Аутосомный тест - вопросы чайника

[Srkz]

Я не это сказал. Я имел в виду другое - что когда есть потенциальные совпадения якобы на уровне 5юродных, полногеномный тест по идее смог бы дать более точную негативную селекцию.

Да, я немножко уже ушёл в собственные аналогии и домыслы. Помню, что мы и раньше обсуждали вопрос, но не помню деталей, так что просто изложу, как сам это вижу. Что касается негативной селекции, смотрю на это так - кусок общей ДНК есть кусок общей ДНК, куда от этого деться Даже если он составной, то его составляющие тоже получены от неких общих предков.
Можно, наверное, улавливать отдельные относительно недавние мутации внутри одного куска, которые с совпаденцем из соседней деревни имеются, а с совпаденцем из другого региона их нет. Значит, с человеком из соседней деревни родство более близкое (ну или наоборот, если окажется наоборот ).

Когда-то делал моделирование, насколько вообще могут сохраняться общие сегменты с ходом времени? Получилось, что некий фоновый уровень общности внутри популяции будет сохраняться. В зависимости от её параметров он оказывается выше или ниже. А поскольку процесс вероятностный, то будут и статистические выбросы ещё более длинных общих сегментов.

Кроме того, с точки зрения статистики говорить о совпадениях на уровне пятиюродных вообще бессмысленно. Если взять известный график (который с моей точки зрения не совсем показательный по конкретным значениям, но для иллюстрации идеи подойдёт)

то близкие совпадения формируют чётко выраженные горбы с крутыми склонами. И тут можно делать выводы в духе "пересечение 1800 сМ это именно группа B". Однако уже группа D не достигает 100% вероятности ни в одной точке. А дальние горбы просто размазываются вниз куда-то очень далеко и все перекрывают друг друга. И можно говорить "с максимальной вероятностью тут 5-юродность", но сама по себе эта вероятность небольшая. А по сути, уровень родства в дальней зоне может быть почти любым.

[Penny]

Кроме того, с точки зрения статистики говорить о совпадениях на уровне пятиюродных вообще бессмысленно. Если взять известный график (который с моей точки зрения не совсем показательный по конкретным значениям, но для иллюстрации идеи подойдёт)

Отличный график. Хорошо объясняет этнофон. Шестиюродность с ненулевой вероятностью по нему уже на 100сМ проявляется. Десятиюродность где-то на 20-40сМ. Это объясняет большинство иностранцев и остальных неизвестных совпаденцев, учитывая миллионы протестировавшихся.

[grazie]

Аутосомный матч у меня с совпаденцем и отсутствие матча с тем же человеком у моего родителя означает, что совпаденец ложный?

[Farroukh]

Также может означать, что родство с этим совпаденцем идёт по линии второго родителя.

[Елена Александровна]

Аутосомный матч у меня с совпаденцем и отсутствие матча с тем же человеком у моего родителя означает, что совпаденец ложный?

Или по второму родителю, или, что гораздо редко - на половину от одного и второго родителя - родственные сегменты в нас соединяются.
У меня такие люди есть. Но их не много.
Удалось это установить - когда были сделаны аутосомы, не только меня и мамы, но и родного отца.
А как это бы я узнала, если бы протестировала не отца, а его сестру или брата?

[chekabys]

Приветствую! Как из необработанных аутосом получить данные для работы с vahaduo g25?

[Faraon30]

X match 12 см о каком родстве говорит?

[Faraon30]

X match 12 см о каком родстве говорит?

Понятно, что родство небольшое, но оно обязательно по линии матери, верно?

[AleksG]

X match 12 см о каком родстве говорит?

Понятно, что родство небольшое, но оно обязательно по линии матери, верно?

Если вы мужчина, то да.

[Faraon30]

X match 12 см о каком родстве говорит?

Понятно, что родство небольшое, но оно обязательно по линии матери, верно?

Если вы мужчина, то да.

Да. Но в принципе может и не быть вообще никакого родства? А то географически как-то маловероятно получается.

[gecube_ru]

Но в принципе может и не быть вообще никакого родства?

может и никакого...

[cheremis]

Можете прайс лист фирмы в Казани глянуть ? Есть ли там тест на аутосомы ? Смогу ли я к ним с флешкой полногенома придти и сделать его, как думаете ? https://kazan.dnk-otcovstvo.ru/tseny/

[Georg]

Можете прайс лист фирмы в Казани глянуть ? Есть ли там тест на аутосомы ? Смогу ли я к ним с флешкой полногенома придти и сделать его, как думаете ? https://kazan.dnk-otcovstvo.ru/tseny/

все тесты там убогие str'ные, а полногеном - "сниповые"  (хотя на yfull при анализе вручную Y хромосомы можно получить STR'ный вариант).
Так что им ваш полногеном совершенно не нужен.
Если хотите отцовство, то проще сдать у них 2 теста (вас и ребенка) , сэкономить не получится. Да юридическое заключение не делают по результатам полногенома в сравнении с тестами других стандартов.

[cheremis]

Можете прайс лист фирмы в Казани глянуть ? Есть ли там тест на аутосомы ? Смогу ли я к ним с флешкой полногенома придти и сделать его, как думаете ? https://kazan.dnk-otcovstvo.ru/tseny/

все тесты там убогие str'ные, а полногеном - "сниповые"  (хотя на yfull при анализе вручную Y хромосомы можно получить STR'ный вариант).
Так что им ваш полногеном совершенно не нужен.
Если хотите отцовство, то проще сдать у них 2 теста (вас и ребенка) , сэкономить не получится. Да юридическое заключение не делают по результатам полногенома в сравнении с тестами других стандартов.

не , я просто аутосомы хочу , ну сколько чего во мне понамешано. Искал ближайший город где сделать , полногеном у меня есть. Всё таки в Москву надо ?

[cheremis]

[ ]не , я просто аутосомы хочу , ну сколько чего во мне понамешано. Искал ближайший город где сделать , полногеном у меня есть. Всё таки в Москву надо ?

В Ваших результатах уже есть аутосомы, их поосто надо извлечь.

да мне расписали как сделать , у меня ничего не вышло