АвторТема: Illumina - партнерская работа  (Прочитано 3866 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Illumina - партнерская работа
« : 29 Октябрь 2009, 08:20:32 »
Многие лаборатории (включая 23эндМи) работают с Иллюминой на партнёрских началах.
Стоимость теста по миллионой панели составляет около 160 долларов.
(Для примера, 23эндМи делает тест по полумиллионой панели.)
Иллюмина анонсировала скорый выпуск пятимиллионой панели, т.е. анализ родства будет ещё точнее и на большую глубину. Логично также ожидать снижение стоимости обработки по полумиллионой панели.

Источники?

Первый, сайт www.Illumina.com

Второй, человек из сертифицированной лаборатории в Монреале, с которым разговаривал только сегодня. Пытаюсь сделать обработку 200 образцов из России и Украины на халяву. Возможно подвесят к какому-нибудь аспиранту. Мне без разницы. Не славы ради, а истины для. :)

Ещё идейка - специализированная панель для диагностики рака. Это уже не баловстово, типа нашего общего увлечения - генеалогии.  :o

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Открытая база данных
« Ответ #1 : 30 Октябрь 2009, 17:12:55 »
Ещё один концепт, буквально витающий в воздухе. - Создание открытой базы данных с визуализацией этно-плотов, предиктом болячек и аналогом релфайндера.
Многие с разной степенью успешности над первой и третьей частью работают.
Идея: принимать raw-data от 23andMe, DeСodeMe, от собственной и др. лабораторий, сотрудничающих с Иллюминой. Короче говоря, от всех желающих. А затем всё это сравнивать и выдавать результаты анализа.

Оффлайн Grigoriev

  • Администратор
  • *****
  • Сообщений: 3116
  • Страна: ru
  • Рейтинг +187/-3
    • Молекулярная генеалогия
  • Y-ДНК: O3a3c
  • мтДНК: J1c
Re: Illumina - партнерская работа
« Ответ #2 : 30 Октябрь 2009, 17:26:32 »
Да, это все очень интересно!

Оффлайн napobo3

  • Сообщений: 1253
  • Страна: il
  • Рейтинг +344/-2
  • Y-ДНК: J-FGC5231
  • мтДНК: N1b2
Re: Открытая база данных
« Ответ #3 : 31 Октябрь 2009, 03:43:51 »
Ещё один концепт, буквально витающий в воздухе. - Создание открытой базы данных с визуализацией этно-плотов, предиктом болячек и аналогом релфайндера.
Многие с разной степенью успешности над первой и третьей частью работают.
Идея: принимать raw-data от 23andMe, DeСodeMe, от собственной и др. лабораторий, сотрудничающих с Иллюминой. Короче говоря, от всех желающих. А затем всё это сравнивать и выдавать результаты анализа.
ИМХО в область болячек лучше не лезть.
Все остальное - очень нужно.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Illumina - партнерская работа
« Ответ #4 : 31 Октябрь 2009, 07:44:48 »
Коллеги. вы вот это видели (см. по ссылке от Романа):

Нашел случайно вот это.
http://www.goldenhelix.com/SNP_Variation/HelixTree/index.html

Что за зверь так и не понял... скачал полазил и снес :)

Я так понял, можно строить сравнительные плоты. Был бы набор данных по популяциям.

Оффлайн Mich GlitchАвтор темы

  • Genus regis
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Illumina - партнерская работа
« Ответ #5 : 04 Июнь 2010, 19:20:11 »
Итак полный геном теперь можно сделать за каких-то 19 тысяч долларов:

Цитировать
Illumina finally drops their prices down to 19k . Which is a big discount from their previous prices. I think this is a good sign. There's even a special pricing of 9.5k if you have some special medical condition.

Дожидаемся снижения до 1000 и начинаем новую жиссь.

:)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.