АвторТема: Определение времени до общего Предка (TMRCA)  (Прочитано 78579 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 14910
  • Страна: az
  • Рейтинг +4351/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #270 : 13 Февраль 2013, 13:00:53 »
Цитировать
Если какая то примерная привязка по маркерам , у обладателей одного снипа , к определению времени до общего предка ? Ну например , на 67 маркерах : 4 шага - 300 лет   ?  6 шагов 700 лет ? и так далее . И сколько лет будет до общего предка при 12 шагах ? при 18 шагах ?  Cпасибо

Свежак от ФТДНА:
Distance: > 11 - Not Related
You are not related and the odds greatly favor that you have not shared a common male ancestor with this person within thousands of years.

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6683
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1021/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #271 : 13 Февраль 2013, 13:17:04 »
Все правильно написали.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6317
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1277/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #272 : 13 Февраль 2013, 13:18:29 »
Цитировать
Если какая то примерная привязка по маркерам , у обладателей одного снипа , к определению времени до общего предка ? Ну например , на 67 маркерах : 4 шага - 300 лет   ?  6 шагов 700 лет ? и так далее . И сколько лет будет до общего предка при 12 шагах ? при 18 шагах ?  Cпасибо

Свежак от ФТДНА:
Distance: > 11 - Not Related
You are not related and the odds greatly favor that you have not shared a common male ancestor with this person within thousands of years.

Ха. Т.е. наличие общего предка презюмируется, но где-то за горизонтом времен? За тысячи лет до настоящего времени?

Оффлайн Mukovnikov

  • Сообщений: 1470
  • Страна: ru
  • Рейтинг +236/-6
  • Y-ДНК: N-Y4339>Y5611>F1983>S10880; мжм: N
  • мтДНК: K1c1e; мж - V13; ммж - J1c4b; мммж - H
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #273 : 13 Февраль 2013, 13:30:35 »
У FTDNA система подсчета матчей (совпадений) порочна. Я так понял, что первые панели в этой системе важнее, чем последующие, поэтому, например, у меня в матчах стоят только:

А все, кто из кластера рюрикидов, отбрасываются ею еще на этапе сравнения по 111 маркерам, так как у меня уже dys19 (стоящий третьим), мутирован в 15 (как у большинства L1025, т.е. гомоплазия).

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6317
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1277/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #274 : 13 Февраль 2013, 14:38:37 »
Цитировать
Если какая то примерная привязка по маркерам , у обладателей одного снипа , к определению времени до общего предка ? Ну например , на 67 маркерах : 4 шага - 300 лет   ?  6 шагов 700 лет ? и так далее . И сколько лет будет до общего предка при 12 шагах ? при 18 шагах ?  Cпасибо

Свежак от ФТДНА:
Distance: > 11 - Not Related
You are not related and the odds greatly favor that you have not shared a common male ancestor with this person within thousands of years.

Как это соотносится с двумя методами расчета генетической дистанции в базе Семаргла?
Они считаются по "методике FTDNA"?

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2462
  • Страна: ua
  • Рейтинг +616/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #275 : 13 Февраль 2013, 15:00:44 »

Ха. Т.е. наличие общего предка презюмируется, но где-то за горизонтом времен? За тысячи лет до настоящего времени?
Самый близкий пример, который видел, венед Z92 и гт L342. Общий предок, наверное тысяч 6 назад. ГД=13 на 67м.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2347
  • Рейтинг +724/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #276 : 13 Февраль 2013, 15:35:04 »
Общий предок, наверное тысяч 6 назад. ГД=13 на 67м.
ГД=13 на 67 маркеров - это вряд ли 6 тыс.лет. Намного меньше. На 2 делили?

Оффлайн Eugene

  • Санктпетербурхъ
  • Сообщений: 6683
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1021/-41
    • N1c1 Y-DNA Project
  • Y-ДНК: N-BY32524
  • мтДНК: U-C1341T
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #277 : 13 Февраль 2013, 16:22:51 »
У N1c1 тоже есть такие - когда совсем разные субклады (подтвержденные) на 67 GD-15 например. Некоторые даже в лист матчей ФТДНА попадают на 37 маркерах с GD-4.

Для примера у меня по yesearch есть R1b1 которые GD-44 и при этом N который GD-52.

Так что все бывает  :)

Оффлайн VVR

  • ...
  • Сообщений: 2462
  • Страна: ua
  • Рейтинг +616/-0
  • Y-ДНК: o.R1a1a1b1a2a1a1a1e~-YP569,YP1260+;м.R1a1a1b1a1a1a2~-L260,YP1337+
  • мтДНК: K1c1h
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #278 : 13 Февраль 2013, 23:42:02 »
Общий предок, наверное тысяч 6 назад. ГД=13 на 67м.
ГД=13 на 67 маркеров - это вряд ли 6 тыс.лет. Намного меньше. На 2 делили?
Так в этом и есть пример. Гомоплазное сближение двух далеко удалённых гаплотипов. Естественно ничего я не делил, потому как не считал по этим двум гаплотипам. Средняя ГД между двумя гаплотипами этих субкладов будет намного больше. Здесь просто крайний случай.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6168
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2419/-13
  • мтДНК: H1b

Оффлайн Юрий C

  • Сообщений: 413
  • Страна: ru
  • Рейтинг +108/-1
  • Y-ДНК: R1a1a R-FGC46016 № 264855
  • мтДНК: T2b
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #280 : 16 Апрель 2013, 10:03:33 »
Здравствуйте!
Прочитал недавно статью Кубарева "Генетические дистанции кузенов Рюриковичей". Там есть расчетная формула: "T = n/N/K/ln(n/N)  или  n/N/ln(n/N) = KT,

где T – время до общего предка в поколениях, n – количество мутаций во всех N гаплотипах выборки, K – средняя скорость (частота) мутаций, выраженная в числе мутаций на маркер на поколение, ln – натуральный логарифм."

Хотелось бы узнать мнение, о возможности ее применения.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2347
  • Рейтинг +724/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #281 : 16 Апрель 2013, 16:58:17 »
Здравствуйте!
Прочитал недавно статью Кубарева "Генетические дистанции кузенов Рюриковичей". Там есть расчетная формула: "T = n/N/K/ln(n/N)  или  n/N/ln(n/N) = KT,

где T – время до общего предка в поколениях, n – количество мутаций во всех N гаплотипах выборки, K – средняя скорость (частота) мутаций, выраженная в числе мутаций на маркер на поколение, ln – натуральный логарифм."

Хотелось бы узнать мнение, о возможности ее применения.
Однозначно, безусловно - неверная, неправильная формула. Вывод: использовать эту формулу нельзя

Оффлайн Юрий C

  • Сообщений: 413
  • Страна: ru
  • Рейтинг +108/-1
  • Y-ДНК: R1a1a R-FGC46016 № 264855
  • мтДНК: T2b
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #282 : 16 Апрель 2013, 17:03:58 »
Nimissin,  а по конкретней можно, в ее основе все-таки,  лежит фактический материал (конкретные генотипы Рюриковичей).

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2347
  • Рейтинг +724/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b12a
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #283 : 16 Апрель 2013, 17:33:23 »
Формулы, которыми пользуются ДНК-генеалоги, выведены на основе теории вероятностей. Формула, которую "изобрел" г-н Кубарев, приближает его гаплотип к Рюриковичам. На самом деле он не принадлежит к Рюриковичам, поскольку возраст общего предка Кубарева и Рюриковичей не укладывается в исторические датировки. Рекомендую прочитать многочисленные статьи Адамова, Каржавина, Киреева, опубликованные в RJGG

http://ru.rjgg.org/

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6168
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2419/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Определение времени до общего Предка (TMRCA)
« Ответ #284 : 26 Апрель 2013, 13:45:44 »
Timing of ancient human Y lineage depends on the mutation rate: A comment on Mendez et al

Mendez et al. recently report the identification of a Y chromosome lineage from an African American that is an outgroup to all other known Y haplotypes, and report a time to most recent common ancestor, TMRCA, for human Y lineages that is substantially longer than any previous estimate. The identification of a novel Y haplotype is always exciting, and this haplotype, in particular, is unique in its basal position on the Y haplotype tree. However, at 338 (237-581) thousand years ago, kya, the extremely ancient TMRCA reported by Mendez et al. is inconsistent with the known human fossil record (which estimate the age of anatomically modern humans at 195 +- 5 kya), with estimates from mtDNA (176.6 +- 11.3 kya, and 204.9 (116.8-295.7) kya) and with population genetic theory. The inflated TMRCA can quite easily be attributed to the extremely low Y chromosome mutation rate used by the authors.

http://arxiv.org/abs/1304.6098v1
http://arxiv.org/ftp/arxiv/papers/1304/1304.6098.pdf

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.