GEDmatch.Com - инструмент для генеалогических поисков

[Srkz]

Смотрите,я вроде как первел из К36,если ничего не напутал,потом взял на сайте VAHADUO базу данных MODERN SCALED.Файл этот добавил в SOURCE,а в TARGET вписал данных форматированные в G25.Мне вот это выдало

Ну если немножко погадать, основываясь непосредственно на самом К36 (а поскольку координаты G25 в данном случае получены преобразованием из К36, то там, наверное, и неоткуда взяться дополнительной информации). Имеем плюс-минус типичные для восточноевропейца показатели. В К13 присутствует некоторая доля сибирского компонента. В К36 он проявляется ростом Volga-Ural и Eastern_Euro, а не Fennoscandian и Siberian. Это более характерно для народов Поволжья, чем для северных русских. Отсюда калькуляторы берут либо небольшую примесь марийцев или чувашей, либо более значительное, но не полное сходство с мокшанами или эрзянами. Татары хуже подходят, поскольку не показано "степных" восточных компонентов. Но окончательный ответ может дать только наличие или отсутствие "кузенов" из этих народов. Могут быть и какие-то южные влияния, но их сложнее разделять, чем восточные. Да и сам К36 может дополнительно привирать на тестах последних лет

[ILYA_ZOTOV]

Смотрите,я вроде как первел из К36,если ничего не напутал,потом взял на сайте VAHADUO базу данных MODERN SCALED.Файл этот добавил в SOURCE,а в TARGET вписал данных форматированные в G25.Мне вот это выдало

Ну если немножко погадать, основываясь непосредственно на самом К36 (а поскольку координаты G25 в данном случае получены преобразованием из К36, то там, наверное, и неоткуда взяться дополнительной информации). Имеем плюс-минус типичные для восточноевропейца показатели. В К13 присутствует некоторая доля сибирского компонента. В К36 он проявляется ростом Volga-Ural и Eastern_Euro, а не Fennoscandian и Siberian. Это более характерно для народов Поволжья, чем для северных русских. Отсюда калькуляторы берут либо небольшую примесь марийцев или чувашей, либо более значительное, но не полное сходство с мокшанами или эрзянами. Татары хуже подходят, поскольку не показано "степных" восточных компонентов. Но окончательный ответ может дать только наличие или отсутствие "кузенов" из этих народов. Могут быть и какие-то южные влияния, но их сложнее разделять, чем восточные. Да и сам К36 может дополнительно привирать на тестах последних лет

Тогда почему калькулятор на VAHADUO выдает мне поляков и литовцев?По родственникам у меня нету вроде бы кузенов из поволжья,в том же Генотеке большего все из Беларуси,Смоленска.

[Srkz]

Тогда почему калькулятор на VAHADUO выдает мне поляков и литовцев?

Это условно проявляется балто-славянская основа, я её оставил "за скобками" и порассуждал, откуда могли взяться отклонения от неё в результатах калькуляторов.

Кстати, Генотек ведь тоже должен был дать свою интерпретацию.

[ILYA_ZOTOV]

Тогда почему калькулятор на VAHADUO выдает мне поляков и литовцев?

Это условно балто-славянская основа, я её оставил "за скобками" и порассуждал, откуда могли взяться отклонения от неё в результатах калькуляторов.

Ясно,спасибо вам за рассждения.А нельзя ли в Admix 4 прогнать мои результаты?Просто ссылки на нее уже не работают.И какой же можно сделать вывод на основе полученных данных?Откуда могли придти мои предки по вашему мнению?Мне вот известно,что на месте моей деревни откуда мой отец пошел,жили очень давно вроде литовские какие то племена,но опять же может мои предки откуда то пришли.

[ILYA_ZOTOV]

Вот результаты VAHADUO с G25 по современным координатам с Балтославики

Distance to:   sample_simulated_g25_scaled
0.01000455   Russian_Vladimir
0.01335137   Russian_NizhnyNovgorod
0.01657033   Russian_RyazanKadom
0.01746320   Russian_Novgorod
0.01767604   Russian_Tambov
0.01944826   Russian_Samara
0.02055214   Russian_TverKashin
0.02081731   Russian_Tver
0.02131006   Russian_RyazanSpassk
0.02134556   Russian_Ryazan
0.02158339   Russian_RyazanRyazhsk
0.02174278   Russian_Moscow
0.02243655   Russian_Yaroslavl
0.02297899   Russian_Kursk
0.02349147   Russian_RyazanMikhailov
0.02371607   Russian_Voronezh_North
0.02518962   Russian_Kostroma
0.02722594   Russian_Orel
0.02742918   Ukrainian_Dnipro
0.02758016   Russian_Bryansk
0.02764351   Russian_Kaluga
0.02800277   Russian_Pskov
0.02832312   Belarusian_East
0.02832350   Russian_Voronezh_Rep
0.02967643   Moksha

Target: sample_simulated_g25_scaled
Distance: 0.5884% / 0.00588446
31.6   Russian_Novgorod
28.2   Russian_Vladimir
19.0   Russian_RyazanRyazhsk
11.4   Russian_Vyatka
5.6   Lithuanian_RA
1.6   Darginian
1.6   Mari
0.8   Ju_hoan_North
0.2   Lithuanian_SZ

[Georg]

Вот результаты VAHADUO с G25 по современным координатам с Балтославики

Distance to:   sample_simulated_g25_scaled
0.01000455   Russian_Vladimir
0.01335137   Russian_NizhnyNovgorod
0.01657033   Russian_RyazanKadom
0.01746320   Russian_Novgorod
0.01767604   Russian_Tambov
0.01944826   Russian_Samara
0.02055214   Russian_TverKashin
0.02081731   Russian_Tver
0.02131006   Russian_RyazanSpassk
0.02134556   Russian_Ryazan
0.02158339   Russian_RyazanRyazhsk
0.02174278   Russian_Moscow
0.02243655   Russian_Yaroslavl
0.02297899   Russian_Kursk
0.02349147   Russian_RyazanMikhailov
0.02371607   Russian_Voronezh_North
0.02518962   Russian_Kostroma
0.02722594   Russian_Orel
0.02742918   Ukrainian_Dnipro
0.02758016   Russian_Bryansk
0.02764351   Russian_Kaluga
0.02800277   Russian_Pskov
0.02832312   Belarusian_East
0.02832350   Russian_Voronezh_Rep
0.02967643   Moksha

Target: sample_simulated_g25_scaled
Distance: 0.5884% / 0.00588446
31.6   Russian_Novgorod
28.2   Russian_Vladimir
19.0   Russian_RyazanRyazhsk
11.4   Russian_Vyatka
5.6   Lithuanian_RA
1.6   Darginian
1.6   Mari
0.8   Ju_hoan_North
0.2   Lithuanian_SZ

Лучше ещё спросить в теме g25 https://forum.molgen.org/index.php/topic,12986.0.html

А здесь видно, что весьма русский/великорос. Никаких сильных примесей.
Думаю Генотек показывает что-то подобное, за исключением эмигрантов в Сибирь

[norasever]

Загрузила аутосомы на Gedmatch, скажите пожалуйста, что может  означать 50 см? Пока это самое большое совпадение. И еще один совпаденец выделен зеленым, у него 35.5 см, и в графе age(days) 22, пока мне не понятно что к чему. Спасибо!

[guenther]

norasever,50 сантиморганов могут означать следующую степень родства:


Поле Age означает, сколько дней назад образец был добавлен в базу. В Вашем случае совпаденец залил на GM свой образец 22 дня назад.

[norasever]

Совпаденец из Бразилии на Gedmatch  мне написал, что у нас с ним есть некоторая степень родства, надо выяснить какая) Но насколько я понимаю, по этим данным слишком малая, чтобы обращать внимание  Total 36,2cm - Largest 11.2- Gen 4.31 или я не права?

[Farroukh]

слишком малая, чтобы обращать внимание  Total 36,2cm

Да, можно забыть. Предметно искать можно при совпадениях калибра 80+ сМ и выше - есть хоть какая-то надежда. А так...
P.S. Просьба к монстрам форума (ю ноу ху ю а)  девушке голову не морочить и не приводить тут редчайшие исключения из правил, когда по 9 сМ между жителями одного колхоза через миллион архивов откапывалось родство при динозаврах.

[Sly]

GEDmatch Archaic Matches
Совпадения начинаются с 5.0 cM, вот какие обнаружились на 5.0 cM
NE1   Polgár-Ferenci-hát, Hungary U5b2c   5070-5310 cal BC
Ust'-Ishim, Siberia K-M526   R   45,000 years
Anglo-Saxon genomes from East England 04 400AD
Екатериновка: SVP3, 2910-2875 cal BCE, - R1b1a2a2
F999821 HAL4, Halberstadt - Sonntagsfeld, Germany, 5.0 ky calBCE
F999803 Bichon, Switzerland, 13.7 ky cal BP
F999800 Rathlin1, Ireland, 2.0 ky cal BC

[grimsvotn]

GEDmatch Archaic Matches
Совпадения начинаются с 5.0 cM, вот какие обнаружились на 5.0 cM

Anglo-Saxon genomes from East England 04 400AD

Этот товарищ из Оакингтона есть у многих, кстати.

[Clavis]

В GEDmatch   я попробовал "Announcing Our Mini-Family Tree Tool" и сотворил  родословное минидрево. При попытки сохранить получил ответ: извините, не вышло. Может, дело в том, что имена писал кириллицей? или в ином?

[alminko]

Добрый день. Прошу помощи в интерпретации совпадения ДНК между мной и "документальным" родственником, который мне приходится "fourth cousin once removed".
Родственник сдал тест в 23andMe и выложил его в Gedmatch. Я сделал его в FTDNA. Сервис не показал мне родственника в своих списках. Тогда я решил сравнить наши ДНК с помощью One-to-one с изменением порога сантиморганидов. При выставлении порога в 6 сМ сервис показывает:

Chr    B37 Start Pos'n   B37 End Pos'n   Centimorgans (cM)   SNPs    Segment threshold   Bunch limit   SNP Density Ratio
13   24    823 006   27     397 474            6,3                     331              220                 132                      0,21

Largest segment = 6.3 cM

Total Half-Match segments (HIR) 6.3cM (0.175 Pct)
Estimated number of generations to MRCA = 7.6

1 shared segments found for this comparison.

298335 SNPs used for this comparison.

53.986 Percent of SNPs are full identical.


При выставлении порога в 3 сМ:


Largest segment = 6.3 cM

Total Half-Match segments (HIR) 28.3cM (0.788 Pct)

6 shared segments found for this comparison.

298335 SNPs used for this comparison.

53.986 Percent of SNPs are full identical.

Насколько достоверными можно считать такие результаты?
Сильно влияет на достоверность ДНК-совпадения тот факт, что тесты сделаны в разных фирмах?
Насколько часто Gedmatch показывает такое родство сразу в таблице без One-to-one?

[gecube_ru]

Насколько достоверными можно считать такие результаты?

ни насколько. Надо смотреть на конкретные позиции SNP. Более того - даже в рамках одной компании могли быть разные поколения чипов с разными SNP. Как это работает. Представьте себе, что есть книга А и книга Б. Выберем из книги А буквы в позициях, которые делятся на 2. А из книги Б буквы в позициях, номер которых делится на 5.

Совпала, скажем, треть позиций из общих. Означает ли это, что все те позиции, которые есть только в А или только в Б будут тоже совпадать? НЕТ, не означает. И тут gedmatch использует очень кхм оптимистичный алгоритм, который завышает степень родства.

Еще отдельный вопрос, что совпаденец в GEDMATCH в общий список попадает при условии
- проставления галочек о приватности (что он дает добро на это)
- и что система его полностью проиндексировала (это занимается, кажется, пару дней).

Если совсем коротко

Largest segment = 6.3 cM

запросто может быть и не родственником, а может и быть.

Очень тяжело увидеть из общего отчета - сколько у вас общей ДНК суммарно ?