АвторТема: H1c15  (Прочитано 1119 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн B827656Автор темы

  • Сообщений: 130
  • Страна: us
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: R-FT289278
  • мтДНК: H1c15
H1c15
« : 27 Марта 2026, 23:05:14 »
На данный момент присвоена гаплогруппа H1c15
https://discover.familytreedna.com/mtdna/H1c15/story

Оффлайн Mikl1984

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 522
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
  • H2a1f4
Re: H1c15
« Ответ #1 : 27 Марта 2026, 23:45:15 »
На данный момент присвоена гаплогруппа H1c15
https://discover.familytreedna.com/mtdna/H1c15/story
Снипы дали? Fasta файл скачать можно?

Оффлайн B827656Автор темы

  • Сообщений: 130
  • Страна: us
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: R-FT289278
  • мтДНК: H1c15
Re: H1c15
« Ответ #2 : 28 Марта 2026, 00:09:41 »
На данный момент присвоена гаплогруппа H1c15
https://discover.familytreedna.com/mtdna/H1c15/story
Снипы дали? Fasta файл скачать можно?
Да, FASTA уже скачал, сегодня залью его на YFull  для более глубокой детализации субклада, если найдут.
По мутациям: помимо основных снипов группы, FTDNA выдал целый список экстра-мутаций . Из наиболее интересных — 12310.1A в кодирующем регионе, а также 16519T и целый куст вставок в HVR2 (309.1C, 315.1C, 522.1A, 522.2C).
На дерево в Discover меня пока не повесили, и база в Advanced Matches еще не синхронизировалась. В разделе MitoTree тоже пока статус "в анализе", так что полноценно пока нет полного результата.

Оффлайн Mikl1984

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 522
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
  • H2a1f4
Re: H1c15
« Ответ #3 : 28 Марта 2026, 07:25:51 »
Можно деньги и не тратить
Посмотреть https://mtcladefinder.yseq.net/
https://dna.jameslick.com/mthap/mthap.cgi
Китайцы дадут терминалку https://www.theytree.com/mttree/

Оффлайн B827656Автор темы

  • Сообщений: 130
  • Страна: us
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: R-FT289278
  • мтДНК: H1c15
Re: H1c15
« Ответ #4 : 28 Марта 2026, 07:47:29 »
Можно деньги и не тратить
Посмотреть https://mtcladefinder.yseq.net/
https://dna.jameslick.com/mthap/mthap.cgi
Китайцы дадут терминалку https://www.theytree.com/mttree/
Посмотреть https://mtcladefinder.yseq.net/ -это выдает  H1c и дрейф в сторону H1c6, вообще не угадали.

https://dna.jameslick.com/mthap/mthap.cgi этот лучше но глубже не дал. Ничего нового что выдал ФТДНА они не дали, а в перворм случае даже хуже результат
Best mtDNA Haplogroup Matches:

1) H1c15

Defining Markers for haplogroup H1c15:
HVR2: 263G 477C
CR: 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 12310.1A 15326G
HVR1:

Marker path from rCRS to haplogroup H1c15 (plus extra markers):
H2a2a1(rCRS) ⇨ 263G ⇨ H2a2a ⇨ 8860G 15326G ⇨ H2a2 ⇨ 750G ⇨ H2a ⇨ 4769G ⇨ H2 ⇨ 1438G ⇨ H ⇨ 3010A ⇨ H1 ⇨ 477C ⇨ H1c ⇨ 12310.1A ⇨ H1c15 ⇨ (309.1C) (315.1C)

Perfect Match! Your results are an exact match to this haplogroup.
Matches(9): 263G 477C 750G 1438G 3010A 4769G 8860G 12310.1A 15326G
Extras(0): (309.1C) (315.1C)
Китайцы дадут терминалку https://www.theytree.com/mttree/ -этим еще не кидал, они вроде с мт не очень то и дружат

Оффлайн Mikl1984

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 522
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
  • H2a1f4
Re: H1c15
« Ответ #5 : 28 Марта 2026, 09:34:05 »
Нормально китайцы дружат, попробуйте
База по современным маленькая, зато древних больше других

Оффлайн B827656Автор темы

  • Сообщений: 130
  • Страна: us
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: R-FT289278
  • мтДНК: H1c15
Re: H1c15
« Ответ #6 : 28 Марта 2026, 09:59:36 »
Нормально китайцы дружат, попробуйте
База по современным маленькая, зато древних больше других
Да что то я их победить не могу, один файл режектнули, второй уведомили что перенесли в прочее ( хз где это), я им на почту заслал третий раз и плюнул. По ветке у них 2 образца всего, вся база на Н и Н1с ближняя.
С другой стороны и на YFull всего 9 образцов включая меня и из них три научных, то есть 5 человек на этом узле в чистом виде
H1c15 C12305CA TMRCA 400 ybp
id:YF145247RUS [RU-KYA] rus new
id:YF122919
id:YF119905
id:YF118586
id:YF082744BLR [BY-BR]bel
id:JQ702336.1
id:JQ703551.1
id:JQ704909.1
id:YF007867
 ::) :o

Оффлайн Mikl1984

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 522
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
  • H2a1f4
Re: H1c15
« Ответ #7 : 28 Марта 2026, 11:58:22 »
Бросьте мне, если не получается
У них не самый понятный интерфейс
У меня десятки тестов залиты без проблем

Оффлайн Mikl1984

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 522
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
  • H2a1f4
Re: H1c15
« Ответ #8 : 28 Марта 2026, 22:21:20 »
С другой стороны и на YFull всего 9 образцов включая меня и из них три научных, то есть 5 человек на этом узле в чистом виде
Что с русскими негусто, на ftdna нет вообще явных
В Г... всего 8 за год нашлось
H1c15
400 лет назад
A. K.
А. С. А.
К. К.
Л. К.
М. И. С.
Е. Е.
С. С.
Н. Г. Б.

Оффлайн B827656Автор темы

  • Сообщений: 130
  • Страна: us
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: R-FT289278
  • мтДНК: H1c15
Re: H1c15
« Ответ #9 : 28 Марта 2026, 23:44:31 »
Бросьте мне, если не получается
У них не самый понятный интерфейс
У меня десятки тестов залиты без проблем

Михаил, спасибо за предложение помощи! Обязательно буду иметь в виду, если что-то пойдет не так.
Вчера отправил файл в формате fasta китайцам на почту напрямую. Пока жду от них подтверждения, что всё получено и взято в обработку. Пока тишина.
По YFull: сейчас данные в процессе анализа. Как только статус сменится, планирую выгрузить результат (в VCF или очищенном fasta — посмотрим, что они выдадут на выходе) и уже его залить на TheYTree. Хочу свести все данные под один аккаунт. Как только закрою текущие этапы и придут результаты Big Y-700, буду заказывать у китайцев T2T Upgrade. Хочу выжать из имеющегося массива максимум.
Что касается ветки H1c15 — по СНГ данных действительно пока негусто. Суммарно по мтДНК у меня 74 совпаденца из них человек 8-10 наших, но если смотреть по Ancestor Origin и Haplogroup Origin, картина вырисовывается интересная: основной массив уходит в Западную Европу и Северную Америку.
География в основном такая: Франция (самый крупный кластер), Канада (в основном Квебек) и Британия. На первый взгляд всё это очень напоминает классические пути миграции викингов: сначала экспансия в Нормандию, затем их потомки при колонизации Нового Света, ну и «норманнский след» в Британии после 1066 года. По крайней мере, на мой взгляд, такая историческая логика сейчас выглядит наиболее вероятной, если так, навскидку, не копаясь глубоко.
Кстати, мне кажется, по Франции реальное присутствие ветки может быть в разы выше. Насколько я знаю, сдать тест там официально почти нереально т.к коммерческая генетика под запретом и штрафы до 3750 евро. Так что те немногие французы в базах это, скорее, такие партизаны, кто умудрился вывезти образцы за границу. Причем география их кластеров (Нормандия и Бретань) как раз вроде совпадает с зонами, где в 9–10 веках оседали скандинавы. Вижу в этом логичный вроде норманнский след, по крайней мере, картинка у меня складывается.
Да и в целом, мой текущий топ совпаденцев по мт (после чистки дублей) эту географию подтверждает: на первом месте Франция и Канада (Квебек) — это почти половина всех матчей. Дальше идут Украина и Польша , Британия, США, Германия и немного Скандинавии.
Анализ фамилий и имен французских совпаденцев и их предков тоже дает  лишний плюс в теорию: они в самой Франции очень четко кластеризуются по регионам, которые традиционно считаются норманнскими.

Оффлайн Mikl1984

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 522
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
  • H2a1f4
Re: H1c15
« Ответ #10 : 29 Марта 2026, 07:01:51 »
Не советую использовать  fasta из yfull, находил у них ошибки в  pipeline

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6502
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4900/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: H1c15
« Ответ #11 : 29 Марта 2026, 15:25:32 »
Не советую использовать  fasta из yfull, находил у них ошибки в  pipeline
Приведите пример.

Оффлайн Mikl1984

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 522
  • Страна: ru
  • Рейтинг +144/-0
  • H2a1f4
Re: H1c15
« Ответ #12 : 29 Марта 2026, 17:04:26 »
Юле писал, запощу переписку в правильной теме с примерами fasta
Просто занимался этим в январе, ждал full mito тещи в ftdna для следущего погружения в тему, но первая попытка оказалась неудачной :(

Оффлайн B827656Автор темы

  • Сообщений: 130
  • Страна: us
  • Рейтинг +39/-0
  • Y-ДНК: R-FT289278
  • мтДНК: H1c15
Re: H1c15
« Ответ #13 : 30 Марта 2026, 02:02:16 »
С другой стороны и на YFull всего 9 образцов включая меня и из них три научных, то есть 5 человек на этом узле в чистом виде
Что с русскими негусто, на ftdna нет вообще явных
В Г... всего 8 за год нашлось
H1c15
400 лет назад
A. K.
А. С. А.
К. К.
Л. К.
М. И. С.
Е. Е.
С. С.
Н. Г. Б.
Кстати по густоте:
The H1c15 maternal line was formed when it branched off from the ancestor H1c and the rest of humankind around 3250 BCE.
The woman who is the most recent common ancestor of this line is estimated to have been born around 350 CE.
She is the ancestor of at least 20 descendant lineages known as H1c15a, H1c15+16519 and 18 yet unnamed lineages.
There are 77 DNA tested descendants, and they specified that their earliest known origins are from:
France,Canada,England, and 5 other countries

То есть у этой ветки на данный момент всего две известные линии. В FTDNA Discover по одной линии числятся три человека, по второй — двое. Вероятно, я стану третьим во второй группе, так как у меня подтверждена мутация 16519.
Конечно, есть шанс, что MitoTree копнет еще глубже и выделит подветку ( тогда вообще 1-2 буду), но пока самая радужная перспектива — это оказаться втроем на ветке H1c15+16519. Вот это я понимаю "густота" населения!  ::) ;D

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6502
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4900/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: H1c15
« Ответ #14 : 30 Марта 2026, 18:54:15 »
Юле писал, запощу переписку в правильной теме с примерами fasta
Просто занимался этим в январе, ждал full mito тещи в ftdna для следущего погружения в тему, но первая попытка оказалась неудачной :(
Речь идет об образце с мито H2a1f4*? Позиция 9101? Там же все просто, никакой ошибки нет. И как я понимаю, вам это объяснили. Зачем тогда вводите людей в заблуждение?
В вашем случае имеет место быть достаточно редкое явление, называемое гетероплазмией. Обычная de novo мутация, эволюция в действии на примере конкретного человека.
В этом конкретном случае имеем 183T 99C, то есть ~1/3 с мутацией, а 2/3 без мутации. Записывается это так: 9101Y (C or T).
В дальнейшем, эта мутация может закрепиться или исчезнуть. Так что философский вопрос, она есть в данный момент или нет? Учитывая процентовку мутированного значения. Кто-то такие мутации не учитывает и ставит референсное значение в позиции. Кто-то считает что мутация есть и ставит derived аллель. YFull в данном случае поступает взвешенно, и ставит в этой позиции при генерации FASTQ значение "N" (any base). Такой подход оправдан тем, что исходниками зачастую являются результаты NGS, что имеет свои особенности, в отличии от других методов, того же Сэнгера. К примеру у человека могут быть NUPTs - куски mtDNA законсервированные в аутосомах, которые при выравнивание ложаться на мито и дают видимость загрязнения.
Почитайте литературу, полезно для общего развития.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.