Америндские банально не описаны настолько хорошо, чтобы там можно было что-то отсеивать. Значительная часть их вообще толком не описана, очень многие известны по отрывочным записям сделанным сто лет назад перед их исчезновением.
Плюс американская школа лингвистики традиционно компаративистикой не занималась и концентрировалась на иных задачах, в том числе и в описании. Этимологические словари и реконструкции праязыков там практически никто и никогда не делал. А без этого ни о каких доказанных схождениях говорить нельзя - только об интуиции и мнении исследователя. Который может угадать, а может и ошибиться.