Genetic history of an archaic hominin group from Denisova Cave in Siberia

[Valikhan]

http://www.nature.com/nature/journal/v468/n7327/full/nature09710.html

Using DNA extracted from a finger bone found in Denisova Cave in southern Siberia, we have sequenced the genome of an archaic hominin to about 1.9-fold coverage. This individual is from a group that shares a common origin with Neanderthals. This population was not involved in the putative gene flow from Neanderthals into Eurasians; however, the data suggest that it contributed 4–6% of its genetic material to the genomes of present-day Melanesians. We designate this hominin population ‘Denisovans’ and suggest that it may have been widespread in Asia during the Late Pleistocene epoch. A tooth found in Denisova Cave carries a mitochondrial genome highly similar to that of the finger bone. This tooth shares no derived morphological features with Neanderthals or modern humans, further indicating that Denisovans have an evolutionary history distinct from Neanderthals and modern humans.

[Valikhan]

Статья в New York Times

http://www.nytimes.com/2010/12/23/science/23ancestor.html

...An analysis of this ancient DNA, published on Wednesday in Nature, reveals that the genomes of people from New Guinea contain 4.8 percent Denisovan DNA...

...Next, the researchers looked for evidence of interbreeding. Nick Patterson, a Broad Institute geneticist, compared the Denisovan genome to the complete genomes of five people, from South Africa, Nigeria, China, France and Papua New Guinea. To his astonishment, a sizable chunk of the Denisova genome resembled parts of the New Guinea DNA...

...If the Denisovans did indeed have a range spreading from Siberia to South Asia, they must have been a remarkably successful kind of human...

[napobo3]

Опять о том же.
Как их называть? Денисовцы?

[I2a1a]

Статья в New York Times

http://www.nytimes.com/2010/12/23/science/23ancestor.html

...An analysis of this ancient DNA, published on Wednesday in Nature, reveals that the genomes of people from New Guinea contain 4.8 percent Denisovan DNA...

...Next, the researchers looked for evidence of interbreeding. Nick Patterson, a Broad Institute geneticist, compared the Denisovan genome to the complete genomes of five people, from South Africa, Nigeria, China, France and Papua New Guinea. To his astonishment, a sizable chunk of the Denisova genome resembled parts of the New Guinea DNA...

...If the Denisovans did indeed have a range spreading from Siberia to South Asia, they must have been a remarkably successful kind of human...

Это все дешевая сенсация.

[I2a1a]

Мой анализ митохондрионов сапиенса, неандертальцев, и денисовцев показывает, что генетическая дистанция между "денисовцами" и сапиенсами/неандертальцами в десятки раз больше дистанции между сапиенсами современного вида и неандерами.

[napobo3]

Мой анализ митохондрионов сапиенса, неандертальцев, и денисовцев показывает, что генетическая дистанция между "денисовцами" и сапиенсами/неандертальцами в десятки раз больше дистанции между сапиенсами современного вида и неандерами.

Хотелось бы ознакомиться с Вашим анализом.

[I2a1a]

Мой анализ митохондрионов сапиенса, неандертальцев, и денисовцев показывает, что генетическая дистанция между "денисовцами" и сапиенсами/неандертальцами в десятки раз больше дистанции между сапиенсами современного вида и неандерами.

Хотелось бы ознакомиться с Вашим анализом.

Пожалуйста, вот филодрево, построенное по бласт-элайнменту человеческих мито-FGSов и митохондриона неандертальских Нефилимов ().

http://forum.molgen.org/index.php/topic,1510.msg42500.html#msg42500

А вотъ- аналогичное дерево построенное по бласт-элайнменту человеческих мито-FGSов и  митохондриона неандертальских Нефилимов  - в сравнении с элайнментами митосиквенса денисовских Рефаимов (??). Пророк Исаия пишет, что Господь (??) истребил их, и уничтожил всякую память о них (Ис.26:14), оставив только митохондриальный сиквенс.

http://forum.molgen.org/index.php/topic,1510.msg42501.html#msg42501

[Clavis]

Если денисовцы так далеки от нас, то интересно сравнить денисовцев, сапиенсов и шимпанзе-бонобо. Вроде бы у бонобо наиболее близкая к нам мито из ныне живущих приматов?

[I2a1a]

Если денисовцы так далеки от нас, то интересно сравнить денисовцев, сапиенсов и шимпанзе-бонобо. Вроде бы у бонобо наиболее близкая к нам мито из ныне живущих приматов?

Нет проблема. Полные митосиквенсы шимпанзе и прочих гоминид имеются в Генбанке. Нужно бластить.

[Valikhan]

Оригинальное название этой пещеры Аю-таш - "Медвежий камень". Жаль, что в научной (археологической) литературе это не зафиксированои пользуются поздним переименованием.

[Valikhan]

Homo sp. Altai complete mitochondrial genome, isolate Denisova molar

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/315466581

[I2a1a]

Homo sp. Altai complete mitochondrial genome, isolate Denisova molar

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/315466581

Знаем, я по этому FmtdnaGS строил филогентическое дерево денисовцев.

[I2a1a]

Пардон, я строил дерево по первому митосиквенсу денисовцев, а это уже второй сиквенс.
Соорудил новое дерево.

[I2a1a]

Для сравнения визуализация дистанций между митосиквенсами шимпанзе (пан +троглодит) и гомо (сапиенс сапиенс, сапиенс неандерталиенс, сапиенс Алтай (денисовский человек)).

[wertner]

Для сравнения визуализация дистанций между митосиквенсами шимпанзе (пан +троглодит) и гомо (сапиенс сапиенс, сапиенс неандерталиенс, сапиенс Алтай (денисовский человек)).

Не увидел на этом дереве сапиенс Алтай (денисовского человека). В какой они части? Верхние трое?