Спасибо, а ссылочку на ваш предиктор где можно увидеть?
Это тот самый предиктор, про который Вы
спрашивали будут ли там O1, O2, O3, С3, С3с. В тестовом режиме субклады O1, O2, O3, С3 я добавил. Они пока откалиброваны только по 67-маркерным гаплотипам, но предсказывать более короткие тоже можно.
Думаю, на 17 (и 16) маркерах Y-Filer он работает неплохо, а вот более короткие гаплотипы привирает.
Вот ссылка на последнюю версию 1.0.2:
http://ifolder.ru/19335948Ее же Вы всегда можете найти в моей подписи.
По сравнению с предиктором Атея есть несомненное удобство: можно предсказывать до 200 гаплотипов за один раз.
В тоже время есть и несомненный недостаток: существует только offline-версия в виде отдельной программы, а online-версии пока нет.
2. У гаплотипов 39 и 56 - совпадение с гаплотипом N1b калмыка из работы Derenko et al. (2007).
Гаплотип 38 не совсем обычный для N1c. В статье Nasidze et al. (2005) упоминается единственный гаплотип N1c. Других кандидатур, кроме 38, не оказалось. По совокупности 17 локусов номер 38 - несомненно N1c.
3. Гаплотип 66 (19,389I,389II,390,391,392,393,385a,b,438,439,437,448,456,458,635,GATAH4(-1):
17-13-29-24-10-13-13-14,20-10-11-16-20-15-17-20-10.
Для сравнения гаплотипы корейцев О3-М122 (Kim et al., 2010):
17-13-29-24-10-13-13-15,20-10-13-15-20-15-15-21-10, разница 7 шагов,
17-13-29-24-10-13-13-14,20-10-13-15-20-15-15-21-10, разница 6 шагов,
17-12-30-24-10-13-12-14,20-10-11-15-20-15-16-21-11, разница 8 шагов.
Вполне возможно. Мой предиктор пока не откалиброван точно предсказывать по 17-маркерным гаплотипам гаплогруппы N1b, N1c, O3. Иногда он их видит, но в других случаях не решается предсказать, как с этими гаплотипами, останавливаясь на N и O.
Заметьте, именно N, а не N*(xN1b, xN1c) и O, а не O*(xO1, xO2, xO3).
То есть, он тут не спорит с Вами, а показывает более осторожное заключение.
4. Гаплотип 60 - согласен, что он относится к парагруппе L. Как я уже указывал, L включается в парагруппу К.
Отлично. Значит у меня с Вами осталось только одно расхождение.
5. Гаплотип 40:
13-13-28-23-10-16-13-13,18-11-11-14-22-16-16-23-8.
Нашел в YHRD.org 12-маркерный гаплотип сибо (Ляонин, КНР):
13-13-28-23-10-16-13-13,17-11-12-14-Х-Х-Х-Х-Х.
Но у него нет снипа. До статьи на китайском языке добраться не смог. Пришлось просмотреть более куцые гаплотипы сибо (Синьцзян, КНР) из статьи Xue et al. (2006). Нашел один гаплотип:
14-14-30-23-11-16-13-Х,Х-11-11-14-Х-Х-Х-Х-Х.
Отличие на 10 маркерах - 4 шага. Вот этот гаплотип и оказался N1*(xN1a,N1b,N1c).
Ваше мнение, Вадим?
Мне кажется, что эти 10 маркеров не такие показательные.
N есть даже на расстоянии 2 мутаций:
13-13-28-23-10-15-13-Х,Х-10-11-14-Х-Х-Х-Х-Х
К сожалению, не знаю его источника. Мне прислали в частном сообщении, без ссылки на источник.
Но и Q встречается на расстоянии 2 мутаций:
13-13-28-24-10-16-13-Х,Х-11-12-14-Х-Х-Х-Х-Х 180029
13-12-28-23-10-16-13-Х,Х-11-10-14-Х-Х-Х-Х-Х 68313
13-13-28-24-10-17-13-Х,Х-11-11-14-Х-Х-Х-Х-Х 79135
в
гаплогруппном проекте Q на FTDNAЕще я обратил внимание, что у всех N близких к гаплотипу 40, DYS19=14 (кроме приведенного мной, может он тоже Q?). В тоже время, указанные мной гаплотипы Q не имеют характерные отличительные мутации и как бы образуют облако вокруг гаплотипа 40. Что
косвенно указывает на принадлежность гаплотипа 40 к гаплогруппе Q.
Поэтому относить гаплотип 40 к N мне кажется несколько поспешным. На мой взгляд, вариант с Q более вероятен, но тоже преждевременен.
Тема: Статья Ж.Сабитова "Этногенез калмыков с точки зрения популяционной генетики" (Прочитано 10584 раз)