Соматические клетки

[nilogov]

Мы тестируемся на игрек по соматическим клеткам, а не по половым. Допустим, у отца два сына. Старший сын унаследовал все мутации отца, затем у отца случилась новая мутация, которую унаследовал младший сын. Понятно, что источник мутации - отец, но в его соматических клетках, которые мы тестируем, этой новой мутации не будет, она будет только в клетках младшего сына. Новую мутацию мы припишем младшему сыну, тогда как она на самом деле случилась у его отца?..

[Farroukh]

Коллега, поскольку Вы в неэпических количествах генерируете вопросы по молекулярной биологии (и не имеющие никакого генеалогического применения), то рекомендую Вам обратиться на форум молекулярной биологии - МолБиол:
http://molbiol.ru/forums/index.php?showforum=1

Ознакомьтесь с ним - часть вопросов отпадёт сама собой

[Valery]

вопрос это по попгенетике а не молбиолу (тк мутации джермлайна - тоже попгенетика)

Новую мутацию мы припишем младшему сыну, тогда как она на самом деле случилась у его отца?..

разумеется
это оправдано тем что вероятность у другого ребенка схватить сабжевую мутацию в джермлайне отца, восходящем к тому же самому митозу (принесшему мутацию) - мала, из-за большого количества клеток мужской спермолинии

Про подтверждение эмпирикой - надо учитывать что при текущем разрешении Y 1 снип вскакивает примерно 1 раз в 130 лет. Однако инделов более чем достаточно - даже для того чтобы увидеть некий индел, которым допустим был бы у двоих сыновей, но отсутствовал у отца. Это интересная ситуация. Втч для сравнения вероятности двух сыновних линий произойти от одного отцовского спермомитоза vs гомоплазия. С всеми вытекающими. То есть от веса мутации зависит решение.

Я никаких эмпирических примеров не знаю.

[Valery]

Нужна матмодель "древа" митозов и mcmc симуляция этого дела. Не уверен что наличествующий софт позволяет: модель для рождений и смертей клеток главной стволовой линии (джермлайна) должна иметься в списке поддерживаемых софтом (не уверен что это можно аппроксимировать моделями размножения для гаплоидных патогенов, типа бактерий).

Только так можно было бы сравнить вероятности, имей мы на руках такое трио (отец и два одинаково мутантных сына).

[Farroukh]

Валер, мне очень хочется верить, что наш уважаемый коллега понял твой комментарий