АвторТема: Файл с данными ДНК, AT и CG  (Прочитано 484 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн LegoАвтор темы

  • Сообщений: 7
  • Страна: ru
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1c1
Файл с данными ДНК, AT и CG
« : 27 Ноябрь 2024, 12:44:40 »
Файл с данными ДНК от FTDNA содержит около 720 тыс. пар SNP. По какой-то причине различные буквенные комбинации встречаются очень разное число раз.
AC – 14 000
AG – 60 000
CT – 61 000
GT – 14 000
AT – 185
CG – 269
Особенно мало комбинаций AT и CG. Почему такая огромная разница?

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1575
  • Страна: hu
  • Рейтинг +299/-7
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Файл с данными ДНК, AT и CG
« Ответ #1 : 14 Декабрь 2024, 20:17:21 »
Если коротко - потому что AT и CG комплементарные основания.

Вы же смотрели по одному конкретному файлу? А не хотите посмотреть на массе? Взять файлов 10-100-1000 и посчитать статистику?

Оффлайн LegoАвтор темы

  • Сообщений: 7
  • Страна: ru
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1c1
Re: Файл с данными ДНК, AT и CG
« Ответ #2 : 18 Декабрь 2024, 13:01:21 »
Спасибо за комментарий.
Как связана комплиментарность с частотой буквенной пары?
В каждой паре одна буква от матери, другая от отца. Находятся они в разных частях хромосомы.
Почему между ними есть какая-то корреляция? Кажется, что они должны быть независимы друг от друга.

> А не хотите посмотреть на массе?
А где их взять? Там может быть другая статистика?

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1575
  • Страна: hu
  • Рейтинг +299/-7
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Файл с данными ДНК, AT и CG
« Ответ #3 : 18 Декабрь 2024, 16:57:01 »
Цитировать
Как связана комплиментарность с частотой буквенной пары?
видимо, с той, что для целей генеалогии брали вполне конкретные позиции, которые мутировали определенным образом и давали полезную информацию.
Цитировать
А где их взять? Там может быть другая статистика?
https://my.pgp-hms.org/public_genetic_data
например, отсюда

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.