АвторТема: Реликтовые ветви R1a*, R1a1*, R1a1а*  (Прочитано 35148 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2239
  • Рейтинг +659/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #30 : 16 Сентябрь 2010, 06:15:53 »
Вышла статья Extended Y-chromosome investigation suggests post-Glacial migrations of modern humans into East Asia via the northern route
Hua Zhong†,1,2,5, Hong Shi†,2, Xue-Bin Qi2, Zi-Yuan Duan4, Ping-Ping Tan1, Li Jin3, Bing Su*,2 and Runlin Z. Ma*,1

Abstract
Genetic diversity data, from Y chromosome and mitochondrial DNA as well as recent genome-wide autosomal SNPs, suggested that mainland Southeast Asia was the major geographic source of East Asian populations. However, these studies also detected Central-South Asia- and/or West Eurasia-related genetic components in East Asia, implying either recent population admixture or ancient migrations via the proposed northern route. To trace the time period and geographic source of these Central-South Asia- and West Eurasia-related genetic components, we sampled 3,826 males (116 populations from China and one population from South Korea) and performed high-resolution genotyping according to the well-resolved Y-chromosome phylogeny. Our data, in combination with the published East Asian Y-haplogroup data, show that there are four dominant haplogroups (accounting for 92.87% of the East Asian Y chromosomes), O-M175, D-M174, C-M130 (not including C5-M356) and N-M231, in both southern and northern East Asian populations, which is consistent with the proposed southern route of modern human origin in East Asia. However, there are other haplogroups (6.79% in total) (E-SRY4064, C5-M356, G-M201, H-M69, I-M170, J-P209, L-M20, Q-M242, R-M207 and T-M70) detected primarily in northern East Asian populations, and were identified as Central-South Asian and/or West Eurasian origin based on the phylogeographic analysis. In particular, evidence of geographic distribution and Y-STR diversity indicate that haplogroup Q-M242 (the ancestral haplogroup of the native American-specific haplogroup Q1a3a-M3) and R-M207 probably migrated into East Asia via the northern route. The age estimation of Y-STR variation within haplogroups suggests the existence of post-Glacial (?18 thousand years ago, kya) migrations via the northern route as well as recent (?3 kya) population admixture. We propose that although the Paleolithic migrations via the southern route played a major role in modern human settlement in East Asia, there are ancient contributions, though limited, from western Eurasia which partly explain the genetic divergence between current southern and northern East Asian populations.

Приложение в свободном доступе. Из 54 опубликованных гаплотипов уйгуров R1a1a-M17 четыре гапплотипа с DYS392=13, еще два - с DYS392=14. Частота 6/54=11%.

http://mbe.oxfordjournals.org/content/early/2010/09/13/molbev.msq247

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2239
  • Рейтинг +659/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #31 : 16 Сентябрь 2010, 08:43:31 »
Там же 5 гаплотипов R1a1a-М17 казахов (Синьцзян, КНР).
В последовательности 19, 388, 389I, 389II, 390, 391, 392, 393:

16   12   13   16   25   10   12   13
17   12   11   18   24   11   11   13
15   12   13   17   25   11   11   13
15   12   13   17   24   11   11   13
17   12   11   18   24   11   11   13




Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2668
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #32 : 16 Сентябрь 2010, 10:20:52 »



На всякий случай, упомяну еще Badakhshani N63448(M124- M173- M207+)
Думаю, он ближе к R2. Может даже M479(xM124).
Вы правы. Я думаю, что он R2*. Когда не было снипа М479, он был типирован как R*,т.к.М124-, в отличие от других R2(М124+), которые  после обнаружения нового снипа оказались R2a(М479+,М124+).

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2668
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #33 : 16 Сентябрь 2010, 10:46:46 »
Приложение в свободном доступе. Из 54 опубликованных гаплотипов уйгуров R1a1a-M17 четыре гапплотипа с DYS392=13, еще два - с DYS392=14. Частота 6/54=11%.

Тоже вчера обратил на них внимание. Жаль, что они не были типированы на M417 или Page07. Тогда было бы ясно, это древняя азиатская ветвь R1a1a*(М17+,М417-,Page07-) или самое старое ответвление R1a1a1, сохранившее предковое значение DYS392 от R1a1a. И жаль конечно, что только 8 маркеров. Можно было бы сравнить по STR.
Вероятно, по этой ветви АК рассчитывал возраст R1a1=20т.л. Ему китайцы то ли 6м, то ли 8м гаплотипы присылали.
Кстати, раньше писали, что уйгуры в основном R1b, но у них R1a явно больше.

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2668
  • Страна: ua
  • Рейтинг +615/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #34 : 16 Сентябрь 2010, 15:28:26 »

Вероятно, по этой ветви АК рассчитывал возраст R1a1=20т.л. Ему китайцы то ли 6м, то ли 8м гаплотипы присылали.

Вспомнил. То были 5-маркерные.

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2088
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #35 : 22 Февраль 2011, 14:25:56 »
"Патриархи" - это самая близкая к корню всего древа ветвь гаплотипов. Маленькая, но устойчивая. Фактически состоит из двух веточек:
 
1.  R1a* - пока здесь всего один 67-маркерный гаплотип Шпаковского с корнями из Белоруссии и верифицированными снипами SRY10831.2+ и М198-. Предиктор уважаемого Вертнера даёт для него вообще  только Р-М45. Отсюда и несколько неудачное его расположение относительно модала SRY10831.2 Вадима. Но что можно ожидать от одинокого гаплотипа - ветки то у него практически нет.

 
2. R1a1* - веточка из шести гаплотипов (от Македонии до Шотландии), большинство из которых были отснипованы как М198+ но М417-. Здесь модал (а точнеее - корневой гаплотип)  Вадима сработал чётко - лёг с нулевым расстоянием от узла ветки, то есть - точно в её корень.

Произошли также некоторые изменения в моём скрипте, вычисляющем к-во мутаций на ветках и ро-статистику. Обозначения типа 3/25 означают, что на данном ребре произошло 3 мутации и ВБОП образованной им ветки составляет примерно 25 веков (столетий) от настоящего времени. Это сделано для более сжатой подачи информации и обозримости древа. Всё равно ведь реальная точность ро-статистики именно порядка сотни лет. Так зачем же плодить малозначащие цифры?
 
Итак, вот они, наши "старички" на сегодня:
« Последнее редактирование: 22 Февраль 2011, 17:03:56 от Овод »

Оффлайн Робот Вертнера

  • Сообщений: 9150
  • Страна: ru
  • Рейтинг +148/-0
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #36 : 02 Июнь 2011, 20:27:42 »
Новый гаплотип или маркеры; M198-; 111 маркеров; R1a1; P; Shpakovsky; Belarus; N86494; L122+, L168-, M198-, SRY10831.2+ (на расстоянии 62 от R1b1a2a1a1b3c; R1b1b2; Moses Wright, 1802 - 1867; Unknown Origin; 26749)

Оффлайн Робот Вертнера

  • Сообщений: 9150
  • Страна: ru
  • Рейтинг +148/-0
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #37 : 02 Июнь 2011, 20:28:21 »
Новый гаплотип или маркеры; M417-; 67 маркеров; R1a1a; R1a1a*; Ivan Mihaylov 1800, Tresonce, Macedonia; Macedonia; N4203; L12-, L122+, L168+, L169-, L170+, L175-, L176.1-, L235-, L260-, L449+, L457+, M157.1-, M198+, M417-, M434-, M458- (на расстоянии 1 от R1a1; R1a1a*; Mihaylov;  Treconce, Macedonia ; 9QNN2)
Новый гаплотип или маркеры; M417-; 67 маркеров; R1a1a; R1a1a*; Van de Water; Unknown Origin; 193919; L449+, M17+, M198+, M417-, PS7- (на расстоянии 10 от R1a1a; R1a1a*; Wooldridge;  England ; F4KM2)

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2088
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #38 : 02 Июнь 2011, 20:30:43 »
Эти уже есть на ветке. Будем ждать новеньких.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5536
  • Страна: hr
  • Рейтинг +3011/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Реликтовые ветви М17- и М417-
« Ответ #39 : 01 Октябрь 2011, 19:51:35 »
Новый гаплотип или маркеры; M417-; 67 маркеров; R1a1a; R1a1a*; Ivan Mihaylov 1800, Tresonce, Macedonia; Macedonia; N4203; L12-, L122+, L168+, L169-, L170+, L175-, L176.1-, L235-, L260-, L449+, L457+, M157.1-, M198+, M417-, M434-, M458- (на расстоянии 1 от R1a1; R1a1a*; Mihaylov;  Treconce, Macedonia ; 9QNN2)
Это один и тот же гаплотип. Пользователь ошибся при вводе значения gataH4 в YSEARCH

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2088
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Реликтовые ветви R1a*,R1a1*,R1a1*
« Ответ #40 : 29 Ноябрь 2011, 00:17:49 »
Реликтовые ветви существенно пополнились. В основном из проекта ФТДНА "R1Asterisk", админом которого - небезызвестный Винс Висачеро, кровный враг АК. Там в основном гаплотипы, типированные на М173, то есть - гарантированные R1, но вроде как не типированные глубже (к сожалению, секция снипов в проекте отсутствует). Но предиктор Вадима увереннно отнес их к R1a*. Поэтому, до поступления конкретной информации о их сниповании, будем считать их таковыми.
 
Итак, фактически имеем три чётко разделяемых парафилетических кластера. Они хорошо прорисовываются на прилагаемом дереве. Первый - из 12 гаплотипов, предположительно R1a* c  1500-летним общим предком, ответвившийся от основного ствола более 9000 лет тому назад. Не хилое "бутылочное горлышко"!
 
Чуть ниже по дереву - пока единственный (но очень известный) гаплотип Шпаковского. Ему около 8200 лет .Он гарантированно SRY10831.2+, но М198-, то есть - R1a1*. Нужно искать ему компанию.
 
И, наконец, третий, тоже ранее упоминавшийся кластер - от Михайлова из Македонии до скотта Шарпа и немца Sole. Общий предок - 1600 лет назад, ответвление - около 7000 лет.  Как минимум двое в нём (Михайлов и голландец Ван-де-Ватер) снипованы как M198+, но М417-, то есть - R1a1a*.
 
Радует чёткое положение ветвей в порядке их снипования, а также то, что сразу за этими тремя кластерами следует ветвь" Данов" - dys388=10.(Её начало видно над нижним обрезом снимка). Cобственно как им и полагалось бы.
 

Оффлайн wertner

  • ...
  • Сообщений: 1383
  • Страна: ru
  • Рейтинг +321/-0
    • YFull
  • Y-ДНК: E-V13->E-S2972->E-Z16661
  • мтДНК: U4a (xU4a3)
Re: Реликтовые ветви R1a*,R1a1*,R1a1*
« Ответ #41 : 29 Ноябрь 2011, 04:48:49 »
Там в основном гаплотипы, типированные на М173, то есть - гарантированные R1, но вроде как не типированные глубже (к сожалению, секция снипов в проекте отсутствует). Но предиктор Вадима увереннно отнес их к R1a*. Поэтому, до поступления конкретной информации о их сниповании, будем считать их таковыми.
Они участвовали в других проектах.
Вот результаты снипов:
M173+, M343-, SRY10831.2-
M173+
M126-, M153-, M160-, M173+, M18-, M207+, M222-, M269-, M343-, M37-, M65-, M73-, P25-, P66-, SRY2627-
M124-, M173+, M269-, M343-, SRY10831.2-

Это из проектов:
http://www.familytreedna.com/public/pickering2
http://www.familytreedna.com/public/BritishIsles
http://www.familytreedna.com/public/barlow
http://www.familytreedna.com/public/germany
http://www.familytreedna.com/public/Y-DNA-Tree-Early-Branches

Киты со снипами:
91525
99660
119339
10538
73823
73115

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Реликтовые ветви R1a*, R1a1*, R1a1а*
« Ответ #42 : 29 Ноябрь 2011, 09:01:30 »
В основном из проекта ФТДНА "R1Asterisk", админом которого - небезызвестный Винс Висачеро, кровный враг АК. Там в основном гаплотипы, типированные на М173, то есть - гарантированные R1, но вроде как не типированные глубже (к сожалению, секция снипов в проекте отсутствует).
Уважаемый Овод, не связывались с Висачеро относительно его планов по раскрытию странички снипов?

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2088
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: Реликтовые ветви R1a*,R1a1*,R1a1*
« Ответ #43 : 29 Ноябрь 2011, 11:36:05 »
Вот результаты снипов:
M173+, M343-, SRY10831.2-
M173+
M126-, M153-, M160-, M173+, M18-, M207+, M222-, M269-, M343-, M37-, M65-, M73-, P25-, P66-, SRY2627-
M124-, M173+, M269-, M343-, SRY10831.2-


Спасибо, Вадим. Обязательно вобью их в соотв. гаплотипы.
 
Цитировать
Уважаемый Овод, не связывались с Висачеро относительно его планов по раскрытию странички снипов?

Нет, Виктор, не связывался. Я думаю, что будетт эффективнее, если к нему с такой просьбой обратитесь Вы - поскольку, в отличие от меня, Вас он знает по DNA-форуму.
 
 :)  Главное, чтобы его не попросил о том же АК. Тогда он точно снипы не раскроет  ;D .
 
 
 

Оффлайн mouglley

  • ...
  • Сообщений: 7779
  • Страна: hr
  • Рейтинг +434/-7
  • Я знаю, что познаю всё.
    • Записки Маугли
  • Y-ДНК: N1c1-L1025
  • мтДНК: J1c3
Re: Реликтовые ветви R1a*, R1a1*, R1a1а*
« Ответ #44 : 30 Ноябрь 2011, 08:58:11 »
Цитировать
Уважаемый Овод, не связывались с Висачеро относительно его планов по раскрытию странички снипов?
Нет, Виктор, не связывался. Я думаю, что будетт эффективнее, если к нему  с такой просьбой обратитесь Вы - поскольку, в отличие от меня, Вас он  знает по DNA-форуму.
 
 :)  Главное, чтобы его не попросил о том же АК. Тогда он точно снипы не раскроет  ;D .
Цитировать
Okay, I just did it but I warn you that this group is severely  under-tested:  three of the four only have 12 markers, for example, and  none have done any advanced SNP testing.
 
 I think they will turn out to be R-M479, but our project could use some  funds to confirm it.  If any of the Russian enthusiasts want to donate  to the project general fund, we can upgrade these kits.                                      

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100