Совпаденцы по Х-хромосоме

[Эллен]

Добрый день. Гедматч предлагает выявить совпаденцев по Х-хромосоме. У меня они есть. Но о чем это вообще? Чем они отличаются от совпаденцев по аутосомам?

[Farroukh]

Аутосомы - это несексуальные хромосомы, в отличие от X и Y

Схема родства по X-хромосоме (X-match)

[Penny]

Добрый день. Гедматч предлагает выявить совпаденцев по Х-хромосоме. У меня они есть. Но о чем это вообще? Чем они отличаются о совпаденцев по аутосомам?

Мужчинам вообще по этой хромосоме хорошо смотреть, т.к. она у них только от матерей. Но и для женщин есть толк, что по этой хромосоме можно точно вычеркнуть генетич. наследство от деда по отцу. Больше того, х-хромосома от бабушки по отцу должна передасться без рекомбинации в отличие от х-хромосомы по матери (если я ничего не путаю). Это кому-то может быть полезно, если нет возможности протестировать предков  и фазирование затруднено. Недостаток то, что куски хромосомы могут длительно передаваться из поколения в поколения , приводя к ложным совпаденцам.

[Эллен]

Аутосомы - это несексуальные хромосомы, в отличие от X и Y

Схема родства по X-хромосоме (X-match)

Спасибо, что аутосомы несексуальные), я знаю. Насчет схемы родства - я не вижу в ней соответствия размеру в сМ. Например, у меня есть совпаденцы с 20 и 18 сМ. И что тут с родством, непонятно...

[Farroukh]

не вижу в ней соответствия размеру в сМ.

Схема родства с размерами в сМ

[Эллен]

Добрый день. Гедматч предлагает выявить совпаденцев по Х-хромосоме. У меня они есть. Но о чем это вообще? Чем они отличаются о совпаденцев по аутосомам?

Мужчинам вообще по этой хромосоме хорошо смотреть, т.к. она у них только от матерей. Но и для женщин есть толк, что по этой хромосоме можно точно вычеркнуть генетич. наследство от деда по отцу. Больше того, х-хромосома от бабушки по отцу должна передасться без рекомбинации в отличие от х-хромосомы по матери (если я ничего не путаю). Это кому-то может быть полезно, если нет возможности протестировать предков  и фазирование затруднено. Недостаток то, что куски хромосомы могут длительно передаваться из поколения в поколения , приводя к ложным совпаденцам.

Спасибо. Правда, я мало что поняла) "Но и для женщин есть толк, что по этой хромосоме можно точно вычеркнуть генетич. наследство от деда по отцу" - то есть, все, с кем я совпадаю по Х хромосоме, мои дальние родственники по отцу моего отца? Вне зависимости от величины совпадения? Я читала, что Х совпадения меньше 15 не стоит рассматривать. У меня есть одна совпаденка 27,7 сМ, несколько 18-17, других много, но более мелкие. "...х-хромосома от бабушки по отцу должна передасться без рекомбинации в отличие от х-хромосомы по матери (если я ничего не путаю)" Как отличить Х-хромосому от бабушки по отцу от Х-хромосомы от дедушки по от дедушки по отцу? (те, кого мы вычеркиваем). А также бабушкину по отцу от хромосомы по матери? Вообще, от бабушки по отцу эта хромосома женщинам передается? Мне вообще это актуально, так как отец (биологический) узбек, и по нему совпаденцев аутосомных нет практически, видимо, их той местности никто не тестируется((

[Эллен]

не вижу в ней соответствия размеру в сМ.

Схема родства с размерами в сМ

Спасибо. Понятно, я думала, что по Х-хромосоме другая схема. А все, значит, как и с аутосомами...

[Farroukh]

по этой хромосоме можно точно вычеркнуть генетич. наследство от деда по отцу" - то есть, все, с кем я совпадаю по Х хромосоме, мои дальние родственники по отцу моего отца?

Наоборот - от деда по отцу Вы не можете получить X.
Иными словами, если у женщины есть совпадение по X-хромосоме, то оно может быть по любой из трёх других линий - бабка по матери, бабка по отцу, дед по матери.

я думала, что по Х-хромосоме другая схема.

Мать/ребёнок, отец/дочь ~180 сМ X-match
Полнородные брат и сестра ~80 сМ X-match
Бабка по отцу/внучка ~180 сМ X-match

[Penny]

Спасибо. Правда, я мало что поняла) "Но и для женщин есть толк, что по этой хромосоме можно точно вычеркнуть генетич. наследство от деда по отцу" - то есть, все, с кем я совпадаю по Х хромосоме, мои дальние родственники по отцу моего отца? Вне зависимости от величины совпадения? Я читала, что Х совпадения меньше 15 не стоит рассматривать. У меня есть одна совпаденка 27,7 сМ, несколько 18-17, других много, но более мелкие. "...х-хромосома от бабушки по отцу должна передасться без рекомбинации в отличие от х-хромосомы по матери (если я ничего не путаю)" Как отличить Х-хромосому от бабушки по отцу от Х-хромосомы от дедушки по от дедушки по отцу? (те, кого мы вычеркиваем). А также бабушкину по отцу от хромосомы по матери? Вообще, от бабушки по отцу эта хромосома женщинам передается? Мне вообще это актуально, так как отец (биологический) узбек, и по нему совпаденцев аутосомных нет практически, видимо, их той местности никто не тестируется((

От деда по отцу нет X-хромосомы.
Насчет отсутствия узбеков, да, похоже плохо тестируются. У нас хотя бы местная генотек есть, им только за границу отправлять.
Тоже заметила, что например у татар на Gedmatch практически не проявляются среднеазиаты, а ведь должны бы. Ведь турки вполне себе проявляются в малом количестве, даже пакистанцы с афганцами и те проскакивают хотя бы на pile-up участках. А среднеазиатов даже на таких участках не наблюдается. Значит надо ждать, пока это станет для них более доступно.

[Penny]

Я читала, что Х совпадения меньше 15 не стоит рассматривать. У меня есть одна совпаденка 27,7 сМ, несколько 18-17, других много, но более мелкие. "

27.7 - это много, мне кажется. У меня есть две совпаденки на Gedmatch, мать с дочкой, по 25 сМ, плюс у матери еще другой кусок 15 или 17 сМ. При этом 8 сМ аутосомные вроде только с матерью.  Я не списывалась еще. Честно говоря, думаю, бесполезно, хотя есть шанс, что они знают, откуда их предки родом, но вообще такого рода знания не сильно распространены среди русских. Но конечно можно хотя бы фамилию узнать, может окажется одной из моих предков.

[Эллен]

по этой хромосоме можно точно вычеркнуть генетич. наследство от деда по отцу" - то есть, все, с кем я совпадаю по Х хромосоме, мои дальние родственники по отцу моего отца?

Наоборот - от деда по отцу Вы не можете получить X.
Иными словами, если у женщины есть совпадение по X-хромосоме, то оно может быть по любой из трёх других линий - бабка по матери, бабка по отцу, дед по матери.

я думала, что по Х-хромосоме другая схема.

Мать/ребёнок, отец/дочь ~180 сМ X-match
Полнородные брат и сестра ~80 сМ X-match
Бабка по отцу/внучка ~30 сМ X-match

Спасибо, теперь понятней. А то я смотрю совпаденцев этих совпаденцев, там опять финны проскакивают, и не пойму, как так, если дед отца узбек))

[dima75]

по этой хромосоме можно точно вычеркнуть генетич. наследство от деда по отцу" - то есть, все, с кем я совпадаю по Х хромосоме, мои дальние родственники по отцу моего отца?

Наоборот - от деда по отцу Вы не можете получить X.
Иными словами, если у женщины есть совпадение по X-хромосоме, то оно может быть по любой из трёх других линий - бабка по матери, бабка по отцу, дед по матери.

я думала, что по Х-хромосоме другая схема.

Мать/ребёнок, отец/дочь ~180 сМ X-match
Полнородные брат и сестра ~80 сМ X-match
Бабка по отцу/внучка ~30 сМ X-match

Бабка по отцу/внучка по идее должно быть тоже 180 сМ - от сына бабки к его дочери (внучке бабки) переходит таже самая Х-хромосома.

[Farroukh]

Исправил