Новички R1a: интерпретация, советы

[Semargl]

Какой у вас номер образца в базе фтдна? И в каком проекте можно увидеть ваш гаплотип?

B136030
Например в "Mogilev Podolskiy, Ukraine".

Спасибо. Я думаю что 100% R-Y2619 и вероятно R-FGC18226. Если более спекулятивно, то возможно предположить R-FGC18218.
Дерево тут.

[voks]

По предиктору Невген выдает ветвь R1a-F1345 https://www.yfull.com/tree/R-F1345/ , это на несколько ветвей перед R-Y2619. Если есть желание тестироваться дальше, то делать апгрейд до Big Y-700, чтобы узнать свою крайнюю известную ветвь и видеть ближайших родственников по ветвям. Если пока делать Big Y-700 не планируете, то можно попробовать сделать единичный SNP тест мутации R-Y2619.

Спасибо. Я тоже попробовал - показывает только что 100% вероятность R1а. Если можно в 2х словах как вы получили F1345?
Про Y700. Желание может и есть. Но вот я сделал изначально Y37, потом сдлал upgrade на Y67, потом на Y111. А результаты не то чтоб, что-то определилось - так и не понятно вот вы как-то определили F1345 а другие люди Y2619.
Я естественно без претензий, но какое-то неприятное ощущение что я чего-то упускаю. Чего?

[NathanS]

Спасибо. Я тоже попробовал - показывает только что 100% вероятность R1а. Если можно в 2х словах как вы получили F1345?

В установках на Nevgen выберите Subcaldes or R1a (Y67+)

[voks]

Про левитов-ашкенази Y2619 можно посмотреть некоторую информацию тут.

Спасибо. Я это читал, давно.
Кстати говоря один из указанных там коментаторов как раз тот человек что прислал мне что моя гаплогруппа R1a-Y2619

[voks]

Спасибо. Я тоже попробовал - показывает только что 100% вероятность R1а. Если можно в 2х словах как вы получили F1345?

В установках на Nevgen выберите Subcaldes or R1a (Y67+)

Да. Точно. Хорошая штука. Правда не понятно кому/чему теперь верить 

[voks]

Спасибо. Я думаю что 100% R-Y2619 и вероятно R-FGC18226. Если более спекулятивно, то возможно предположить R-FGC18218.
Дерево тут.

Во. Я наверное много хочу, но если б вы объясняснили на пальцах как вы сделали этот вывод?
И почему nevgen.org выдает другое?

[NathanS]

Да. Точно. Хорошая штука. Правда не понятно кому/чему теперь верить 

Прогнозы не противоречат друг другу - F1345 а другие люди Y2619.
F1345 старше Y2619, а и, как я понимаю, Nevgen использует только открытые профили со сделанными маркерами и сделаммым BigY для предикции. Кто-то просто сравнил по своим базам и смог сделать лучшее предсказание.
Уважаемый Semargl сделал вам еще точнее предсказание.

[voks]

Прогнозы не противоречат друг другу - F1345 а другие люди Y2619.
F1345 старше Y2619, а и, как я понимаю, Nevgen использует только открытые профили со сделанными маркерами и сделаммым BigY для предикции. Кто-то просто сравнил по своим базам и смог сделать лучшее предсказание.
Уважаемый Semargl сделал вам еще точнее предсказание.

Да. Верно. Туплю. Посмотрел дерево. Так и есть.
Но...Вопросы остались.
Каким образом Уважаемый Semargl (а также Meir Garbarz Gover) смогли  предсказать более точно?
Что такого даст Y700 что я сейчас не знаю? Как я понимаю в плане возможних более близких родственников - ничего, потому как  они в  Y111 уже были бы видны. Тогда что еще? Более точную ветвь а значит миграцию? Или?

[DELTA]

По предиктору Невген выдает ветвь R1a-F1345 https://www.yfull.com/tree/R-F1345/ , это на несколько ветвей перед R-Y2619. Если есть желание тестироваться дальше, то делать апгрейд до Big Y-700, чтобы узнать свою крайнюю известную ветвь и видеть ближайших родственников по ветвям. Если пока делать Big Y-700 не планируете, то можно попробовать сделать единичный SNP тест мутации R-Y2619.

Спасибо. Я тоже попробовал - показывает только что 100% вероятность R1а. Если можно в 2х словах как вы получили F1345?
Про Y700. Желание может и есть. Но вот я сделал изначально Y37, потом сдлал upgrade на Y67, потом на Y111. А результаты не то чтоб, что-то определилось - так и не понятно вот вы как-то определили F1345 а другие люди Y2619.
Я естественно без претензий, но какое-то неприятное ощущение что я чего-то упускаю. Чего?

Про настройки Невген уже ответили. Y37 это хороший старт, которые дает неплохой результат; Y67 расширяет информацию, а Y111 уже последний шаг перед Big Y-700. Тесты   Y37 - Y111 выдают гаплотип, по которому прогнозируется гаплогруппа и крупная ветвь. Подтверждается прогноз или SNP тестом или чтением всей Y-хромосомы как в комплексном тесте Big Y-700. Предиктор Невген на основании своей базы данных определяет крупные ветви (F1345), в то время как знатоки на основании своих знаний прогнозируют дальнейшие ветви (Y2619 и FGC18226).
Тест Big Y-700 определит крайнюю известную ветвь, а также приватные мутации, которые при совпадении сейчас или в будущем откроют новую ветвь. Фактически после Big Y-700 останется сидеть и ждать тестов более близких родственников. Ну и в проектах будете видеть родственников по ветвям, так как обычный список совпаденцев имеет ограничение на дальность примерно до 6 веков назад. Дальше сможете собирать подходящую информацию и проводить аналитический анализ имеющихся материалов.

[voks]

[Предиктор Невген на основании своей базы данных определяет крупные ветви (F1345), в то время как знатоки на основании своих знаний прогнозируют дальнейшие ветви (Y2619 и FGC18226).

Ну да. Это я понимаю. Только интересно все же какие такие  знания позволяют им, знатокам, прогнозировать? Я ни в коем случае не пытаюсь составить этим знатокам конкуренцию или там что-то выведать. Просто желательно знать насколько этим прогнозам можно верить и строить на них дальнейшие поиски.

Тест Big Y-700 определит крайнюю известную ветвь, а также приватные мутации, которые при совпадении сейчас или в будущем откроют новую ветвь. Фактически после Big Y-700 останется сидеть и ждать тестов более близких родственников. Ну и в проектах будете видеть родственников по ветвям, так как обычный список совпаденцев имеет ограничение на дальность примерно до 6 веков назад. Дальше сможете собирать подходящую информацию и проводить аналитический анализ имеющихся материалов.

Спасибо, но опять же хотелось бы поподробнее. Ведь я ж могу " сидеть и ждать тестов более близких родственников" уже сейчас с моим  Y111, зачем мне для этого Y700?   

[voks]

Здравствуйте. На всякий случай, у нас тема о левитах-ашкенази еще тут есть https://forum.molgen.org/index.php/topic,1249.465.html

Почитал. Возможно я многого не понимаю. Но от левитов-ашкенази там только название. A так поляне, аланы, скифы. Интересно но малорелевантно.     

[Semargl]

[Предиктор Невген на основании своей базы данных определяет крупные ветви (F1345), в то время как знатоки на основании своих знаний прогнозируют дальнейшие ветви (Y2619 и FGC18226).

Ну да. Это я понимаю. Только интересно все же какие такие  знания позволяют им, знатокам, прогнозировать? Я ни в коем случае не пытаюсь составить этим знатокам конкуренцию или там что-то выведать. Просто желательно знать насколько этим прогнозам можно верить и строить на них дальнейшие поиски.

Тот прогноз, который я дал, основан на моем собственном предикторе. К сожалению нет времени закончить по нему работу и опубликовать для использования. Основан на дереве восстановленных предковых гаплотипов.

Я уже сказал, что в результате R-Y2619 можно быть уверенным. Эта ветвь ашкенази определяется очень легко, в отличии от некоторых других ветвей.
Ниже Y2619 можно пытаться предсказать с той или иной долей уверенности, но это будет оставаться предположением.
Основывать свои поиски на предположении или сделать любой тест NGS (BigY или WGS от других компаний) и быть уверенным в своем положении на Y-дереве, и исходить уже из 100% доказанного факта? Решать вам.

Топология Y2619 похожа на ежа. Ветвь прошла через бутылочное горлышко, а затем показала взрывной рост. Многие субклады внутри Y2619 практически неотличимы друг от друга и поэтому все что ниже Y2619, без подтверждения через SNP или NGS, останется только предположением. Что интересно, так это количество протестированных в Y2619, что часто выводит к уже документальным источникам. Многие субклады и разветвления привязаны к историческим личностям.
Я бы на вашем месте просто написал администратору сайта "Levite DNA", возможно у него есть дополнительная информация по вашему близкому матчу.

Я так понимаю, вы читали статью Бехара о происхождении субклада?

[Semargl]

Подтверждается прогноз или SNP тестом или чтением всей Y-хромосомы как в комплексном тесте Big Y-700.

Небольшое замечание. Тест Big Y700 не читает всю Y-хромосому, а только 70-75%, что в принципе достаточно для генеалогии.
98-99% - Y-хромосомы читаются исключительно в тестах WGS.

[Истяк]

Дистанция 1 на 67

По моему примеру 1/67

Люди, кто ни будь.
Неплохо бы для документальных родословных специальную тему для статистики завести.
Коротко без жвачки и не для обсуждения.
Создать шаблон для заполнения.

Типа, что имеем,(Big Y, YFull, 111, 67 и т д) какая разница, и общий предок:
Есть желание, указал проект.

Я тоже пока влезу в эту тему, потом перееду.

Два брата имеют в РС_1834г. по 10-ку сыновей.
1-й с 1769г - ветвь 7 пок. имеет 37 мар. гаплотип
2-й с 1780 г – ветвь 8 пок.  имеет 111 мар. гаплотип
Общий предок +/ -  от 1700 до 1740 года - 5 на 37-и

Братья стыкуются с параллельной ветвью (111 м.г.) не менее чем через 10-ь  пок.
В родословной имена - на разном уровне.
Общий предок +/ -  на глазок 1600 - 1650 год

Разница братьев к параллельной ветви, второй скрин  2 на 37 и 3 на 37
При сравнении 111 гапла  - 5 на 111-и

Все наверно уже давно заметили, что все изменения происходят на 37 мар.,
которых хватает для расфасовки по ветвям.
Мое имхо, гапло похоже у каждого свое и в стандартные уравнения не полезет.
У одного до 700 маркеров без изменения, у других……….

Миллиардера нам не дождаться, надо искать самим.
Давно уж ясно, что 1мут = 100 лет -  это фуфло.

[NathanS]

Дистанция 1 на 67

По моему примеру 1/67

Люди, кто ни будь.
Неплохо бы для документальных родословных специальную тему для статистики завести.
Коротко без жвачки и не для обсуждения.
Создать шаблон для заполнения.

Блэйн Беттингер собирает такую статистику: https://docs.google.com/forms/d/e/1FAIpQLSdzS4zciF_DMSdoNlIBmHhZqmjfu18KySCSd2Rn6AWSB3UwIA/viewform
Степень родства надо записывать так: 3C - т.е. четвероюродный брат.
Те, кто сделал 111 и/или BigY, могут несколько раз заполнить форму, занося статистику по 37 и 67 маркерам.
Он же составил схему с типичнымо совпадениями по аутосомным тестам.

Он публиковал примеры какую статистику можно получить, но отписался, что пока мало данных. Я заполнил по всем тестам какие делал.