Национальная генетическая инициатива «100 000+Я»

[Olimp]

Здравствуйте ! Попалась вот такое ноу-хау https://www.biotechcampus.ru/ Для работников Роснефти бесплатно) Есть мысли, как на практики можно применить результаты?

[Nimissin]

Здравствуйте ! Попалась вот такое ноу-хау https://www.biotechcampus.ru/ Для работников Роснефти бесплатно) Есть мысли, как на практики можно применить результаты?

Проект в стадии наращивания числа просеквенированных образцов.
https://pcr.news/stati/polnye-genomy-100-tysyach-rossiyan-budut-prochitany-k-kontsu-2025-goda/

[Olimp]

Интересно какие на руки результаты будут выданы и можно их на Yfull загрузить?

[Penny]

Интересно какие на руки результаты будут выданы и можно их на Yfull загрузить?

Тут уже была такая тема или вопрос от человека, который уже получил результаты на руки. Поищите поиском.

[Georg]

Интересно какие на руки результаты будут выданы и можно их на Yfull загрузить?

https://forum.molgen.org/index.php?action=profile;u=9871 делал

Можно делать что угодно, это обычные bam и vcf

[cheremis]

нет, у меня другой проект же - от Норникеля. Выполнял Эвоген. Полный геном. Возможно его уже прикрыли? Не слышно последний год рекламы.

[Capo]

Добрый день, я сдавал по этой программе. Забрал у них результаты теста в формате FASTQ, записали мне на флешку. Потом загрузил на yfull)

[Nimissin]

Добрый день, я сдавал по этой программе. Забрал у них результаты теста в формате FASTQ, записали мне на флешку. Потом загрузил на yfull)

Добрый день. А какая у Вас ветвь на дереве игрек-хромосомы?

[Capo]

R1b

[Georg]

У меня оказался родственник в структурах дочек Роснефти, так что я сдал образцы.
Заодно на месте сдачи пообщался с 2 сотрудниками биобанка.
Сказали, что раньше окончания 2025 они ничем, кроме сбора не будут заниматься, а потом будут ждать денег на научные программы по анализу данных. И в приоритете медицинская генетика, конечно, не популяционная или однородительские маркеры.хотя рядом где-то с ними Балановская находится.
С yfull , генотеком общаются в рамках обмена опытом, но никаких договоренностей по передаче программ для анализа или совместного изучения нет.
Мой интерес прошерстить их базу по нужным мне снипам Y поняли, но ничего не смогли пообещать.

[dnk777]

Здравствуйте, подскажите, пожалуйста, из тех результатов, что выдают:
Y-хромосомная гаплогруппа (R1b1... всего 15 знаков) и Митохондриальная гаплогруппа (V13), из этого можно что-то полезное получить?
или только полные файлы 600 гигабайт загружать куда-то для анализа?

[Georg]

Здравствуйте, подскажите, пожалуйста, из тех результатов, что выдают:
Y-хромосомная гаплогруппа (R1b1... всего 15 знаков) и Митохондриальная гаплогруппа (V13), из этого можно что-то полезное получить?
или только полные файлы 600 гигабайт загружать куда-то для анализа?

Как минимум похвалитесь своими результатами в вашей теме https://forum.molgen.org/index.php/topic,6888.msg601839.html#new
И
https://forum.molgen.org/index.php/topic,10302.msg391716.html#new
Там ваши дальние родственники подскажут, куда копать дальше.
Бояться, что вас как-то идентифицируют, не стоит.

[пенелопа]

В интервью д.б.н. К.Северинов (руководитель проекта) говорит, что программа успешно завершена. Половина геномов - от здоровых людей, половина - от больных, их можно сравнивать и работать по медицинской части. Далее программа продолжается до миллиона геномов. Китайцы (возглавившие гонку секвенирования) говорят, что для медицины надо секвенировать один процент населения любой страны, тогда будет результат)
У нас работает та же лаборатория в Курчатнике, которая использовалась по сабжу, способная секвенировать по 1000 полных геномов в неделю.

P.S. Генетическое оружие на основе этих данных - бред) (почти цитирую). Столько же полных геномов, как в России, давно сделано за рубежом (русские, белорусы, украинцы, якуты и т.д.). Воровать и угонять эти данные из этого проекта нет смысла. Люди передвигаются, уезжают, секвенируй - не хочу. Смысла запираться Китаю - тоже не видно)) Забирать с собой стаканчики с ДНК из кафе можно (за китайцами замечено), но полученный врагами геном покажет, разве что, когда конкретный индивидум может крякнуть)) Сильно приблизительно. Для разведки, наверное, важно.
https://www.ntv.ru/peredacha/Pozdnyakov/m50720/o779357/?ysclid=mp6gc7jgvj336808868

[Tanasquel]

емнип британцы китайцам по рукам дали и доступ к биобанку прикрыли.
https://provizor24.ru/news/tpost/aa6iu0upb1-chego-ne-naidesh-na-kitaiskih-marketplei
В статье об этом прямо не говориться, но слухи циркулировали давно.

[Древ]

Здравствуйте, подскажите, пожалуйста, из тех результатов, что выдают:
Y-хромосомная гаплогруппа (R1b1... всего 15 знаков) и Митохондриальная гаплогруппа (V13), из этого можно что-то полезное получить?
или только полные файлы 600 гигабайт загружать куда-то для анализа?

Да, можно! Но это сильно ограниченная информация. К тому же, неудобная для интерпретации.
А вот кабы вы залились на YFULL, вы бы очень может быть куда-то продвинулись и сами увидели древо и всё бы поняли.
И перспектива была бы! например, сейчас у вас терминальный снип какой-то есть и глубже не продвинуться, потому что не с кем сравнить. А через 10 лет появится образец, который даст вам собственную, более молодую ветку. Разве плохо?
Или вот взять вашу мито-гаплогруппу V13. У неё есть нисходящие ветви: V13*, V13a, V13b, V13c
А у V13b есть ещё нисходящие V13b*, V13b1, V13b2 У других нисходящих нет лишь потому, что там мало образцов. Может быть, именно вашего нехватает.
К какой из них относитесь вы? Вот, зальётесь на YFULL и узнаете!