Насколько я с моим незнанием английского понял Нордтведта, он говорит именно о полном расстоянии между двумя гаплотипами. Допустим, я сравниваю свой гаплотип и Ваш: "так, как будто бы Вы были моим предком или же моим потомком".
Теперь о разном числе поколений. Допустим, мы померяли шагами коридор с юга на север, а потом с севера на юг. По логике, расстояние одно и то же, но число шагов получится немного разным. Но мы хотим перевести расстояние в метры, поэтому число шагов умножаем на идеализированную длину шага, а число шагов лучше всего усреднить. Так и с поколениями: там где исключена всякая документальная проверка, мы пользуемся идеализированным числом лет в поколении, и в том, что на маршруте, заведомо постоянном в годах, обнаруживаем разное число мутаций, виновато (кроме случайного характера мутаций) в какой-то мере непостоянство поколения: в одном роду была традиция ранних браков (для мужчин), в другом - поздних. Приходится относиться к этому как к белому шуму.
А уж если мы хотим знать, сколько лет назад жил наш с Вами общий предок, придется делить дистанцию пополам: Нордтведт за нас этого сделать не захотел. Не надо ему это.