АвторТема: Ytime v 2.08 - программа для подсчета ASD и TMRCA  (Прочитано 13114 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Ytime v2.08
« Последнее редактирование: 28 Май 2009, 23:14:30 от Centurion »

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 1769
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #1 : 28 Май 2009, 22:27:30 »
......
« Последнее редактирование: 12 Декабрь 2010, 22:16:24 от Овод »

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #2 : 28 Май 2009, 22:29:03 »
Ytime v2.08

А ссылка? Что за зверь? Где его взять?
Для вас, Князь, ничего не жалко :)

http://www.ucl.ac.uk/tcga/software/Ytime_v208.zip

Этой прогой, кстати, Di Gaetano считала возраст в своей публикации по Сицилии.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #3 : 28 Май 2009, 22:49:27 »
Спасибо за ссылку.

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11307
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2885/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #4 : 28 Май 2009, 23:06:17 »
Н-да.... А для тех кто в танке, но хочет увидеть свет, можно пояснить как этого зверя запустить?

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #5 : 28 Май 2009, 23:13:19 »
Н-да.... А для тех кто в танке, но хочет увидеть свет, можно пояснить как этого зверя запустить?
Зверь страшный... там есть мануалы (3 вордовсих файла степ-бай-степ)
« Последнее редактирование: 28 Май 2009, 23:19:50 от Centurion »

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11307
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2885/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Понял.... Вопрос снимается, рановато мне еще туда лезть.

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Понял.... Вопрос снимается, рановато мне еще туда лезть.
Да я пошутил  :)

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Это скрипты для Matlaba?

Сейчас у меня нет возможности протестировать эти скрипты. Кто-нибудь уже производил расчеты MRCA c помощью этой утилиты? Нсколько сильно они отличаются от стандартных и по какому алгоритму производится расчет?

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Это скрипты для Matlaba?

Сейчас у меня нет возможности протестировать эти скрипты. Кто-нибудь уже производил расчеты MRCA c помощью этой утилиты? Нсколько сильно они отличаются от стандартных и по какому алгоритму производится расчет?
Я только сегодня ее нашел. Считал только ASD из мануала.

А почему нет возможности протестировать?

Там нужно установить только GNU Octave 2.1.50
« Последнее редактирование: 28 Май 2009, 23:31:20 от Centurion »

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 1769
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #10 : 28 Май 2009, 23:35:39 »

Для вас, Князь, ничего не жалко :)

http://www.ucl.ac.uk/tcga/software/Ytime_v208.zip


Спасибо, дружище! Обязательно разберусь с этой прогой. Очень не хватает фирменного софта, заточенного под Y.

Кстати, рад, что Вы, наконец, освоили латынь. Virtus et Honestas!

Оффлайн zastrug

  • ...
  • Сообщений: 11307
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2885/-49
  • I2b1c (P78+)=I2a2a1b1a= I2a1b1a2a1a1( I-FT413656)
  • Y-ДНК: I2b1c
  • мтДНК: T2a1a
Re: Ytime v 2.08 - программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #11 : 28 Май 2009, 23:45:04 »
Да я пошутил  :)
Это вы думаете, что пошутили :) :-[, а для меня все что сложнее клика на указанную кнопку  уже темный лес :'( Пока наши в институте программирование учили, я в армии служил, а когда мы уволились, то пришлось сдавать зачет по дисциплине о которой ни слухом ни духом.... У меня получилось с шестого раза. В итоге стойкая нелюбовь на всю жизнь ко всему, что хоть как-то глубже пользовательского уровня.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Ytime v 2.08 - программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #12 : 28 Май 2009, 23:54:37 »
Я на работе.

Это скрипты для Matlaba?

Сейчас у меня нет возможности протестировать эти скрипты. Кто-нибудь уже производил расчеты MRCA c помощью этой утилиты? Нсколько сильно они отличаются от стандартных и по какому алгоритму производится расчет?
Я только сегодня ее нашел. Считал только ASD из мануала.

А почему нет возможности протестировать?

Там нужно установить только GNU Octave 2.1.50

Оффлайн CenturionАвтор темы

  • 100% Earth (Solar System) genofond
  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 9548
  • Страна: ru
  • Рейтинг +571/-2
Re: Ytime v 2.08 - программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #13 : 28 Май 2009, 23:55:41 »
Я на работе.
Вопрос снимается :)

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10364
  • Страна: ee
  • Рейтинг +761/-8
Re: Ytime v 2.08 - программа для подсчета ASD и TMRCA
« Ответ #14 : 28 Май 2009, 23:57:47 »
То есть, эти скрипты для уже решенных кластеров с известным предковым модалом?

Цитировать
The methods assume that the haplotype of the root ancestor is known

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.