше - H11a2a2, то возраст в пределах ~225-425 лет, т.е. исторического периода, получился у британца, поляков, русских, финнов, чешского немца и даже одного армянина!

Das is fantastisch!)))
Спасибо, что заметили :) Причина банальная - мито заливается в автоматическом режиме с сервера NCBI. В генбанке отсутствует информация древний это образец или нет. Даже один древний образец может экстремально "омолодить" всю ветку, если мы не знаем о том, что это aDNA. У нас стараются отслеживать такие случаи, но при потоке тысяч образцов за раз не всегда это удается.
В данном случае взял на вскидку армянский образец из Карабаха. Оказался aDNA из статьи Маргаряна:
Eight Millennia of Matrilineal Genetic Continuity in the South Caucasus
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982217306954
Передам. Должны будут отметить их как aDNA с указанием возраста. Возраст ветви должен будет пересчитаться.

Оффлайн AVBaz

  • Сообщений: 49
  • Страна: ru
  • Рейтинг +22/-0
  • Y-ДНК: R1a-Y35 (YP582+, YP1079+)
По указанной Валерой ссылке можно через поиск найти подробности по некоторым научным мито.
В данном примере:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KY670995.1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KY671059.1
Мы видим что эти два образца из Тульской области. Другой информации по ним нет, на то они и анонимные научные образцы. Хорошо хоть что указали область, а не только страну.
Статья:
Mitogenomic diversity in Russians and Poles
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28633069/
Я попрошу чтоб указали на дереве для этой статьи в добавок к стране регионы. При их наличии конечно.
Так совпало, что я как раз собирался написать в Yfull письмо с просьбой добавления географической привязки по одному образцу из этой статьи. Тем не менее письмо я всё-таки отправлю для надёжности :) Если кому-то нужен текст статьи - обращайтесь.

Оффлайн raia

  • Сообщений: 126
  • Страна: ru
  • Рейтинг +230/-3
  • Y-ДНК: e
  • мтДНК: Т2b4
  Насколько я помню, в статье не указана страна происхождения доноров. Это не дубли.
Для некоторых образцов имеются семплы идентификаторы   , а кто такие Tor?

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5658
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3567/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
  Насколько я помню, в статье не указана страна происхождения доноров. Это не дубли.
Для некоторых образцов имеются семплы идентификаторы   , а кто такие Tor?
Это названия из статьи?
Искать нужно не в PopSet, а в базе Nucleotide:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/JQ798071.1
Видим что образец из Греции.
Статья:
Mitochondrial DNA Signals of Late Glacial Recolonization of Europe from Near Eastern Refugia
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3376494/

Оффлайн raia

  • Сообщений: 126
  • Страна: ru
  • Рейтинг +230/-3
  • Y-ДНК: e
  • мтДНК: Т2b4
Спасибо большое. С греком -132 сразу поняла , по другим неустановленным образцам  от Бехара спрашивпла:
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22482806/
Submitted (23-FEB-2012) Molecular Medicine Laboratory, Rambam Health Care Campus, Efron 9 st, Haifa 31096, Israel
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/JQ702278.1
JQ702278  16570 bp    DNA circular PRI 22-AUG-2016 DEFINITION  Homo sapiens clone 11783 mitochondrion, complete genome.
Это сами образцы от 2012 года или только открыли проект своей базы  в 2012 году? 22.08.2016 г. это дата завершения теста или размещения в базе?

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Сарказм ощущаю я словах в этих ::) (хотя, возможно, он и не подразумевался)

Скорее скепсис.)

Такие небольшие возрасты и узкие интервалы, аж возрасты с интервалами Y-хромосомных интерпретаций могут обзавидоваться.)))

Если не ошибаюсь, здесь на форуме вроде бы говорилось, что полное совпадение в HVR I + HVR II + CR может быть как у двух бартьев/сестёр, так и у двух персон с ближайшим общим предком, жившим ~3500 лет назад. Хотя, может это в rCRS, а в RSRS пошустрее, так как в ней снипов побольше.

Не понимаю пока методику YFull, как они считают возрасты в мтДНК, всё некогда поглубже вникнуть в секцию Оценка возраста в мтДНК.

Онлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R1a-L365
  • Сообщений: 412
  • Страна: 00
  • Рейтинг +144/-0
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1
В связи с вышесказанным, а вот такое нормально ?
https://www.yfull.com/mtree/X2j/

Оффлайн митохондрия

  • Сообщений: 1152
  • Страна: 00
  • Рейтинг +151/-1
  • Y-ДНК: супруг:J1, отец: I2a 'Dinaric-N' (I-S17250)
  • мтДНК: H8c- (T152C!) G13711A , T2e1b и HV0a1*
Добрый день!
Подала заявку в чат митогруппы T2. Не принимают.
Там 102 участника. Хочется узнать, о чем там болтают.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.