АвторТема: Компания Nebula Genomics  (Прочитано 74744 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1467
  • Страна: hu
  • Рейтинг +269/-7
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #870 : 09 Март 2024, 14:57:00 »
Господа, как думаете ? Когда следующие скидки?

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #871 : 03 Апрель 2024, 19:04:36 »
Образцы Nebula загружаются на Yfull в T2T формате. Полагаю, что обработка проходит на стороне Yfull. Но длина покрытия заметно меньше, чем те образцы которые я загружаю. Интересно с чем это связано.

Оффлайн ETOBOG

  • Сообщений: 84
  • Страна: ru
  • Рейтинг +35/-2
  • Индия + РФ
  • Y-ДНК: R1a-Y1 (Индия)
  • мтДНК: J1c2c2a (РФ)
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #872 : 03 Апрель 2024, 21:47:46 »
Образцы Nebula загружаются на Yfull в T2T формате. Полагаю, что обработка проходит на стороне Yfull. Но длина покрытия заметно меньше, чем те образцы которые я загружаю. Интересно с чем это связано.

У меня давно был залит полный геном от Небулы на Yfull, недавно доплатил Yfull`у и он скачал геном Небулы и сам его обработал в формат T2T

Оффлайн julliap

  • Сообщений: 6
  • Рейтинг +1/-0
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #873 : 28 Июнь 2024, 12:12:11 »
Всем добрый день. Я сделала Whole Genome Sequencing в Nebula.
Они предлагают скачать результаты в следующих форматах: VCF, CRAM, FASTQ
Какие есть сервисы или программы, с помощью которых можно интерпретировать эти данные?
Promethease их не принимает. Интересуют как генеалогические, так и медицинские данные.
« Последнее редактирование: 28 Июнь 2024, 12:18:35 от julliap »

Оффлайн julliap

  • Сообщений: 6
  • Рейтинг +1/-0
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #874 : 28 Июнь 2024, 15:50:58 »

Вам нужно установить на компьютер wgse, запустить анализ cram файла и выжимки аутосом залить на ftdna, myheritage (с vpn), gedmatch - там будут десятки родственников 3-5 кузены и сотни в 5+ поколениях от вас.

а где можно скачать wgse?

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 759
  • Страна: ru
  • Рейтинг +238/-5
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a, дети T1a1ct и H5b*
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #875 : 28 Июнь 2024, 16:58:20 »

Вам нужно установить на компьютер wgse, запустить анализ cram файла и выжимки аутосом залить на ftdna, myheritage (с vpn), gedmatch - там будут десятки родственников 3-5 кузены и сотни в 5+ поколениях от вас.

а где можно скачать wgse?
https://wgsextract.github.io/
Лучше, пожалуй, beta
Экспорт в разные форматы, в том числе ancestry, 23andme. Но насчёт совместимости надо экспериментировать, нет гарантии, что сервисы это примут.

Насчёт медицинских данных - большинство ресурсов анализируют это за деньги. Но при наличии подписки nebula, вы и так можете посмотреть отчёты по ключевым рискам

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 696
  • Страна: ru
  • Рейтинг +183/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #876 : 28 Июнь 2024, 21:37:17 »
Всем добрый день. Я сделала Whole Genome Sequencing в Nebula.
Они предлагают скачать результаты в следующих форматах: VCF, CRAM, FASTQ
Какие есть сервисы или программы, с помощью которых можно интерпретировать эти данные?
Promethease их не принимает. Интересуют как генеалогические, так и медицинские данные.
https://www.familytreedna.com/ заливка платная
https://www.myheritage.com/ строго под ВПН и нигде не указывать что РФ
https://www.genotek.ru/
https://www.gedmatch.com/

Ещё можно поразвлекаться https://mytrueancestry.com/ (можно бесплатно)

Оффлайн Penny

  • Сообщений: 290
  • Рейтинг +27/-3
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #877 : 28 Июнь 2024, 22:04:06 »
Всем добрый день. Я сделала Whole Genome Sequencing в Nebula.
Они предлагают скачать результаты в следующих форматах: VCF, CRAM, FASTQ
Какие есть сервисы или программы, с помощью которых можно интерпретировать эти данные?
Promethease их не принимает. Интересуют как генеалогические, так и медицинские данные.
https://www.familytreedna.com/ заливка платная
https://www.myheritage.com/ строго под ВПН и нигде не указывать что РФ
https://www.genotek.ru/
https://www.gedmatch.com/

Ещё можно поразвлекаться https://mytrueancestry.com/ (можно бесплатно)
FTDNA ведь бесплатная была. Разве изменили?

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 696
  • Страна: ru
  • Рейтинг +183/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #878 : 28 Июнь 2024, 22:18:21 »
FTDNA ведь бесплатная была. Разве изменили?
Есть тест не у них делался, то заливка платная. 15 баксов, по-моему

Оффлайн Penny

  • Сообщений: 290
  • Рейтинг +27/-3
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #879 : 28 Июнь 2024, 22:25:16 »
FTDNA ведь бесплатная была. Разве изменили?
Есть тест не у них делался, то заливка платная. 15 баксов, по-моему
Я бесплатно заливала со сторонней лаборатории неск. месяцев назад. Вряд ли цена могла подскочить с 0 до 15.

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R-L365->YP940>R-FT439430
  • Сообщений: 1013
  • Страна: 00
  • Рейтинг +440/-4
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1a
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #880 : 28 Июнь 2024, 22:26:27 »
FTDNA ведь бесплатная была. Разве изменили?
Есть тест не у них делался, то заливка платная. 15 баксов, по-моему

Ну не путайте, денег там хотят только за unlock Origin

Оффлайн julliap

  • Сообщений: 6
  • Рейтинг +1/-0
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #881 : 29 Июнь 2024, 07:56:19 »
Всем добрый день. Я сделала Whole Genome Sequencing в Nebula.
Они предлагают скачать результаты в следующих форматах: VCF, CRAM, FASTQ
Какие есть сервисы или программы, с помощью которых можно интерпретировать эти данные?
Promethease их не принимает. Интересуют как генеалогические, так и медицинские данные.
https://www.familytreedna.com/ заливка платная
https://www.myheritage.com/ строго под ВПН и нигде не указывать что РФ
https://www.genotek.ru/
https://www.gedmatch.com/

Ещё можно поразвлекаться https://mytrueancestry.com/ (можно бесплатно)

Я уже до этого делала тест в 23andMe, скачала и залила на все эти ресурсы  :)
Меня сейчас интересует, какие преимущества даст полногеномный тест. Можно для интереса сгенерировать файл, еще раз залить и посмотреть будут ли различия.

Да, .familytreedna дает возможность залить бесплатно и посмотреть мэтчи, платная расшифровка происхождения.

На YFull я тоже залила, YF115579
Что дальше делать с этими циферками, не очень понимаю  ;D

    Haplogroup   Selected SNP   Known SNP   Novels   Unrounded
age (ybp)   Rounded age (ybp)   Age by all samples (ybp)
− H5a1a11   2   0   2   5370   5400 (50-18600)   1300 (600-2500)
− H5a1a   4   2   2   10680   10700 (2700-26600)   3500 (2900-4200)
− H5a1   5   3   2   13334   13300 (2700-29300)   5200 (4700-5700)
− H5a   6   4   2   15989   16000 (5400-34600)   7300 (6200-8600)
− H5   7   5   2   18644   18600 (5400-37200)   9300 (8500-10200)
− H5'36
« Последнее редактирование: 29 Июнь 2024, 11:08:38 от julliap »

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 17543
  • Страна: az
  • Рейтинг +6197/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #882 : 29 Июнь 2024, 10:53:59 »
Для женщины, уже сделавшей тест в 23&me, полногеномное исследование в генеалогическом смысле уже малоинформативно.
23&me выдают вполне полновесный аутосомный пакет вместе с мито-гаплогруппой верхнего уровня. Как дополнение, Вы можете выяснить более глубокую ветвь мито-гаплогруппы, а также получить новые пересечения по X-хромосоме

Оффлайн julliap

  • Сообщений: 6
  • Рейтинг +1/-0
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #883 : 29 Июнь 2024, 11:16:58 »
Для женщины, уже сделавшей тест в 23&me, полногеномное исследование в генеалогическом смысле уже малоинформативно.
23&me выдают вполне полновесный аутосомный пакет вместе с мито-гаплогруппой верхнего уровня. Как дополнение, Вы можете выяснить более глубокую ветвь мито-гаплогруппы, а также получить новые пересечения по X-хромосоме

Я главным образом делала полный геном для медицинской информации, а генеалогия приятный бонус.
У меня получился вот такой список мэтчей https://www.yfull.com/mtree/H5a1a11/
Там есть опция написать им?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 17543
  • Страна: az
  • Рейтинг +6197/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #884 : 29 Июнь 2024, 11:24:25 »
Да, им можно написать из личного кабинета. Имя получателя соответствует его Yfull ID.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.