АвторТема: Соматические клетки  (Прочитано 287 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн nilogovАвтор темы

  • Сообщений: 1322
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Соматические клетки
« : 14 Сентябрь 2022, 05:54:31 »
Мы тестируемся на игрек по соматическим клеткам, а не по половым. Допустим, у отца два сына. Старший сын унаследовал все мутации отца, затем у отца случилась новая мутация, которую унаследовал младший сын. Понятно, что источник мутации - отец, но в его соматических клетках, которые мы тестируем, этой новой мутации не будет, она будет только в клетках младшего сына. Новую мутацию мы припишем младшему сыну, тогда как она на самом деле случилась у его отца?..

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15156
  • Страна: az
  • Рейтинг +4541/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Соматические клетки
« Ответ #1 : 14 Сентябрь 2022, 13:57:28 »
Коллега, поскольку Вы в неэпических количествах генерируете вопросы по молекулярной биологии (и не имеющие никакого генеалогического применения), то рекомендую Вам обратиться на форум молекулярной биологии - МолБиол:
http://molbiol.ru/forums/index.php?showforum=1

Ознакомьтесь с ним - часть вопросов отпадёт сама собой

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 7636
  • Страна: 00
  • Рейтинг +933/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Соматические клетки
« Ответ #2 : 14 Сентябрь 2022, 18:56:06 »
вопрос это по попгенетике а не молбиолу (тк мутации джермлайна - тоже попгенетика)

Новую мутацию мы припишем младшему сыну, тогда как она на самом деле случилась у его отца?..

разумеется
это оправдано тем что вероятность у другого ребенка схватить сабжевую мутацию в джермлайне отца, восходящем к тому же самому митозу (принесшему мутацию) - мала, из-за большого количества клеток мужской спермолинии

Про подтверждение эмпирикой - надо учитывать что при текущем разрешении Y 1 снип вскакивает примерно 1 раз в 130 лет. Однако инделов более чем достаточно - даже для того чтобы увидеть некий индел, которым допустим был бы у двоих сыновей, но отсутствовал у отца. Это интересная ситуация. Втч для сравнения вероятности двух сыновних линий произойти от одного отцовского спермомитоза vs гомоплазия. С всеми вытекающими. То есть от веса мутации зависит решение.

Я никаких эмпирических примеров не знаю.

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 7636
  • Страна: 00
  • Рейтинг +933/-6
  • Ultimate Matriarchy
Re: Соматические клетки
« Ответ #3 : 14 Сентябрь 2022, 19:06:19 »
Нужна матмодель "древа" митозов и mcmc симуляция этого дела. Не уверен что наличествующий софт позволяет: модель для рождений и смертей клеток главной стволовой линии (джермлайна) должна иметься в списке поддерживаемых софтом (не уверен что это можно аппроксимировать моделями размножения для гаплоидных патогенов, типа бактерий).

Только так можно было бы сравнить вероятности, имей мы на руках такое трио (отец и два одинаково мутантных сына).

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15156
  • Страна: az
  • Рейтинг +4541/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Соматические клетки
« Ответ #4 : 14 Сентябрь 2022, 21:43:53 »
Валер, мне очень хочется верить, что наш уважаемый коллега понял твой комментарий :)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.