GEDmatch.Com - инструмент для генеалогических поисков

[Evg33]

Жду неделю, удаляю и перегружаю. План правильный?

Нет. Надо ждать.
У меня две звезды с 12 декабря 2013.

[Елена Александровна]

http://ww2.gedmatch.com:8006/autosomal/changes.php    Перевела:

"4 января 2014 - Мы повторное включение возможности загрузки файлов FTDNA ДНК. Это была отключена в течение последних нескольких дней в связи с изменением формата по FTDNA , который сделал файлы несовместимы с GEDmatch . FTDNA обязалась имея проблема решена не позднее пятницы, 17 января. Мы добавили патч к GEDmatch аутосомно загрузки программного обеспечения для обнаружения и отвергнуть неправильно отформатированные файлы . Если вы получаете эту ошибку при попытке загрузить файл , вы должны скачать новую копию файла из FTDNA после 17 января."

Это не моих однофамильцев случай? Так надо и их Raw Data загрузить новые?
Ведь только на этот сайт была надежда найти с одного мы хоть племени или нет.. 

[Елена Александровна]

Жду неделю, удаляю и перегружаю. План правильный?

Нет. Надо ждать.
У меня две звезды с 12 декабря 2013.

У однофамильцев НЕ ДВЕ звезды, а ОДНА!

Кого загружала позже и недавно - у тех ДВЕ!

[valera27]

А вот MDLP-22 для реальной мамы, и для ее образа, полученного фазированием по мне:

Т.е. "мелочь" у фазированного профиля стягивается к самому крупному комноненту.

Очень любопытно. Дело в том, что при разработке калькуляторов используются именно фазированные данные, и как раз замечен подобный эффект для эталонных популяций - завышение основного компонента, занижение второстепенных. Предковые компоненты после фазирования становятся как бы более ярковыраженными. Не обращал ранее внимания на связь с фазированием, так как смотрел только результаты с противоположной стороны - отсутствующего предка, где как раз собирается всякая ерунда наподобие Африки.

А у отсутствующего предка таки действительно вылезает Африка! Вот например для сравнения тот же MDLP-22 для виртуального "отца":

1 North-East-European 54.14
2 Atlantic_Mediterranean_Neolithic 17.73
3 West-Asian 7.12
4 North-European-Mesolithic 6.17
5 Near_East 3.44
6 Indo-Iranian 2.35
7 Samoedic 2.19
8 Indian 1.47
9 South-African 1.25
10 Pygmy 1.12
11 Sub-Saharian 0.86
12 Austronesian 0.57
13 South-America_Amerind 0.53
14 East-Siberean 0.46
15 Indo-Tibetan 0.32
16 North-Amerind 0.27

Single Population Sharing:

# Population (source) Distance
1 Mordovian_V (derived) 8.87
2 Ukrainian-West (derived) 9.2
3 Ukrainian_V (derived) 9.24
4 Latvian_V (derived) 9.34
5 Croatian_V (derived) 9.46
6 German (derived) 9.75
7 Slovakian (derived) 10.04
8 Tatar_Kryashen (derived) 10.07
9 Ukrainian-Center (derived) 10.16
10 Mordovian (derived) 10.73
11 Czech (derived) 11.08
12 Russian_V (derived) 11.6
13 Slovenian (derived) 12.04
14 Sorb (derived) 12.11
15 Hungarian (derived) 12.24
16 Tartar_Mishar (derived) 12.24
17 Russian_North (derived) 12.32
18 Moldavian (derived) 12.48
19 German-North (derived) 12.61
20 Ukrainian-East (derived) 12.67

Mixed Mode Population Sharing:

#   Primary Population (source) Secondary Population (source) Distance
1   67.3% Russian_North (derived)  +  32.7% Romania (derived)  @  3.88
2   67.2% Russian_North (derived)  +  32.8% Gagauz (derived)  @  3.97
3   65.5% Russian_North (derived)  +  34.5% Bulgarian (derived)  @  3.99
4   91.2% Ukrainian-West (derived)  +  8.8% Bra2 (derived)  @  4.18
5   63.5% Russian_North (derived)  +  36.5% Macedonian (derived)  @  4.2
6   74.8% Russian_North (derived)  +  25.2% Greek_South (derived)  @  4.23
7   74.8% Russian_North (derived)  +  25.2% Greek_North (derived)  @  4.25
8   91.4% Ukrainian-West (derived)  +  8.6% Bra1 (derived)  @  4.38
9   77% Russian_North (derived)  +  23% Greek_Center (derived)  @  4.39
10   60.1% Russian_North (derived)  +  39.9% Serbian (derived)  @  4.45
11   77.6% Russian_North (derived)  +  22.4% Greek_East (derived)  @  4.45
12   78.9% Russian_North (derived)  +  21.1% Italian-South (derived)  @  4.48
13   78.2% Russian_North (derived)  +  21.8% Italian-Center (derived)  @  4.48
14   64.3% Russian_North (derived)  +  35.7% Montenegrin (derived)  @  4.49
15   73.6% Russian_North (derived)  +  26.4% Ashkenazim_V (derived)  @  4.55
16   91.3% Ukrainian_V (derived)  +  8.7% Bra2 (derived)  @  4.56
17   79.6% Russian_North (derived)  +  20.4% Sicilian (derived)  @  4.63
18   76.9% Russian_North (derived)  +  23.1% Jew_Romania (derived)  @  4.7
19   91.5% Ukrainian_V (derived)  +  8.5% Bra1 (derived)  @  4.72
20   52.2% Russian_North (derived)  +  47.8% Bosnian (derived)  @  4.74

[Clavis]

А кто-нибудь практиковал фазирование на Гедматче? Например для получения данных нетестированного родителя по ребенку и тестированному родителю. Насколько можно верить этим данным (например, в плане использования в этнокалькуляторах)?

Я фазировал дважды: получил файл моего отца и моего тестя. Много этнических тестов не делал, проверил в обоих случаях на Eurogenes EUtest V2 K15. Ничего необычного не получил: отличия от сына (дочери) в пределах обычных колебаний для русских (или эрзя: тесть наполовину или более эрзя).

[rLin]

У меня есть предложение, как действовать с этими звёздами. Необработанные данные не надо удалять, а загрузить ещё раз, но под другим именем (добавив, например, к имени цифру). В результате данные для каждого человека будут загружены по два раза. После того, как у одного из наборов исчезнут звёзды, второй удалить. Я так проверил на себе, тоже думал, что две звезды никогда не исчезнут. Но мне повезло, звёзды исчезли с данных, загруженных 5 декабря 2013 г. , так что я удалил необработанную копию и всё теперь нормально. Если звёзды исчезнут на копии, то оригинал надо удалить, а копию переименовать.
Конечно, это повышает нагрузку на сервер gedmatch. Но так как-то спокойнее и определённее.
p.s. На всякий случай переименуйте архив с raw-данными и файл внутри архива перед загрузкой копии на Gedmatch (я не думаю, что там есть механизм защиты от повторных загрузок, но мало ли). Я лично добавил себе к имени суффикс us, получилось забавно и всё равно узнаваемо.

[Елена Александровна]

Спасибо! Очень дельный совет.
Мы, однофамильцы, хотим разобраться хоть с малыми сегментами.

Может когда грузила 3 января инет прерывался. Выходные всё таки.

[Evg33]

Елена Александровна: на GEDmatch есть кнопочка "DNA File Diagnostic Utility".
Там надо вбить номер GEDmatch интересующего файла и оно расскажет что сейчас происходит с файлом.

[Srkz]

По поводу звездочек появилось сообщение:

Feb 8, 2014 - The last one-to-many batch completed on Feb 4. We have discovered a minor bug where some kits uploaded after Nov 30 were shown to be processed, when in fact they have not completed processing. Those have been re-flagged as still needing batch processing, and the current batch has been restarted. This will delay the current batch, so we are now projecting that it will be completed in early March.

8 февраля 2014: 4 февраля мы завершили обработку очередного пакета файлов (сравнение one-to-many - файл со всей базой). При этом обнаружилась небольшая ошибка - некоторые киты, загруженные после 30 ноября, показывались как поступившие в обработку, в то время как на деле она совершалась по ним не полностью. Мы поставили на эти киты пометку "нуждается в обработке" и перезапустили текущий пакет. Это задержало его выполнение, сейчас мы ожидаем завершение обработки текущего пакета в начале марта.

[Елена Александровна]

Елена Александровна: на GEDmatch есть кнопочка "DNA File Diagnostic Utility".
Там надо вбить номер GEDmatch интересующего файла и оно расскажет что сейчас происходит с файлом.

Да, что-то там пишут не то....
Придется закачивать, как Вы сказали заново.
Спасибо!

[rLin]

По поводу звёздочек подтверждаю. Пропали в начале февраля. Сейчас вот опять появились. Впрочем One-to-many всё равно работает Эх, рано я своего дубликата удалил.

[Naeel]

Diagnostic пишет
Kit was tokenized on 2014-01-16 12:37:59 (America/Central time zone)

It should be available for use in the one-to-one comparison utility.

Kit F275130 has not completed processing for the one-to-many comparison results.

Please wait while matching segments are counted. This could take up to 5 minutes if the server is very busy. If it takes longer than that during peak periods, the server may have timed out...

You have at least 1 matching segment with 85.4 pct. of the 'A' kits in the database.
You have at least 1 matching segment with 74.5 pct. of the 'F' kits in the database.
You have no matches with 'M' kits.
NOICE: There is a know problem with missing 23andMe matches. It is being corrected, but may take a few weeks for additional processing. You do not need to do anything.

Kit F275130 has 17959 matching segments with other kits. This count includes matching segments as small as 3 cM. Each matching kit may include more than one matching segment.This kit has matches, but has not completed processing yet. Any matches you see so far may be as a result of processing other kits.

[Елена Александровна]

У меня радость, я хоть наконец, у мамы появилась (В FTDNA была сразу).
И очень сильно добавилось родни. Так что обработка похоже продолжается.
Ждем.
Появилось много народа у отца, хоть загружала недавно.
Но, как и с мамой было, меня в дочках у отца нет-самый сложный случай (В  FTDNA есть).

[varang]

закачал файлы на GedMatch: F321920.
все открыто.
други, вы опытные, что далее делать?)))

[babay]

други, вы опытные, что далее делать?)))

Набраться терпения и ждать когда  кто-либо из новых протестированных совпадет