Добрый день! Рассматриваю вот такое совпадение
Есть 3 участка от 7 сМ ничего особенного, посмотрела выборку на 3 сМ привекло внимание, что в 6 хромосоме при 3,6 сМ у нас 6788 SNP имеет ли это существенное значение? Также есть еще при маленьких сегментах есть более плотные снипы. С совпаденцем пересекаемся по местности, по 6 хромосоме участки как раз возможные по данному гео. В этом случае рассматриваю результаты примерно от 5-6 поколения, подтвердить возможное проживание общих предков на рассматриваемой общей территории. Таблица от 3 сМ:
Chr B37 Start Pos'n B37 End Pos'n Centimorgans (cM) SNPs Segment threshold Bunch limit SNP Density Ratio
1 236 195 181 237 227 726 3,4 197 194 116 0,22
2 6 994 777 8 102 347 3,6 220 175 105 0,27
2 8 563 326 9 640 526 3,1 190 189 113 0,29
2 17 997 242 20 738 648 3,4 449 180 108 0,22
2 59 563 744 64 936 472 3,5 715 191 115 0,27
2 98 989 700 104 300 782 4 600 181 108 0,21
2 108 946 178 113 444 837 3,3 387 190 114 0,23
2 129 284 155 131 904 064 3,4 280 180 108 0,23
2 192 525 536 196 945 385 3,2 423 223 134 0,25
2 218 782 054 220 667 933 3,2 239 173 104 0,23
3 61 412 991 63 350 194 3,5 407 222 133 0,27
4 69 978 901 73 443 109 3,3 439 235 141 0,25
4 89 279 969 92 225 277 3,4 515 192 115 0,3
4 182 120 631 183 661 673 4,5 439 209 125 0,28
4 185 515 952 186 457 961 3,5 222 194 116 0,32
5 161 693 420 164 400 356 3,4 403 200 120 0,27
5 169 643 566 171 103 318 3,5 331 215 129 0,33
6 25 039 602 32 921 104 3,6 6 788 259 155 0,5
6 166 227 582 167 541 185 4,4 358 219 131 0,28
8 52 416 912 54 991 386 3,4 370 233 140 0,29
8 55 324 791 58 769 671 3,6 535 218 130 0,29
9 17 918 806 21 498 666 5,4 479 215 129 0,2
9 26 078 764 31 307 968 6,5 645 234 140 0,2
9 129 471 897 131 976 508 3,6 237 223 134 0,24
10 28 783 350 30 344 067 3,7 397 222 133 0,32
11 1 040 790 2 059 997 3,2 259 200 120 0,38
12 20 713 699 22 977 975 3,4 331 227 136 0,21
12 76 109 814 78 281 801 3 330 227 136 0,26
12 110 279 866 114 219 549 3,1 476 248 149 0,33
13 93 535 466 99 049 254 8,8 759 231 139 0,23
13 105 655 752 107 630 055 5,5 363 214 128 0,25
15 95 888 064 97 553 434 5,6 298 211 126 0,25
16 107 275 2 892 770 7,9 362 228 136 0,21
16 19 353 372 22 792 413 4,5 307 245 147 0,25
16 77 647 073 79 199 894 5,7 407 228 137 0,22
16 79 271 549 81 505 352 6,4 474 212 127 0,22
19 13 518 462 15 115 678 3,4 217 214 128 0,25
19 42 147 477 45 235 269 3,5 324 232 139 0,26
20 56 775 241 58 183 088 4 263 214 128 0,26
21 20 993 809 22 886 165 4 307 226 135 0,25
21 34 888 621 38 126 507 7,1 540 210 126 0,26
21 39 916 756 41 415 044 3,5 258 202 121 0,23
22 22 440 788 25 010 855 6,2 285 220 132 0,2