Расчёт возраста предка двух субкладов

[Centurion]

Кстати, Роман,

Обрати внимание, что ВБОП и точка коалисценции у J2b2 практически совпадают (1500-1000 г.д.н.э). О чем бы это могло свидетельствовать? Троянская война? Вторжение дорийцев?

когда В.Урасин строил дерево у него получился порядка 2200 до н э
ТНТ выдало порядка 7500 от наших дней

[I2a1a]

Кстати, Роман,

Обрати внимание, что ВБОП и точка коалисценции у J2b2 практически совпадают (1500-1000 г.д.н.э). О чем бы это могло свидетельствовать? Троянская война? Вторжение дорийцев?

когда В.Урасин строил дерево у него получился порядка 2200 до н э
ТНТ выдало порядка 7500 от наших дней

Возраст всей гаплогруппы или точки коалисценции (времени экспансии) группы?

[Centurion]

Все равно мне кажется что скрипт КН что-то не так посчитал. Во-первых я не могу понять по какой методике отбирать для расчета гаплотипы. Кто-нить знает? Разумеется чем больше тем лучше, и точно нельзя разное кол-во?

[I2a1a]

Лучше отбирать статистически наиболее отличающиеся гаплотипы. А то вместо возраста всей гаплогруппы будет просчитан возраст субсета гаплотипов, имеющих более недавнего предка.

[I2a1a]

Кстати, Роман,

Обрати внимание, что ВБОП и точка коалисценции у J2b2 практически совпадают (1500-1000 г.д.н.э). О чем бы это могло свидетельствовать? Троянская война? Вторжение дорийцев?

когда В.Урасин строил дерево у него получился порядка 2200 до н э
ТНТ выдало порядка 7500 от наших дней

Во-первых, там совсем другие принципы расчета (по ро-статистике). Точность этого метода зависит только от достоверности топологии полученного дерева.
Во-вторых, если возраст гаплогруппы J2b2 (по ро-статистике) 7500 , то это означает только возраст терминального узла гаплогруппы, близкого к межсубкладовой точке разделения - примерно 8200 лет назад.

[Centurion]

Вот смотри, я взял сильно различающиеся 3 гаплотипа одного клада и 3 другого (те, которые есть) и получилось вот что:

Sasd(A)   Gacoal =   170,35      
Sasd(B)   Gbcoal =   168,55

GABw=   406,69                                             
GABw=   451,77      SigmaG=   107,17

по ходу это на порядок больше, чем у тебя до этого

а что будет если я возьму еще 3 других и тд - возраст будет прыгать постоянно - так?

[I2a1a]

Правильно,
Возраст вырос  - вместо примерно 8200  стало 9200. Но заметь, что и сигма поправка выросла -вместо 2100 стало 2700. Как видно, сигма-интервалы обеих значений (8200-9200) пересекаются.

[I2a1a]

Вот смотри, я взял сильно различающиеся 3 гаплотипа одного клада и 3 другого (те, которые есть) и получилось вот что:

Sasd(A)   Gacoal =   170,35      
Sasd(B)   Gbcoal =   168,55

GABw=   406,69                                             
GABw=   451,77      SigmaG=   107,17

по ходу это на порядок больше, чем у тебя до этого

а что будет если я возьму еще 3 других и тд - возраст будет прыгать постоянно - так?

Разумеется будет. Но по логике, всегда будет оставаться  в  одном сигма-интервале.
Если только гаплотипы действительно принадлежат к одному субкладу.

[Centurion]

Откуда 9200?

451.77x25=11294.25

[I2a1a]

Откуда 9200?

451.77x25=11294.25

А, ну да. Автоматом вычел 2000 лет.

[I2a1a]

Все равно, интервалы пересекаются (как и должно быть)
Верхний интервал одного возраста пересекается с интервалом другого
8192+2010 = 10292
11294-2700=8594

Это статистические флуктуации. Возраст точки ветвения субклада J2b1 и J2b2 составит примерно 9000 лет. С увеличением или уменьшением размера и статистических особенностей выборки, возраст будет флуктуировать вокруг этого значения. Что ж здесь странного?

[Centurion]

озраст точки ветвения субклада J2b1 и J2b2 составит примерно 9000 лет.

Это возраст J2b, но ведь пока не ясно ветвление... какая ветка первой ответвилась от ствола.

[I2a1a]

озраст точки ветвения субклада J2b1 и J2b2 составит примерно 9000 лет.

Это возраст J2b, но ведь пока не ясно ветвление... какая ветка первой ответвилась от ствола.

Метод interclade age ответ на этот вопрос не даст. Оценку вероятности, какая ветвь ответвилась раньше способен дать только филогенетический анализ, у которого, как известно есть свои недостатки.

[Farroukh]

Вадим, такой вопрос: есть гаплотип E1b1b1a2 и E1b1b1a* без нисходящих(хE1b1b1a1 и пр.). Берём их и считаем кросс-дисперсию. Что за возраст мы получим? Возраст предковой для обоих E1b1b1a или время отпочкования ветви E1b1b1a2?

[Centurion]

E1b1b1a* без нисходящих(хE1b1b1a1 и пр.)

Исключая все субклады? Он может быть еще не выделившийся субклад.