АвторТема: Новички R1a: интерпретация, советы  (Прочитано 1013413 раз)

Mironov и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5640 : 06 Октябрь 2018, 23:43:46 »
Уважаемые эксперты. Из Канады пришел результат анализа ДНК по 17 маркерам, предварительно(там же) указано R1A 100%, более точно обещают посчитать. Попробовал прогнать по известным калькуляторам, результат вроде бы подтверждается, однако с разным процентом... http://www.nevgen.org вообще пишет, что ввел ошибочные данные :'( Может кто-то подскажет по этим цифрам что... 16-13-25-31-15-16-11,14-13-10-10-23-11--13-14-11-21.. Последовательность маркеров как и в тесте на  http://www.nevgen.org/

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5641 : 07 Октябрь 2018, 12:25:53 »
Индийская, т.е. не славянская? ??? А к какой же подгруппе ее отнести, нет таких, получается , больше?  :o

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5993
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4191/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5642 : 07 Октябрь 2018, 12:40:42 »
Индийская, т.е. не славянская? ??? А к какой же подгруппе ее отнести, нет таких, получается , больше?  :o
:)
По 17 маркерам сложно что-то сказать более чем то что у вас  R1a. Отличить восточные субклады от европейских не получится. Для более углубленных результатов нужны более углубленные тесты.

Оффлайн Lesla

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 9628
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2923/-9
  • FTDNA: 154400 (Big Y - 283049)
  • Y-ДНК: R1a-YP682 (VK06+)
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5643 : 07 Октябрь 2018, 12:41:19 »
Индийская, т.е. не славянская? ??? А к какой же подгруппе ее отнести, нет таких, получается , больше?  :o
Индийская - это юмор такой.

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5644 : 07 Октябрь 2018, 13:54:45 »
Т.е. нужен тест с количеством маркеров в два и более раза больше, так? Получается, даже сказать, что у меня R1A1 никто не сможет без допобследования? Ну а какие-нибудь косвенные признаки? По отцовской линии были староверы, Смоленская обл, Сычевский район...

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5993
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4191/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5645 : 07 Октябрь 2018, 13:59:24 »
Т.е. нужен тест с количеством маркеров в два и более раза больше, так? Получается, даже сказать, что у меня R1A1 никто не сможет без допобследования? Ну а какие-нибудь косвенные признаки? По отцовской линии были староверы, Смоленская обл, Сычевский район...
Приведите пожалуйста значения своих маркеров вместе с названием.

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5646 : 07 Октябрь 2018, 14:44:25 »
извините, изображение не вставляется...
DYS456-16.0
DYS389|-13.0
DYS390-25.0
DYS389||-31.0
DYS458-15.0
DYS19-16.0
DYS385a/b-11.0, 14.0
DYS393-13.0
DYS391-10.0
DYS439-10.0
DYS635-23.0
DYS392-11.0
Y GATA H4-13.0
DYS437-14.0
DYS438-11.0
DYS448-21.0
« Последнее редактирование: 07 Октябрь 2018, 15:05:57 от Genda »

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5647 : 07 Октябрь 2018, 15:10:43 »
Обратил внимание, что не везде есть маркер DYS635, на некоторых ресурсах заводил результаты без него. Что это за маркер?

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2456
  • Страна: ua
  • Рейтинг +618/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5648 : 07 Октябрь 2018, 17:40:19 »
Обратил внимание, что не везде есть маркер DYS635, на некоторых ресурсах заводил результаты без него. Что это за маркер?
Маркер, как маркер. Просто ФТДНА его начала тестировать, когда появился тест на 111м. Соответственно,у тех, кто делал 37м или 67м, этот маркер не протестирован. Остальные 16 из 17м набора в 37м и 67м гаплотипах есть.

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5649 : 07 Октябрь 2018, 19:36:10 »
Это понятно, что на грош пятаков не получишь, но неужели 17 маркерный тест такой грубый? Сравнивал с другими"коллегами" по R1A, даже непосвященному виден разброс чисел....

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5650 : 10 Октябрь 2018, 20:44:11 »
А почему именно эти субсклады, интуиция, опыт? И , получается, чтобы  исследовать свою основную ветвь я могу сэкономить на маркерах, скажем заказать штук 20, но уже совершенно близких к теме, так, получается?
« Последнее редактирование: 10 Октябрь 2018, 22:39:04 от Genda »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5993
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4191/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5651 : 11 Октябрь 2018, 07:37:49 »
А почему именно эти субсклады, интуиция, опыт? И , получается, чтобы  исследовать свою основную ветвь я могу сэкономить на маркерах, скажем заказать штук 20, но уже совершенно близких к теме, так, получается?
Максимально глубоко уточнить свое положение на филогенетическом дереве можно двумя способами.
1) Тест NGS (Big Y, FGC, YSEQ и тп). Сразу все и без мороки, но дорого.
2) Определить макроветку, для которой существует снип-пакет. Для R1a существую следующие пакеты снипов:
- R1a-backbone - максимально подробно рассматривает макроветви R1a-M458 и R1a-L664. Совсем поверхностно R1a-Z280 и R1a-Z93
- R1a-Z284 пакет - проверяет только снипы ниже Z284
- R1a-Z280 пакет - проверяет только снипы ниже Z280
- R1a-Z93 пакет - проверяет только снипы ниже Z93
Определять макроветвь нужно для того, чтоб выбрать оптимальный снип-пак. Определиться можно или увеличением количества маркеров и/или заказом определенного снипа.
После определения макроветви заказывается нужный снип-пак.

Для R1a 17 маркеров _обычно_ малоинформативны. Минимальный набор для начала обычно рассматривают 37 маркеров. Иногда по ним со 100% уверенностью тоже не получается определить принадлежность к Z280 или Z93.
Бывает что сделали 111 маркеров и рядом с вашим гаплотипом есть кто-то, кто уже уточнил свою терминальную ветвь. В таком случае вам повезло и можно тестировать снипы уже точечно. И тд и тп

В вашем конкретном случае, можно протестировать снип Z280 или Z93 и про результату заказать R1a-Z280 или R1a-Z93 SNP Pack. Это если интересует только положение на дереве, те субклад. Если интересуют матчи (совпадения) по STR, то без увеличения количества маркеров никуда ни деться.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5993
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4191/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5652 : 11 Октябрь 2018, 07:41:49 »
извините, изображение не вставляется...
DYS456-16.0
DYS389|-13.0
DYS390-25.0
DYS389||-31.0
DYS458-15.0
DYS19-16.0
DYS385a/b-11.0, 14.0
DYS393-13.0
DYS391-10.0
DYS439-10.0
DYS635-23.0
DYS392-11.0
Y GATA H4-13.0
DYS437-14.0
DYS438-11.0
DYS448-21.0
Боюсь что тут и на 37, а возможно и на 67 маркерах не определить с уверенностью что будет Z80 или Z93. Я бы сказал что за Z93 60%, а за Z280 - 40%.

Оффлайн Genda

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • пытливый
  • Y-ДНК: R1a
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5653 : 11 Октябрь 2018, 14:50:05 »
Спасибо огромное за исчерпывающие ответы, но чем больше начинаешь пытаться понимать эту нелегкую науку, тем больше вопросов ::) В итоге, если я все же глубоко исследую ДНК, то все равно будут расхождения, типа  Z93 60%, а  Z280 - 40%, или какой-то из них будет уже 90%, а другой , соответственно 10%, но все равно вносящий свою лепту? ::)

Оффлайн Evgeny Kolchugin

  • Сообщений: 497
  • Страна: ru
  • Рейтинг +201/-0
  • Y-ДНК: R1a-Y82720; R1a-YP1698; R1a-YP578; R1a-Y16755
  • мтДНК: K1a1b; Т2
Re: Новички R1a: интерпретация, советы
« Ответ #5654 : 11 Октябрь 2018, 17:04:25 »
чем больше начинаешь пытаться понимать эту нелегкую науку, тем больше вопросов ::) В итоге, если я все же глубоко исследую ДНК, то все равно будут расхождения, типа  Z93 60%, а  Z280 - 40%, или какой-то из них будет уже 90%, а другой , соответственно 10%, но все равно вносящий свою лепту? ::)

Существует много разных типов мутаций. Два их них, STR (они же СТРы, они же маркеры) и SNP (они же снипы), используются для генеалогических целей.

Древо Y-хромосомы yfull.com/tree/ построено на основе снипов. Каждая гаплогруппа, каждый субклад внутри этого дерева привязан к определённому снипу.

Между маркерами и снипами существует определённая корреляция, но не абсолютная. Увеличивая количество маркеров в тесте, вы можете получать более и более точное предсказание своего субклада/снипа. Чтобы получить максимально точный ответ о вашем месте не древе Y-хромосомы/субкладе, надо напрямую проверять снипы. Либо выбирать снип-панель, которая просто проверяет предсказанный снип из известных снипов, либо делать Big Y или похожий тест, который позволит протестировать наличие у вас как известных, так и неизвестных (приватных) снипов.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.