GEDmatch.Com - инструмент для генеалогических поисков

[alminko]

Насколько достоверными можно считать такие результаты?

ни насколько. Надо смотреть на конкретные позиции SNP. Более того - даже в рамках одной компании могли быть разные поколения чипов с разными SNP. Как это работает. Представьте себе, что есть книга А и книга Б. Выберем из книги А буквы в позициях, которые делятся на 2. А из книги Б буквы в позициях, номер которых делится на 5.

Совпала, скажем, треть позиций из общих. Означает ли это, что все те позиции, которые есть только в А или только в Б будут тоже совпадать? НЕТ, не означает. И тут gedmatch использует очень кхм оптимистичный алгоритм, который завышает степень родства.

Еще отдельный вопрос, что совпаденец в GEDMATCH в общий список попадает при условии
- проставления галочек о приватности (что он дает добро на это)
- и что система его полностью проиндексировала (это занимается, кажется, пару дней).

Если совсем коротко

Largest segment = 6.3 cM

запросто может быть и не родственником, а может и быть.

Очень тяжело увидеть из общего отчета - сколько у вас общей ДНК суммарно ?

Спасибо большое за развернутый ответ, все стало еще понятнее. Уточните, пожалуйста, что означает блок в отчете:
 Largest segment = 6.3 cM
 Total Half-Match segments (HIR) 28.3cM (0.788 Pct)

Эти 28.3 сМ разве не общая суммарная ДНК?

[gecube_ru]

Largest segment = 6.3 cM
 Total Half-Match segments (HIR) 28.3cM (0.788 Pct)

Эти 28.3 сМ разве не общая суммарная ДНК?

по идее так оно и есть.

Самый большой сегмент - 6.3 сантиморган
и общее количество общей днк - 28.3 сантиморган и это значение может варьироваться в большую или в меньшую сторону из-за настроек фильтров. Скажем, из-за особенностей алгоритма это может быть на самом деле 15 сантиморган, например. Или 30-35 (если там есть еще сегменты по 1.5-2 сантиморган, которые были обрезаны)

[alminko]

Спасибо за подсказки. Интересно, почему там фигурирует HIR в качестве как бы общей ДНК, а не IBD?

И такой вопрос. Вы ответили "Надо смотреть на конкретные позиции SNP". Имелись в виду позиции на конкретных хромосомах или конкретных местах на хромосомах?

[gecube_ru]

Имелись в виду позиции на конкретных хромосомах или конкретных местах на хромосомах?

я имел в виду, что надо посмотреть на то, сколько реально общих SNP в двух разных тестах от двух разных лабораториях, чтобы понять ошибку.

[alminko]

Имелись в виду позиции на конкретных хромосомах или конкретных местах на хромосомах?

я имел в виду, что надо посмотреть на то, сколько реально общих SNP в двух разных тестах от двух разных лабораториях, чтобы понять ошибку.

Понял, спасибо.

[Древ]

alminko
Очень вам советую залить и ваш тест и тест вашего документального родственника в другие базы: Генотек и Майхеритаж.
Везде совпаденцев определяют чуть по-разному и может быть там будет более понятное аутосомное ОКРУЖЕНИЕ ваших образцов.
Совпадение на таком уровне как у вас может быть этнофоном, а может и родством и достоверно различить их невозможно. Только если по Y.
Но лично в моих понятиях, если есть документальное родство и есть любое генетическое совпадение - значит родственник и никаких гвоздей).