Определение времени до общего Предка (TMRCA)

[Шад]

Если какая то примерная привязка по маркерам , у обладателей одного снипа , к определению времени до общего предка ? Ну например , на 67 маркерах : 4 шага - 300 лет   ?  6 шагов 700 лет ? и так далее . И сколько лет будет до общего предка при 12 шагах ? при 18 шагах ?  Cпасибо

Свежак от ФТДНА:
Distance: > 11 - Not Related
You are not related and the odds greatly favor that you have not shared a common male ancestor with this person within thousands of years.

Как это соотносится с двумя методами расчета генетической дистанции в базе Семаргла?
Они считаются по "методике FTDNA"?

[VVR]

Ха. Т.е. наличие общего предка презюмируется, но где-то за горизонтом времен? За тысячи лет до настоящего времени?

Самый близкий пример, который видел, венед Z92 и гт L342. Общий предок, наверное тысяч 6 назад. ГД=13 на 67м.

[Nimissin]

Общий предок, наверное тысяч 6 назад. ГД=13 на 67м.

ГД=13 на 67 маркеров - это вряд ли 6 тыс.лет. Намного меньше. На 2 делили?

[Eugene]

У N1c1 тоже есть такие - когда совсем разные субклады (подтвержденные) на 67 GD-15 например. Некоторые даже в лист матчей ФТДНА попадают на 37 маркерах с GD-4.

Для примера у меня по yesearch есть R1b1 которые GD-44 и при этом N который GD-52.

Так что все бывает 

[VVR]

Общий предок, наверное тысяч 6 назад. ГД=13 на 67м.

ГД=13 на 67 маркеров - это вряд ли 6 тыс.лет. Намного меньше. На 2 делили?

Так в этом и есть пример. Гомоплазное сближение двух далеко удалённых гаплотипов. Естественно ничего я не делил, потому как не считал по этим двум гаплотипам. Средняя ГД между двумя гаплотипами этих субкладов будет намного больше. Здесь просто крайний случай.

[пенелопа]

Перенесено: http://forum.molgen.org/index.php/topic,5467.0.html

[Юрий C]

Здравствуйте!
Прочитал недавно статью Кубарева "Генетические дистанции кузенов Рюриковичей". Там есть расчетная формула: "T = n/N/K/ln(n/N)  или  n/N/ln(n/N) = KT,

где T – время до общего предка в поколениях, n – количество мутаций во всех N гаплотипах выборки, K – средняя скорость (частота) мутаций, выраженная в числе мутаций на маркер на поколение, ln – натуральный логарифм."

Хотелось бы узнать мнение, о возможности ее применения.

[Nimissin]

Здравствуйте!
Прочитал недавно статью Кубарева "Генетические дистанции кузенов Рюриковичей". Там есть расчетная формула: "T = n/N/K/ln(n/N)  или  n/N/ln(n/N) = KT,

где T – время до общего предка в поколениях, n – количество мутаций во всех N гаплотипах выборки, K – средняя скорость (частота) мутаций, выраженная в числе мутаций на маркер на поколение, ln – натуральный логарифм."

Хотелось бы узнать мнение, о возможности ее применения.

Однозначно, безусловно - неверная, неправильная формула. Вывод: использовать эту формулу нельзя

[Юрий C]

Nimissin,  а по конкретней можно, в ее основе все-таки,  лежит фактический материал (конкретные генотипы Рюриковичей).

[Nimissin]

Формулы, которыми пользуются ДНК-генеалоги, выведены на основе теории вероятностей. Формула, которую "изобрел" г-н Кубарев, приближает его гаплотип к Рюриковичам. На самом деле он не принадлежит к Рюриковичам, поскольку возраст общего предка Кубарева и Рюриковичей не укладывается в исторические датировки. Рекомендую прочитать многочисленные статьи Адамова, Каржавина, Киреева, опубликованные в RJGG

http://ru.rjgg.org/

[пенелопа]

Timing of ancient human Y lineage depends on the mutation rate: A comment on Mendez et al

Mendez et al. recently report the identification of a Y chromosome lineage from an African American that is an outgroup to all other known Y haplotypes, and report a time to most recent common ancestor, TMRCA, for human Y lineages that is substantially longer than any previous estimate. The identification of a novel Y haplotype is always exciting, and this haplotype, in particular, is unique in its basal position on the Y haplotype tree. However, at 338 (237-581) thousand years ago, kya, the extremely ancient TMRCA reported by Mendez et al. is inconsistent with the known human fossil record (which estimate the age of anatomically modern humans at 195 +- 5 kya), with estimates from mtDNA (176.6 +- 11.3 kya, and 204.9 (116.8-295.7) kya) and with population genetic theory. The inflated TMRCA can quite easily be attributed to the extremely low Y chromosome mutation rate used by the authors.

http://arxiv.org/abs/1304.6098v1
http://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/1304/1304.6098.pdf

[Юрий C]

Когда нет хорошей теории, человек опирается на авторитеты и это, печально.
Теория объективна, авторитет субъективен.

[Юрий C]

Может, я чего-то не понимаю: «...недавно (2009) опубликована блестящая работа, совместно Гарвардским ун-том и МТИ, в которой показано, что скорости мутаций постоянны на протяжении последних 2 миллионов лет (от шимпанзе до современного человека). Это - фактически молекулярные часы». - это говорит Клесов.
 Из этого высказывания, можно сделать вывод, что существует просто идеальная теория. Но, можно задать вопрос, кто-нибудь, например, изучал фактор, влияния на Y-хромосому связанный с Чернобыльской аварией и т.д.?

[Юрий C]

Возьмем, к примеру, два 37-маркерных  гаплотипа:


1) 13   24   15   11   11-15   12   12   10   13   11   30   15   9-9   11   11   25   14   20   32   12-14-14-16   11   12   19-23   15   16   18   20   34-41   12
2) 13   24   15   11   11-15   12   12   10   13   11   31   15   9-9   11   11   26   14   20   32   12-14-14-16   11   12   19-23   15   16   21   20   36-37   12

1) - гаплотип, это Salavat Kamilevich Nasyrov
2) - гаплотип, это Коморенко Федор Федорович
Это,  два типичных Венеда. Понятно, ФИО этих людей не нуждается в коментах. Но, если обратить внимание на маркер - CDY, то явно видна разница в 6 мутаций. В связи с этим, можно сделать предположение, что эта резкая разница возникла тогда, когда Nasyrov резко сменил физико-географические  условия проживания и этнос. Поэтому, говорить о некой равномерной скорости мутаций, будет весьма сомнительно.

[Аббат Бузони]

Феерично.