АвторТема: Гаплогруппа R0  (Прочитано 1484 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн SiberianАвтор темы

  • Сообщений: 50
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: R1a
  • мтДНК: R0
Гаплогруппа R0
« : 14 Август 2023, 09:17:33 »
23@me определил мне МТ-гаплогруппу как R0. Но такой я здесь даже в перечне не обнаружил. Вот записываю. Все, что я знаю о происхождении по материнской линии, что пра-бабушка родилась конце 19 века на Алтае, в современном Целинном р-оне, село Верх-Бехтемир. В девичестве Полосухина. Из старожилов. Часть фамилии достоверно относилась к раскольникам еще в 19 веке. Я составил довольно "ветвистое" дерево Полосухиных, проживавших в этом селе. Но запись о рождении прабабушки не найдена (на эти годы похоже не сохранились МК). Поэтому родословная и ее взаимосвязь с остальными Полосухиными (с понятной степенью достоверности) составлена по "косвенным записям".
« Последнее редактирование: 14 Август 2023, 10:54:31 от Siberian »

Оффлайн DELTA

  • Сообщений: 1136
  • Страна: ru
  • Рейтинг +425/-0
  • Y-ДНК: I2a-Y3120--PH908--FTT65; род деда N1a-L550
  • мтДНК: W6a4
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #1 : 14 Август 2023, 19:00:29 »
Достаточно редкая мт-гаплогруппа, представлена группой R0a'b  https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/R . Представители из Саудовской Аравии, Италии, Польши, ... в России 7 представителей, 5 из которых из ветви R0a2m

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #2 : 14 Август 2023, 20:15:07 »
Достаточно редкая мт-гаплогруппа, представлена группой R0a'b  https://www.familytreedna.com/public/mt-dna-haplotree/R . Представители из Саудовской Аравии, Италии, Польши, ... в России 7 представителей, 5 из которых из ветви R0a2m

Про саудовские ветви R0a2m не знаю, не встречал сиквенсов оттуда (притом что других R0a там завались). В Европе R0a2m - почти исключительно еврейская линия: ~ 2.5% у ашкеназов и еще больше (по памяти не скажу сколько) у балеарских чуэтас.

Примечательно, что из дерева YFull это заключить никак нельзя  ::)

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #3 : 14 Август 2023, 20:20:45 »
23@me определил мне МТ-гаплогруппу как R0

скорее это недоопределенная из-за no call'ов HV/H, чем "южные" ветви R0. Бывает, но достаточно редко.

Оффлайн SiberianАвтор темы

  • Сообщений: 50
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: R1a
  • мтДНК: R0
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #4 : 14 Август 2023, 20:31:06 »
Как ни парадоксально, но польский след не исключен. В Сибирь ссылали поляков (настоящих) пачками. И есть еще один штрих - когда я ребенком ездил к прабабушке в гости, она подарила мне польскую старую монету. О том, что она (монета) польская сказал отец, который родился и вырос на западе современной Гродненской области, где и сейчас поляки есть, а до соответствующих событий их было очень много... Но монету я не сберег... Двоюродный кузен мамы (у них общая бабушка), который вроде как алтайский сторожил до N... знает какого колена, в "совпаденцах" имеет поляков, литовцев, чехов... В общем, интересная мысль. Спасибо
На счет евреев… Только не надо в меня кидать всякого разного… Я изучил не менее полусотни различных архивных документов 18-19 веков по локации проживания алтайских предков. Все найденные ветви до обращения в единоверие и далее в православие были раскольниками того или иного толка. А имена у исконно русских раскольников очень даже интересные Самуил, Епинет, Мамонт, Натан, Руф, Иуда. Это то, что сразу из памяти всплыло. С учетом того, что «поляками» в Сибири называли раскольников, «выведенных» при Екатерине 2 из Польши (Ветка и Стародуб тогда входили в РП), то и еврейский след, занесенный из Речи Посполитой не особо удивляет
ЗЫ у меня есть аккаунт на ФТДНА. Я там Y-37 делал и FF Но они не дадут занести данные от 23&me А 23, если не врет, пишет, что такая гаплогруппа у каждого 125 зарегистр пользователя. На ГедМатч в совпаденцах есть несколько человек с R0, но далеких. Попробую написать, чтобы хотя бы определить локацию
« Последнее редактирование: 14 Август 2023, 20:40:37 от Siberian »

Оффлайн DELTA

  • Сообщений: 1136
  • Страна: ru
  • Рейтинг +425/-0
  • Y-ДНК: I2a-Y3120--PH908--FTT65; род деда N1a-L550
  • мтДНК: W6a4
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #5 : 14 Август 2023, 20:32:48 »
Про саудовские ветви R0a2m не знаю...

Ветвь R0a'b определена у 99 саудовских образцов.
"в России 7 представителей, 5 из которых из ветви R0a2m" тут только про российские 5 образцов с R0a2m.


Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #6 : 14 Август 2023, 20:38:54 »
Ветвь R0a'b определена у 99 саудовских образцов.

Речь не о R0a вообще (опубликованных саудовских и побольше 100 будет, Аравия это эпицентр сразу нескольких ветвей), а конкретно про R0a2m.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #7 : 14 Август 2023, 20:41:34 »
Бывает, но достаточно редко.

Глянул в свою базу по русским-украинцам-беларусам. R0a'b там 7/5500, что равняется 0.14% += 0.13% на уровне достоверности 0.99. То есть чуть более одной тысячной.

В основном они R0a1a.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #8 : 14 Август 2023, 20:47:39 »
только про российские 5 образцов с R0a2m.

это ашкеназы, даже если явно не указано

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #9 : 14 Август 2023, 20:55:39 »
Но они не дадут занести данные от 23&me

Не надо мт оттуда никуда грузить, это аутосомы можете на другие сайты добавлять, всегда полезно. Но с мт вам этот трюк ничем не поможет.

Надо взять сырой файл от 23me и глянуть на снип 14766. Если он -- (no call) то вы можете быть и недотипированный HV, тк эта гг лежит внутри R0. Если же аллель TT, то вы и правда R0a'b.

Как найти эту позицию в сыром файле от 23ми - не знаю, у них другая нумерация позиций, номер будет немножко больше, на 1 или 2, тк референс другой. Спросите у тех кто в курсе мтшной записи от 23.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #10 : 14 Август 2023, 21:10:55 »
или еще проще сделайте grep rs527236041 <raw data file name>
сразу получите ответ

Оффлайн SiberianАвтор темы

  • Сообщений: 50
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: R1a
  • мтДНК: R0
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #11 : 14 Август 2023, 21:14:39 »
сырой файл это много-много цифр, с такой вот преамбулой

# Этот файл содержит необработанные данные о генотипе, включая данные, которые не используются в отчетах 23andMe.
# Эти данные прошли общую проверку качества, однако была проверена только часть маркеров.
# индивидуально проверяется на точность. Таким образом, эти данные подходят только для исследований,
# использование в образовательных и информационных целях, а не в медицинских или иных целях.
#
# Ниже представлена текстовая версия ваших данных. Поля разделены TAB
# Каждая строка соответствует одному SNP. Для каждого SNP мы предоставляем его идентификатор
# (rsid или внутренний идентификатор), его местонахождение в эталонном геноме человека и
# вызов генотипа ориентирован по отношению к плюсовой цепи референсной последовательности человека.
# Мы используем эталонную человеческую сборку сборки 37 (также известную как Annotation Release 104).
# Обратите внимание, что данные, загруженные в разное время, могут отличаться из-за текущих
# улучшения в нашей способности вызывать генотипы. Дополнительную информацию об этих изменениях можно найти по адресу:
# https://you.23andme.com/p/468a17326414deed/tools/data/download/
#

Если здесь нет того, кто знает что и где искать в тех бесконечных столбцах чисел, то я даже не знаю, где еще можно спросить ;D
ЗЫ Я извиняюсь за недалекость, но в каком месте и что написать, чтобы получить результат абсолютно не понял :'(
поиск через CtrlF rs527236041 в этих столбцах цифр результатов не дал Не найдено...
« Последнее редактирование: 14 Август 2023, 21:29:02 от Siberian »

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #12 : 14 Август 2023, 22:27:13 »
поиск через CtrlF rs527236041 в этих столбцах цифр результатов не дал Не найдено...

там файл на много мегабайт
не факт что ctrl+F дошел до конца

поищите ctrl+F 14766 14768
вот вам контекст:

grep rs527236041 -A 10 -B 10 aln.23me/23me.example.txt

Цитировать
i702970   MT   14708   --
i3001315   MT   14726   --
i701747   MT   14726   --
i5050314   MT   14742   --
i705659   MT   14742   --
i702035   MT   14749   --
i3001318   MT   14754   --
i701667   MT   14754   --
i6001168   MT   14756   --
i703241   MT   14756   --
rs527236041   MT   14766   CC
i3001320   MT   14768   --
i702174   MT   14768   --
rs28357680   MT   14782   --
i3001520   MT   14782   --
i706788   MT   14782   --
i703591   MT   14793   --
i5050381   MT   14814   --
i705856   MT   14814   --
i704018   MT   14818   --
i704125   MT   14830   --


Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1391/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #13 : 14 Август 2023, 23:05:15 »
но в каком месте и что написать, чтобы получить результат абсолютно не понял :'(

если вы под windows, то вместо grep используйте в power shell

findstr rs527236041 My23meResults.txt

Оффлайн SiberianАвтор темы

  • Сообщений: 50
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: R1a
  • мтДНК: R0
Re: Гаплогруппа R0
« Ответ #14 : 15 Август 2023, 10:20:39 »
Я беру паузу. Надо плотнее разобраться. Мож я не то выгрузил, но в файле genome_имя_фамилия_v5_Full_20230804121***  я не нашел ничего похожего  ???

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.