АвторТема: Определение времени до общего Предка (TMRCA)  (Прочитано 79722 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Eva

  • Сообщений: 230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +20/-0
  • Y-ДНК: R1b-CTS11767
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #345 : 11 Ноябрь 2014, 09:31:02 »
Цитировать
Получается, отличается 21 маркеров (мутаций?) из 111. Это о каком ВБОП может говорить?
На 67-ми маркёрах какая дистанция? По дистанциям на 111 маркёрах пока нет устоявшихся данных. (Пока можно сказать, что совпадение типа 111/111 соответствует родству в пределах 4 поколений)
На маркерах 67 - 12. Это получается, по КлАду-калькулятору ВБОП = 1380 лет?
И Semargl-Tree теперь пишет возраст 1616 лет по 67, + совершенно другие "связи" :-[
И что тогда ближе к истине:
3742 года (дерево 111);
1616 лет (дерево 67);
или 1380 лет (КлАд по 67)? :-\

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15198
  • Страна: az
  • Рейтинг +4566/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #346 : 11 Ноябрь 2014, 11:45:11 »
Цитировать
1380 лет (КлАд по 67)
КлАд выдаёт возрасты в поколениях.
Видимо, там 55 поколений, потому при шаге в 25 лет в КлАде получается где-то 1380 лет, при шаге в 30 лет у Семаргла - около 1616 лет.

111 маркёров надо брать в случае если у Вас есть совпаденец калибра 67/67.

Оффлайн Eva

  • Сообщений: 230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +20/-0
  • Y-ДНК: R1b-CTS11767
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #347 : 12 Ноябрь 2014, 17:47:41 »
111 маркёров надо брать в случае если у Вас есть совпаденец калибра 67/67.
Выходит, если совпаденец только на 37 маркерах, то замахиваться выше 67 маркеров в любых расчетах нет смысла, так как погрешность слишком большая будет?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15198
  • Страна: az
  • Рейтинг +4566/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #348 : 13 Ноябрь 2014, 20:26:07 »
Дело не в погрешности, а в степени родства. Если у вас обоих по 67 маркёров, но совпадают только первые три панели (37), то от того что Вы закажете 111 маркёров родство ближе не будет.

Совпали на 12 маркёрах? Хорошо, продлите до 37. И там совпало? Тогда 67 и так до посинения. ;D

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2356
  • Рейтинг +731/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #349 : 14 Ноябрь 2014, 00:32:22 »
111 маркёров надо брать в случае если у Вас есть совпаденец калибра 67/67.
Выходит, если совпаденец только на 37 маркерах, то замахиваться выше 67 маркеров в любых расчетах нет смысла, так как погрешность слишком большая будет?
Чем больше STR локусов ("маркеров"), тем меньше погрешность расчетов. Так что смысл есть.

Оффлайн Eva

  • Сообщений: 230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +20/-0
  • Y-ДНК: R1b-CTS11767
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #350 : 03 Декабрь 2014, 18:18:32 »
Честно говоря, я запуталась :-[
Какую установить скорость мутации и какую длинну поколения в расчетах ВБОП в semargl tree
для 111-маркерных гаплотипов, которые совпаденцы в 4 шагах на 37 маркерах  ???

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2356
  • Рейтинг +731/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #351 : 04 Декабрь 2014, 00:34:04 »
Честно говоря, я запуталась :-[
Какую установить скорость мутации и какую длинну поколения в расчетах ВБОП в semargl tree
для 111-маркерных гаплотипов, которые совпаденцы в 4 шагах на 37 маркерах  ???
Попробуйте заложить среднюю скорость 0.00262 на локус на поколение 31.5 лет.

Оффлайн Eva

  • Сообщений: 230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +20/-0
  • Y-ДНК: R1b-CTS11767
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #352 : 04 Февраль 2015, 18:54:31 »
Попробуйте заложить среднюю скорость 0.00262 на локус на поколение 31.5 лет.
Выходит, больше 3000 лет...
Скажите, а почему именно эти величины, а не другие?
« Последнее редактирование: 04 Февраль 2015, 19:59:59 от Eva »

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2356
  • Рейтинг +731/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #353 : 05 Февраль 2015, 01:41:04 »
Попробуйте заложить среднюю скорость 0.00262 на локус на поколение 31.5 лет.
Выходит, больше 3000 лет...
Скажите, а почему именно эти величины, а не другие?
Выбор небольшой. Данные по парам "отец-сын" не охватывают всю панель на 111 локусов с достаточной точностью. Остаются только калибровки, сделанные по большому массиву различных выборок гаплотипов. Известная калибровка Чандлера, продолженная Биттлзом, - на 67 маркеров. Для 111-маркерных STR гаплотипов есть две калибровки скорости мутаций. Это калибровки Клесова-Рожанского и финна Хейнилы. Исходя из данных по парам "отец-сын", я и предложил Вам среднюю скорость Хейнилы.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 37027
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3757/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #354 : 05 Февраль 2015, 08:10:54 »
Скажите, а почему именно эти величины, а не другие?

А я по собственным калибровкам использую на 111 маркерах при небольших генетических дистанциях округлённый поколенный интервал 30 лет на поколение и скорость мутаций 0.0037 мутации на маркер на поколение.


:)

Оффлайн Andrei_Ragnar

  • Сообщений: 46
  • Страна: by
  • Рейтинг +7/-0
  • От Булавешки до Беловешкина
  • Y-ДНК: N1c
  • мтДНК: D5a3a
Добрый день!
Поделитесь, пожалуйста, ссылкой на расширение для экселя для подсчета время жизни общего предка.
Если можно, заодно спрошу какие из указанные регионов быстрее всего мутируют?
DYS 390, 458, 454, Y-GATA-H4, CDY, DYS 481.
Просто у меня есть пару польских совпаденцев с расстоянием 5 и 6 шагов на 67.
И появился один географически очень близко (восток Беларуси, всего 100 км от меня), но с расстоянием 6 на 67.
Если я понимаю про разную скорость мутаций, то далекий поляк 5 на 67 может быть и чуть дальше, чем близкий сосед
6 на 67?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15198
  • Страна: az
  • Рейтинг +4566/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1

Оффлайн Emir

  • Maternal Y-DNA: I-M253
  • Сообщений: 455
  • Страна: uz
  • Рейтинг +40/-0
  • Ton'yaklı Başkortostan
  • Y-ДНК: R1b->U106->Z19(Z18)
  • мтДНК: K1a5a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #357 : 30 Апрель 2021, 13:55:15 »
13   22   14   11   11-13   12   12   11   13   13   29   19   9-9   11   11   25   15   19   29   15-15-17-17   11   11   19-23   15   15   17   17   36-37   12   12   11   10   15-16   8   11   10   8   10   10   12   23-23   15   10   12   12   15   8   12   21   20   13   12   11   13   11   11   13   12   35   15   9   14   12   25   26   19   12   11   12   12   10   9   11   12   10   11   11   30   12   12   25   13   10   10   22   15   19   14   24   17   13   16   25   12   23   18   10   14   17   9   12   11

13   22   14   11   11-13   12   12   11   13   13   29   18   9-10   11   11   25   15   19   29   15-15-16-17   11   11   19-23   15   15   16   16   36-37   12   12   11   10   15-16   8   10   10   8   10   10   12   23-23   15   10   12   12   15   8   12   22   20   13   12   11   13   11   11   13   12   36   15   9   14   11   25   26   19   11   11   12   12   10   9   11   12   10   11   11   30   12   12   25   13   10   10   21   15   18   14   24   17   12   16   25   12   23   18   10   14   17   9   12   11

помогите определить время до общего предка?)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.