АвторТема: Тест Полная mtDNA в Genotek  (Прочитано 1020 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mikl1984Автор темы

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +67/-0
  • H2a1f4
Тест Полная mtDNA в Genotek
« : 10 Октября 2025, 17:20:08 »
Попал в группу альфа тестеров нового сервиса
Мой тест тогда еще не был готов, потому дали данные по теще, бесплатно
Так как для наполнения собственной базы Генотек с начала года делал Fullmito всем, результат D5a3a1a не улучшился
Но дали файл .fa
Загрузил его на yfull, сейчас уже дерево перестроилось, но не углубилось https://www.yfull.com/mtree/D5a3a1a/
Результатов очень мало :(
Тут https://discover.familytreedna.com/mtdna/D5a3a1a/story тоже не много, но есть субклады
На Genotek было больше сотни совпаденцев, пока месяц назад их не закрыли
Так как они следуют дереву yfull, то и не появятся, если только не договорятся о заливке своих результатов

Кстати, тещин тест обработали в июне, мой сентябрьский был уже с усеченной гаплой H2a1
Базу похоже наполнили


Оффлайн Mikl1984Автор темы

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +67/-0
  • H2a1f4
Re: Тест Полная mtDNA в Genotek
« Ответ #1 : 26 Ноября 2025, 17:01:08 »
Ftdna хвалится сильным улучшение своего mt дерева
Стоит сделать mtDNA Now $109 with BLACKFRIDAY20 для попадания в их более ветвистое дерево, чем yfull?

Оффлайн Mikl1984Автор темы

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +67/-0
  • H2a1f4
Re: Тест Полная mtDNA в Genotek
« Ответ #2 : 02 Января 2026, 14:26:38 »
задавил жабу и заказал mtDNA в ftdna для тещи
Не удовлетворился качеством Г..., получились сильно разные результаты с WGS дочки https://forum.molgen.org/index.php/topic,11729.msg625806.html#msg625806
Да и хочется попасть поглубже, на yfull нет субкладов пока

Оффлайн Mikl1984Автор темы

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +67/-0
  • H2a1f4
Re: Тест Полная mtDNA в Genotek
« Ответ #3 : 07 Января 2026, 21:47:44 »
Если доверять тесту Г... , то попадет в эту ветку к разным прочим шведам :)
https://discover.familytreedna.com/mtdna/D5a3a1a%2B146/scientific?section=variants
Вот что говорит анализ yfull того теста
Covered regions: 1-522, 525-16569
All covered bp: 16566 from 16569
No covered bp: 3 from 16569
Diffs from RSRS: 49
Diffs from rCRS: 48
Private mutations count: 11

Несоответствия: C146T!!, C150T, C152T!!, C195T!!, T310TC, T489C, C522CAC, A16182C, A16183C, T16187C
Дополнительно: T1187C
Не на MTree: T146C!, T150C!, T152C!!!, T195C!!!, TC310T!, C489T!, CAC522C!, T1187C, C16182A!, C16183A!, C16187T!


Оффлайн Mikl1984Автор темы

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +67/-0
  • H2a1f4
Re: Тест Полная mtDNA в Genotek
« Ответ #4 : 08 Января 2026, 10:35:04 »
Решил посмотреть, что пишет G... в Научных данных
Непривычная запись, порядок и деление
Expected and Included
!A12406G
!A13359G
!A13889G
!A14560G
!A15148G
!A15355G
!A1709G
!A2056G
!A2706G
!A4048G
!A5471G
!A5821G
!A6023G
!A709G
!A8065G
!A9755G
!C10101T
!C10324T
!C11770T
!C12189T
!C13095T
!C13656T
!C15191T
!C16209T
!C2831G
!C4856T
!C5580T
!C6266A
!C6641T
!C8503T
!C9325T
!C9329G
!G10750A
!G11590A
!G15649A
!G189A
!G8021A
!G827A
!G8718A
!T10307C
!T12474C
!T15295C
!T15443C
!T15667C
!T16148C
!T16169C
!T2523C
!T3909C
!T4904C
!T4940C
!T5387C
!T5840C
!T6452C
!T7650C
!T7868C
!T7891C
!T8406C
!T8455C
!T8461C
!T8943C
!T9869C
A1018G
A10397G
A10688G
A11914G
A12026G
A16129G
A247G
A2758G
A3702G
A5301G
A7521G
A769G
A825T
A9180G
C10400T
C10810T
C10915T
C146T
C150T
C152T
C16311T
C16360T
C195T
C2885T
C4883T
C5178A
C752T
G13105A
G13276A
G13759A
G15043A
G15301A
G16230A
G4104A
G7146A
G8838A
T10664C
T1107C
T11944C
T13506C
T13650C
T14783C
T16126C
T16136C
T16187C
T16189C!
T16278C
T16362C
T182C!
T3594C
T4312C
T489C
T7256C
T8468C
T8655C
Expected But Not Included
C16189T
!A15043G
!C16362T
C182T
!C16187T
Самое интересное в конце
Local Private Mutations
A11914G!!
A16129G!!
A16183C
C146T!!
C152T!!
C16311T!!
C195T!!
G15301A!!
T1187C
T16187C!!
T16278C!!
T310TC
Global Private Mutations
A302ACC
C16519T
Вобщем пользоваться пока очень проблематично
Вот как выглядит список по этому файлу у yfull
G level age mutation region segment rate ancestral derived
1187 D5a3a1a <=1800 T1187C CR 12S_rRNA ***** T C
489 D5a3a1a <=1800 C489T! HVR2 HVS-III **** C T
16187 D5a3a1a <=1800 C16187T! HVR1 HVS-I **** C T
146 D5a3a1a <=1800 T146C! HVR2 HVS-II *** T C
150 D5a3a1a <=1800 T150C! HVR2 HVS-II * T C
152 D5a3a1a <=1800 T152C!!! HVR2 HVS-II * T C
195 D5a3a1a <=1800 T195C!!! HVR2 HVS-II * T C
310 D5a3a1a <=1800 TC310T! HVR2 HVS-II * TC T
522 D5a3a1a <=1800 CAC522C! HVR2 HVS-III * CAC C
16182 D5a3a1a <=1800 C16182A! HVR1 HVS-I * C A
16183 D5a3a1a <=1800 C16183A! HVR1 HVS-I * C A
8838 D5a3a1a 1800 G8838A CR ATP6 ***** G A
16136 D5a3a1a 1800 T16136C HVR1 HVS-I **** T C
16126 D5a3a1-a 8200 T16126C HVR1 HVS-I ** T C
3702 D5a3a1 10600 A3702G CR ND1 ***** A G
13759 D5a3a 13100 G13759A CR ND5 *** G A
16360 D5a3 15500 C16360T HVR1 HVS-I **** C T
752 D5a 18400 C752T CR 12S_rRNA ***** C T
12026 D5a 18400 A12026G CR ND4 ***** A G
11944 D5a 18400 T11944C CR ND4 **** T C
9180 D5a'b >20000 A9180G CR ATP6 **** A G
16182 D5a'b >20000 A16182C HVR1 HVS-I * A C
16183 D5a'b >20000 A16183C HVR1 HVS-I * A C
1107 D5 >20000 T1107C CR 12S_rRNA ***** T C
5301 D5 >20000 A5301G CR ND2 ***** A G
10397 D5 >20000 A10397G CR ND3 ***** A G
150 D5 >20000 C150T HVR2 HVS-II * C T
16189 D-a >20000 T16189C! HVR1 HVS-I * T C
5178 D >20000 C5178A CR ND2 ***** C A
709 D >20000 A709G! CR 12S_rRNA * A G
16362 D >20000 T16362C HVR1 HVS-I * T C
4883 M80'D >20000 C4883T CR ND2 ***** C T
150 M80'D >20000 T150C! HVR2 HVS-II * T C
195 M80'D >20000 C195T!! HVR2 HVS-II * C T
5460 M80'D >20000 A5460G! CR ND2 * A G
10400 M >20000 C10400T CR ND3 ***** C T
14783 M >20000 T14783C CR CYB ***** T C
489 M >20000 T489C HVR2 HVS-III **** T C
15043 M >20000 G15043A CR CYB *** G A
769 L3 >20000 A769G CR 12S_rRNA ***** A G
1018 L3 >20000 A1018G CR 12S_rRNA ***** A G
16311 L3 >20000 C16311T HVR1 HVS-I *** C T
3594 L3'4 >20000 T3594C CR ND1 ***** T C
7256 L3'4 >20000 T7256C CR CO1 ***** T C
10115 L3'4 >20000 C10115T! CR ND3 ***** C T
13650 L3'4 >20000 T13650C CR ND5 ***** T C
2416 L3'4 >20000 C2416T! CR 16S_rRNA **** C T
16278 L3'4 >20000 T16278C HVR1 HVS-I **** T C
146 L3'4 >20000 C146T!! HVR2 HVS-II *** C T
182 L3'4 >20000 T182C! HVR2 HVS-II *** T C
150 L3'4 >20000 C150T HVR2 HVS-II * C T
152 L3'4 >20000 C152T!! HVR2 HVS-II * C T
195 L3'4 >20000 T195C! HVR2 HVS-II * T C
5460 L3'4 >20000 G5460A CR ND2 * G A
16362 L3'4 >20000 T16362C HVR1 HVS-I * T C
16519 L3'4 >20000 C16519T HVR1 * C T
4104 L3'4'6 >20000 G4104A CR ND1 ***** G A
7521 L3'4'6 >20000 A7521G CR tRNA-Asp ***** A G
709 L3'4'6 >20000 G709A CR 12S_rRNA * G A
247 L2'3'4'6 >20000 A247G HVR2 HVS-II ***** A G
825 L2'3'4'6 >20000 A825T CR 12S_rRNA ***** A T
8655 L2'3'4'6 >20000 T8655C CR ATP6 ***** T C
10115 L2'3'4'6 >20000 T10115C CR ND3 ***** T C
10688 L2'3'4'6 >20000 A10688G CR ND4L ***** A G
10810 L2'3'4'6 >20000 C10810T CR ND4 ***** C T
13105 L2'3'4'6 >20000 G13105A CR ND5 ***** G A
13506 L2'3'4'6 >20000 T13506C CR ND5 ***** T C
2416 L2'3'4'6 >20000 T2416C CR 16S_rRNA **** T C
7389 L2'3'4'6 >20000 C7389T! CR CO1 **** C T
14178 L2'3'4'6 >20000 C14178T! CR ND6 **** C T
15301 L2'3'4'6 >20000 G15301A CR CYB **** G A
16187 L2'3'4'6 >20000 T16187C HVR1 HVS-I **** T C
146 L2'3'4'6 >20000 T146C! HVR2 HVS-II *** T C
14560 L2'3'4'6 >20000 A14560G! CR ND6 *** A G
16129 L2'3'4'6 >20000 A16129G HVR1 HVS-I *** A G
16311 L2'3'4'6 >20000 C16311T HVR1 HVS-I *** C T
152 L2'3'4'6 >20000 T152C! HVR2 HVS-II * T C
189 L2'3'4'6 >20000 G189A! HVR2 HVS-II * G A
195 L2'3'4'6 >20000 C195T HVR2 HVS-II * C T
310 L2'3'4'6 >20000 T310TC HVR2 HVS-II * T TC
16189 L2'3'4'6 >20000 C16189T HVR1 HVS-I * C T
2758 L2'3'4'5'6'7 >20000 A2758G CR 16S_rRNA ***** A G
2885 L2'3'4'5'6'7 >20000 C2885T CR 16S_rRNA ***** C T
7146 L2'3'4'5'6'7 >20000 G7146A CR CO1 ***** G A
8468 L2'3'4'5'6'7 >20000 T8468C CR ATP8 ***** T C
152 L2'3'4'5'6'7 >20000 C152T HVR2 HVS-II * C T
4312 L1'2'3'4'5'6'7 0 T4312C CR tRNA-Ile ***** T C
10664 L1'2'3'4'5'6'7 0 T10664C CR ND4L ***** T C
10915 L1'2'3'4'5'6'7 0 C10915T CR ND4 ***** C T
11914 L1'2'3'4'5'6'7 0 A11914G CR ND4 ***** A G
13276 L1'2'3'4'5'6'7 0 G13276A CR ND5 ***** G A
16230 L1'2'3'4'5'6'7 0 G16230A HVR1 HVS-I ***** G A
7389 L1'2'3'4'5'6'7 0 T7389C CR CO1 **** T C
14178 L1'2'3'4'5'6'7 0 T14178C CR ND6 **** T C
146 L1'2'3'4'5'6'7 0 C146T HVR2 HVS-II *** C T
182 L1'2'3'4'5'6'7 0 C182T HVR2 HVS-II *** C T
14560 L1'2'3'4'5'6'7 0 G14560A CR ND6 *** G A
189 L1'2'3'4'5'6'7 0 A189G HVR2 HVS-II * A G
195 L1'2'3'4'5'6'7 0 C195T HVR2 HVS-II * C T
522 L1'2'3'4'5'6'7 0 C522CAC HVR2 HVS-III * C CAC

Оффлайн Mikl1984Автор темы

  • R1b R-BY1823 R-FTA13144
  • Сообщений: 257
  • Страна: ru
  • Рейтинг +67/-0
  • H2a1f4
Re: Тест Полная mtDNA в Genotek
« Ответ #5 : 08 Января 2026, 15:35:43 »
Ну и вишенка на торте, то ради чего Г... делал полное мито всем с конца декабря 2024 по октябрь-ноябрь 2005 года, это списки совпаденцев
Пока ими пользоваться практически нереально
Вот как они выглядят для группы тещи D5a3a1a
D5a3a1-a
6300 лет назад
D5a3a1-a*
А. Ш.
Ю. А. Ш.
Д. Д.
D5a3a1a
1300 лет назад
М. М.
Ш. N. Е.
Е. Ш.
А. Н.
Н. Н.
Д. Г.
Д. Ч.
С. С.
Д. Н.
Россия, Волгоградская
С. А. П.
Ю. П.
О. О.
Е. Д.
И. И.
Е. Е.
Ю. П.
М. М.
П. Д. К.
А. Р.
М. Р.
Россия, Карелия
В. В.
Н. Н.
А. А.
М. В.
Е. З.
Я. Ф.
С. К.
А. И. Б.
А. Ш.
Я. К.
Россия, Хабаровский
Я. К.
А. В.
Е. Ч.
П. В. З.
А. К.
Л. З.
М. К.
Р. К.
Д. К.
У. Б.
О. Е.
А. С.
А. В. Б.
Ю. П.
О. С.
Г. Г. Г.
Е. N. Б.
М. Т.
З. З.
Г. Щ.
О. О.
М. И.
В. Г.
Н. С.
И. И.
М. М.
В. Б.
С. М.
В. К.
И. Т.
Е. С.
Д. Т.
А. В. М.
С. К.
В. Г. Г.
К. В. С.
Ю. С.
А. В. В.
Д. О. Д.
Б. Б.
А. В.
А. С.
A. A.
М. Б.
М. М.
Э. Б.
Н. Т.
И. Н.
Н. М. Ш.
К. Ю. Ю.
Д. Я.
С. К.
Д. И.
С. Б.
К. В. Д.
A. P.
Д. Б.
Е. Е.
В. С.
О. О.
Е. В. Б.
О. Ю. М.
В. В. Г.
В. Т.
Е. К.
А. А.
М. М.
Ю. Р.
Е. В.
В. З.
А. В.
В. N. К.
С. Н. Н.
М. С.
В. С.
А. А.
Л. Ш.
В. П.
А. М.
Л. П. Е.
А. Б.
Е. Е.
А. А.
И. Т.
Н. М.
Ю. К.
А. Г.
М. М.
К. К.
А. С.
Б. Б.
!. Н.
С. С.
E. K.
Т. М. Р.
Л. А.
К. Ю.
Е. П.
Р. Д.
М. М.
С. С.
Д. П.
А. Ю. Н.
А.
А. К.
Е. Е. М.
Е. А. М.
Е. Е.
Н. К.
В. Г.
А. Г.
Казахстан, Западно-Казахстанская
Т. В. К.
Россия, Саратовская
А. П.
А. А.
А. М. Д.
N. V.
М. С.
Р. С. С.
А. С.
А. А.
П. П.
О. Р.
А. М.
Т. Я.
Н. Б.
С. С.
А. А.
О. Ш.
В. К.
Р. С. С.
С. М.
В. П.
A. K.
M. K.
И. Р.
И. О.
В. А. С.
С. Б.
Я. Ч.
И. Ч.
С. Р.
Е. Е.
О. Я.
В. Ф.
А. А.
С. Е.
В. Ф.
M. K.
Е. Е.
Е. П.
С. С.
П. Д.
Н. Н.
В. В. П.
Н. Б.
А. С. К.
Д. Д.
Д. М.
В. А. С.
Е. Е.
Н. Н. Г.
Д. С.
Ю. И.
М. М.
К. Ф.
А. А.
Вы
D5a3a1-a1
700 лет назад
Несортированные инициалы двух сотен людей :(
Но шанс найти нужных есть

В августе было около сотни, что превышало количество в FTDNA (70) и yfull (13), в ноябре было уже 200 при несущественном росте в больших базах
С ноября список не пополнялся :(

Как делали? Тут только предположения. Скорее всего купили кастомизированные чипы с возможностью настройки полного покрытия mtDNA
Она маленькая, меньше 17K снипов. Задумка была интересная, но реализацию не допилили :(

Точность также под вопросом, для этого и разорился на ftdna
В WGS 30x mtDNA читается несколько тысяч раз, а сравнение дочки с матерью показало большие различия, особенно по приватным снипам


 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.