Мурка - программа построения кладограмм, (Valery Z. и Ко)

[Centurion]

P.S. Валерий разрешение вроде как дал.

и очень доволен

Как назовете прогу? Можно сделать заставку и иконки

[Grigoriev]

Замечательные новости!!!
Респект Вам, друзья!

[Valery]

Ув. Вадим В.! Мне Вадим У. показал скрипт вызывающий Мурку, вроде как составлен с Вашей помощью. Я вдруг понял, что частая смена мною параметров (которая увы была необходимостью в последнее время) сделала свое нехорошее дело. У Вас потерялась опция UBRSPH - она не делает ничего нового, просто в последних трех версиях вызов с ней эквивалентен тому что было раньше без нее.

Еще можно рекомендовать BNDREPEATS2 и даже BNDREPEATS3 вместо BNDREPEATS1 но это уже дело вкуса и не столь жестко - эффект заметен не всегда.

[Grigoriev]

Вадим В. очень интересно! А этот продукт свободно распространяется?

[Centurion]

Вадим В. очень интересно! А этот продукт свободно распространяется?

Ты про что?

[Grigoriev]

Я про скрипт уважаемых Вадимов, который позволяет работать с Муркой...

[Centurion]

Я про скрипт уважаемых Вадимов, который позволяет работать с Муркой...

Ты что то не так понял. Вадим В. тут ни причем.

Это другой Вадим будет делать ГУИ интерфейс к Мурке.

Это скрипт параметров для Мурки

[wertner]

очень интересно! А этот продукт свободно распространяется?

Он еще не написан и не скоро будет написан Рано что-то решать о форме распостранения
Напишу - тогда с Валерой и решим. Он сторонник открытого софта, а у меня самого нет определенной точки зрения.
Там видно будет

[Grigoriev]

Я так понял, что помимо того интерфейса о котором ты говоришь, Валера упомянул про нечто еще...

[wertner]

Я так понял, что помимо того интерфейса о котором ты говоришь, Валера упомянул про нечто еще...

Нет. Просто мне Вадим Веренич помог с работающим набором параметров для Мурки, а Валера его слегка оптимизировал. Ну и сообщил об этом Вадиму.
К какому-либо новому скрипту или софту это сообщение Валеры не имело отношения.

[Grigoriev]

Ясно. Тогда умолкаю...

[Valery]

Ясно. Тогда умолкаю...

говори плиз не умолкая! хотя это все равно не компенсирует нам твоего отсутствия сегодня

[I2a1a]

Спасибо за замечание. Учтем, хотя после печального эксерзиса с построением "быстрого" дерева I я несколькл поостыл к методу MJ. Интуитивно склоняюсь к методу Вадима У. Думаю, если его оптимизировать, то его применение откроет новые перспективы. Возможно даже, что реконструируемые с его помощью филогении можно будет исторически объективно верифицировать.

Поживем - увидим.

Ув. Вадим В.! Мне Вадим У. показал скрипт вызывающий Мурку, вроде как составлен с Вашей помощью. Я вдруг понял, что частая смена мною параметров (которая увы была необходимостью в последнее время) сделала свое нехорошее дело. У Вас потерялась опция UBRSPH - она не делает ничего нового, просто в последних трех версиях вызов с ней эквивалентен тому что было раньше без нее.

Еще можно рекомендовать BNDREPEATS2 и даже BNDREPEATS3 вместо BNDREPEATS1 но это уже дело вкуса и не столь жестко - эффект заметен не всегда.

[Valery]

А нельзя ли взглянуть на исходные данные по I? Дело в том что MJ это только эвристика которую я применяю наряду с другими эвристиками, потому что сам по себе MJ с eps 0 для работы с У-овыми микросателлитами - крайне слабое средство. Нужно понять в чем причина проблемы - в парсимонии вообще или в слабости эвристики MJ. И то и другое вполне возможно.

[Valery]

Интуитивно склоняюсь к методу Вадима У.

Мы решили реализовать этот замечательный метод в бинарной программе, но это займет время.