Так сейчас критерии намного жёстче. В национальные выборки попадают лишь те, у кого все бабушки и дедушки представители этого народа или этой местности (смотря что исследуется). То есть никаких не 55%, а только 100%.
И вот, даже среди этих 100% выявляются различия субэтнического порядка.
На древние останки это всё вполне работает.
Вот, например, я лично взял викингов из работы Маргаряна и сравнил с собой и своими родственниками. Разумеется, самыми близкими оказались викинги славянского происхождения. А для родственника, имеющего большую примесь народа коми, ближайшими оказались другие.
Думаю, если бы этих викингов залили на условный Генотек, он бы без проблем этническую интерпретацию по ним дал. Правда, по современным народам и именно это является проблемой.
Например, чтобы понять насколько у русских велико влияние голяди, нужны генетические образцы этой голяди. А покуда их нет, их маркеры полагаются исконным балто-славянским наследством, за неимением других критериев.