Филогенетическое дерево гаплогруппы N1

[mouglley]

На данный момент, 1077 гаплотип 67 Y-DNA.
Participants:
https://spreadsheets.google.com/ccc?hl=en&hl=en&key=tZMv2oDOwe9DLCYJ7JnnbGA&authkey=CJ6nyuwP#gid=2

Расчёты сделаны при скорости мутаций 0,00319/поколение/маркер.

Возраст 10000-11000 лет.
Я попытался восстановить гаплотип нашего общего предка N1:

Now, 1077 haplotypes 67 Y-DNA.
Age  10000-11000 years.
I tried to recover the haplotype of our general ancestor Nanc:

DYS 393 DYS 390 DYS 19/394 DYS 391 DYS 385a DYS 385b DYS 426 DYS 388 DYS 439 DYS 389-1 DYS 392 DYS 389-2 DYS 458 DYS 459a DYS 459b DYS 455 DYS 454 DYS 447 DYS 437 DYS 448 DYS 449 DYS 464a DYS 464b DYS 464c DYS 464d DYS 460 GATA H4 YCA IIa YCA IIb DYS 456 DYS 607 DYS 576 DYS 570 CDY a CDY b DYS 442 DYS 438 DYS 531 DYS 578 DYS 395S1a DYS 395S1b DYS 590 DYS 537 DYS 641 DYS 472 DYS 406S1 DYS 511 DYS 425 DYS 413a DYS 413b DYS 557 DYS 594 DYS 436 DYS 490 DYS 534 DYS 450 DYS 444 DYS 481 DYS 520 DYS 446 DYS 617 DYS 568 DYS 487 DYS 572 DYS 640 DYS 492 DYS 565

13,23,14,10,11,14,11,12,11,13,14,30,18,9,9,11,11,26,14,19,29,13,13,14,14,11,11,18,19,15,14,18,18,36,37,12,10,11,8,15,17,8,11,10,8,11,10,12,21,21,14,10,12,12,16,7,13,23,21,14,12,11,10,11,11,12,11
Ysearch is SZKKX

Люди, чьи гаплотипы нанесены на дерево (свободно для заполнения):

https://spreadsheets.google.com/ccc?hl=en&hl=en&key=tZMv2oDOwe9DLCYJ7JnnbGA&authkey=CJ6nyuwP#gid=0

Мурка обработала  1077 гаплотип N1 (размер 4X3.0 Mb):
Снипы, использованные при построении дерева: L58, L149.2, L392, L550, L551, L591, L665, L708, L727,  L728, L730, L731, L732, L733, L839, L1022, L1025, L1026, L1027, M178, P43, P189, TAT
The tree:
Превью:



Ссылки на закачку полного изображения:
Часть 1:

http://www.sendspace.com/file/71ro23
 
Часть 2:

http://www.sendspace.com/file/7cv3b2

Часть 3:

http://www.sendspace.com/file/2b32ti

Часть 4:

http://www.sendspace.com/file/3j49sfForms:

N1* - hexagons
N1b - octagons
N1c - ellipses
SNPs- triangles
Ancestors - squares
Descendants of two royal dynasties (Gediminids and Rurikids) - MDiamond

Colours:

Finland (Finland, Karelia) Yellow Желтый
West Balts (Belgium, Poland, Germany, Prussia,  Switzerland) Royal blue Синий
East & Central Balts (Lithuanian  principality: Latvia, Lithuania, Belarus, Ukraine) Blue Голубой
South Europe (Italy, Serbia, Hungary, Romania) mediumvioletred
Czechia (Czechia, Slovakia) mediumpurple
Russia (Russia, Komi, Chuvashia, Karelia,  Udmurtia, Ukraine) Red  Красный
Asia  (Kazakhstan, Bashkiria, Tartaria, Yakutia, Siberia) deeppink4 Тёмно-розовый
Estonia  Dark-green Тёмно-зелёный
Norway Green Зеленый
Sweden Light-green  Салатовый
British Orchid Розовый
Iberia (Spain, Portugal, Iberia, Mexico) Orange Оранж
Unknown  White (transparent) Белый
Ancestors Black Чёрный

Дерево 1081 гаплотипов, построенное программой TNT:

Примечания:
1. Смотреть в Блокноте со шрифтом Terminal.
2. Блокноте запретить перенос строк.

http://www.sendspace.com/file/syy8qx

Дерево в Wiki:
1212 67-ми и 111-ти маркерных гаплотипов с учётом всех 111 маркеров и снипов: M231, L732, L731, P189, L729, L666, M128, P43, Tat, M178, L708, L839, L1026, L392, L646, VL29, L550, L1025, L149.2, L551, L58, L591, L1027, L1022, Z1936, L1034, Z1925, Z1935, Z1940, Z1941

http://wiki.molgen.org/doku.php?id=ru:y:prj:mouglley:%D0%B3%D0%B0%D0%BF%D0%BB%D0%BE%D0%B3%D1%80%D1%83%D0%BF%D0%BF%D0%B0_n

alfatvcom   121625
andreital   82733
anode   N59644
Boris   144307
croWind   54909
cyryllo   N74632
Dars   96047
ferrum lupus   150796
golod   151523
grzechuk   110571
Intrst   106849
KaDar   N58382
mouglley   Kabec
Nekkkto   152916
Nimissin   69ZKR
oberst   151266
PatRush   93482
sakt   N11423
Sascha39   133144
shik   154501
vam   93467
VovaN   87454
Winnetou   148141
Yurgan   93463
ДАР ИСИДЫ   104256

[mouglley]

Дерево снипов N1:

Таблица:
https://docs.google.com/spreadsheet/ccc?key=0AkOxaebHH25ydFMyUVhpald0UkU4MG9DWjZOZ1VkTVE

[mouglley]

Дерево из 597-ми 37-маркерных гаплотипов:

Обозначения и окраска, как в предыдущих графах.
Окраску имеют только гаплотипы, у которых известны 67 маркеров.

Структура практически не прослеживается.
Гаплогруппы N1a, N1b и N1c занимают ветви вперемешку.
По дереву можно лишь судить о ближайшем родстве.
Скорости мутаций для 37-ми маркеров всегда грешили неточностью, поэтому, такие заоблачные даты.

[mouglley]

http://forum.molgen.org/index.php/topic,288.msg4002.html#msg4002
К вопросу возникновения Гаплогруппы N:
Карта с сайта National Geographical Data Center о том, что:



Обратите внимание на огромный континент в районе Индокитая. Именно там и паслись NO, а то и O и N по-отдельности (ежели они уже появились тогда
На то, что Британия и Скандинавия составляли часть материковой Европы, не обращайте внимания - Ни в Британии, ни в Скандинавии тогда не было не одной живой души.
Берингия, вроде-бы на месте, а вот Каспийское море кто-то скоммуниздил.
Япония была составной частью нашего Дальнего Востока.
Африка опять срослась с Азией в районе Сомали?
Сибирь, тут сомнениев и не было, доходила, практически, до северного полюса.
В общем, весь шельф, кроме крайних северный территорий, был заселён людьми.

Это на 110 м ниже сегодняшнего уровня мирового океана.
Как известно, 10 000 лет назад уровень океана был ниже на 60 м нынешнего.
Так что 10 000 лет, когда ледниковый период катился к закату, половина из новых территорий ещё не ушла под воду. И там обитали предки многих из нас - на берегу хорошо, ведь!

[mouglley]

http://dna-forums.com/index.php?/topic/4146-where-is-haplogroup-n1c-most-common/page__view__findpost__p__92285

N-population by countries:

[mouglley]

N-population by nations:

[mouglley]

The same for N1b:

[mouglley]

The same for N1c:

[mouglley]

[Shark]

Георг объявил, что завершает проект по поддержке своего дерева, так как не успевает за современными компьютерными филогенетическими деревьями.
Это была крутая и кропотливая работа длиной в 4 года.

[ankr21]

Георг объявил, что завершает проект по поддержке своего дерева, так как не успевает за современными компьютерными филогенетическими деревьями.
Это была крутая и кропотливая работа длиной в 4 года.

В любом случае- спасибо. На последнем дереве даже наша веточка отображена- by31085.