И тот и другой ВБОП будут сильно зависеть от внутренней структуры выборки (подвирая в сторону омоложения), поэтому я бы посоветовал взять соседний субклад (например, если Ваша выборка из X1a1b, то взять X1a1a) и посчитать общего предка двух кладов. Это будет заведомо более старый предок. Истина где-то в диапазоне между ними. По крайней мере будет понятно, на каком временнОм отрезке лежит истинный ВБОП и как велик этот отрезок.