АвторТема: Степень родства и общие сегменты  (Прочитано 978 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Онлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 13562
  • Страна: az
  • Рейтинг +3391/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Степень родства и общие сегменты
« : 19 Январь 2020, 21:01:23 »
Зависимость количества и длины сегментов:

Parent/Child - родитель/ребёнок
Sibling - братья/сёстры
GP/GC - дед-бабка/внуки
Avuncular - дядя-тётя/племянники
1st cousin - потомки общего деда/бабки (родство во втором поколении)
2st cousin - потомки общего прадеда/прабабки (родство в третьем поколении)
...



Онлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 13562
  • Страна: az
  • Рейтинг +3391/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f
Re: Степень родства и общие сегменты
« Ответ #1 : 12 Апрель 2021, 06:51:43 »
- Необходимо учитывать неравновесное сцепление генов, при панелях более 30 000 снипов, особенно в некоторых популяциях. В цитированной статье отмечается, что особенно для финнов высока вероятность ложных совпадений – включение совпаденца при отсутствии близкого/ожидаемого родства.
- Вычисленные сегменты в 1-2 сМ на самом деле результат слияния мелких сегментов от 0,2 сМ и более.
- Ancestry показала, что и более длинные сегменты, даже до 50 сМ, могут наследоваться от общей популяции.
- Ancestry показала, что вычисленные сегменты в тройках мать-отец-ребенок могут не совпадать до 30 сМ, несовпадение с вероятностью 50% при длине 6 сМ.

- Теоретическая вероятность несовпадения ДНК для четвероюродных братьев и сестер – 2%, для пятиюродных – 30%. На практике – из анализа данных в 23andme удалось определить 90% четвероюродных и 46% пятиюродных.
- Использование полногеномного секвенирования может улучшить предсказания степени родства. Возможно увеличение на 5-15% в определении дальних роственников. Девятиюродные и десятиюродные родственники могут быть определены по редким генетическим вариантам, снипам, в результатах полногогеномного секвенирования.

- Предсказание степени родства осложняется эндогамией и редукцей предков. Все европецы связаны между собой в пределах 1000 лет. Два европейца из близких популяций разделяют от 2 до 12 генетических предков за последние 1500 лет и более 100 генетических предков за последнюю 1000 лет, с существенными региональными отличиями в степении разделения. Для единичного сегмента в 10 сМ сложно оценить возраст и определить степень родства. У евреев-ашкенази существенное разделение сегментов более 3 сМ и 5 сМ. Высокая степень разделения сегментов была обнаружена и у якутов.

https://www.fsigenetics.com/article/S1872-4973(21)00013-2/fulltext#secsect0010
« Последнее редактирование: 12 Апрель 2021, 08:43:38 от Farroukh »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100