Итак, модель. Популяция от общего предка развивается 35 поколений без популяционного эффекта, достигая 10 тыс.чел. Далее бутылочное горлышко, выживает 2 случайных потомка. Первый, через 65 поколений имеет 1млн. потомков, второй - 100 тыс. Поп. эффект за эти 65 поколений также отсутствует. Общий возраст всей конечной популяции численностью 1 100 000 чел. от общего предка 100 поколений. Таким образом, я пытался рассмотреть и бут.горлышко, и неравномерность развития дерева.
Рассматривал на одном маркере с интенсивностью(скоростью) мутаций 0,002 за поколение.
На первых 35 покол. распределение мутаций от предкового значения получилось таким.
+2 - 6 чел.
+1 - 327
0 - 9 334
-1 - 327
-2 - 6
Итого 10 тыс.чел.
Для проверки просчитал возраст ASD-методом-35,1 покол., линейным -35,09.
После бут. горлышка из них остаётся случайных 2 чел. Рассмотрев все возможные варианты и просчитав их вероятность, учитывая. что для дальнейших расчётов важно только расстояние между ними в мутациях, я свёл их к пяти вариантам:
4 мутации - вероятность 0,0000007
3- 0,0000785
2- 0,0043792
1- 0,1221794
0- 0,8733622
Замечу, что два последних варианта дают в данном примере более 99,5%.
Распределение на последующих 65 поколения такие:
Для большей части 1 000 000 чел.
+4-1
+3-38
+2-1 836
+1-57 299
0-881 652
-1-57 299
-2-1 836
-3-38
-4-1
Проверка возраста расчётом ASD-65,00 покол. ,лин-65,06
Меньшая часть - 100 000 чел.
+3-4
+2-184
+1-5 730
0-88 164
-1-5 730
-2-184
-3-4
Проверка расчётом возраста.ASD-65,02;лин-65,07.