АвторТема: BigY или WGS?  (Прочитано 4237 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1440
  • Страна: hu
  • Рейтинг +268/-7
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: BigY или WGS?
« Ответ #75 : 19 Ноябрь 2023, 23:47:08 »
NathanS
Ваши предложения ?
Так-то запросто можно сделать как - пообещать фул геном за год оборота. Зато ожиданий неоправданных нет. Кто согласится? И с нормальной логистикой.
Только вот боюсь, что цены будут не 299€ за кит все равно.

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1277
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1202/-2
Re: BigY или WGS?
« Ответ #76 : 05 Январь 2024, 23:57:11 »
Для генеалогического исследования рода по мужской линии что лучше Nebula Genomics или FTDNA с Y-DNA тестами?

Однозначного ответа нет и мы спорим по этому поводу.
Я рекомендую:
1. Y-DNA37 или Y-DNA111 в FTDNA для поиска совпаденцев по STR-маркерам,
2. Полногеномный тест (Nebula, DanteLabs, YSEQ) для максимального количества генетических данных с последующим анализом в YFull для определения субклада.

Вы уверены, что путь, который вы предлагаете, надёжный? Тем более для такой распространённой ГГ как R1a?

Я именно так и делаю, независимо от гаплогруппы.
Тест STR-маркеров необходим исключительно для поиска совпаденцев, которые не довели свой тест до сейчас актуального уровня. Это потенциальные кандидаты на более продвинутые тесты, самостоятельно, через уговоры или на других условиях.

На форуме знатоки много раз озвучивали, что по STR может не быть значимого совпадения, а когда сделаешь bigY оно будет.

Полногномный WGS тест или до определенной степени специализированный тест BigY ставят некоторую точку в тестировании Y-хромосомы. Когда определен снип и все распределены по своим субкладам, то уже нет вопросов кто кому родственник.
Да, STR-маркеры дают меньшую степень уверенности в точности совпадения и не позволяют определить терминальный снип.
Да, относительно близкий совпаденец по STR-маркерам может оказаться совершенно в другом субкладе, а относительно далекий совпаденец по STR может оказаться значительно ближе, чем предполагается по генетической дистанции, высчитанной по STR-маркерам.

Я неоднократно высказывался, что необходимость делать STR-маркеры - временная и связана в основном с необходимостью поиска в уже имеющейся базе результатов по STR. Когда полногеномный тест будет по 100$ (мы почти приблизились к этому в последней скидке DanteLabs), тогда можно будет полностью отказаться от тестов STR и просто перейти на полногеномные тесты.

Никакой другой функции, кроме поиска совпаденцев по старым тестам или отсеивания кандидатов на более продвинутый тест, у STR-тестов нет. (Может для ориентировки новичкам и/или оценки базы результатов, но все равно надо/придется доводить до WGS или BigY.)
« Последнее редактирование: 06 Январь 2024, 00:33:13 от NathanS »

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1243
  • Страна: ru
  • Рейтинг +913/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: BigY или WGS?
« Ответ #77 : 06 Январь 2024, 01:02:47 »
Лучше задействовать все инструменты.
Y37 закинуть в FTDNA.
Полный геном Данте себе и самому дальнему точно известному родственнику. Желательно хотя бы 5-7 поколений, если это возможно.
Всем потенциальным родственникам точечный SNP тест в Yseq, либо 1маркерный, если нащупаете специфический маркер вашего субклада.
Выявленным родственникам из разных регионов тоже по ПГ.
Отслеживание других потенциально близких родственных линий. Предлагать апгрейд итд.
Закинуть данные в Генотек. Аутосомным совпадениям с одинаковой гаплогруппой предлагать доп тесты. Если сами не хотят можно предложить SNP тест за свой счет.
Большинство конечно и не ответят, но это не страшно. Заниматься только лишь своей фамилией скорее всего не получиться. Придется охватывать и чужие, совпадающие.
Так можно максимально глубокого проследить все ветки.

Еще лучше посодействовать развитию генографических проектов, в регионах проживания предков. Популяризировать, агитировать. Кто-то да подпишется. Чем больше тестов тем больше шанс нащупать новые подробности.
В итоге все вместе делаем одно дело.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.