Краткое введениеYFull - российская компания, которая специализируется на анализе данных по продвинутым тестам Y-хромосомы, таких как Big Y в FamilyTreeDNA или тестов полногеномного секвенирования. Основной формат данных для анализа - BAM-файл, но для результатов теста Big Y можно перенести файл в формате VCF (он выдается бесплатно.) YFull определяет новые снипы и выделяет субклады в дереве Y-ДНК, а также рассчитывает возраст ближайшего общего предка, ВБОП или TMRCA. Так как компания принимает результаты полногеномных тестов из других лабораторий, например YSEQ, Nebula Genomics и Dante Labs, то ваш терминальный снип и субклад могут отличаться от определенных снипов и субкладов в FamilyTreeDNA.
После теста Big Y можно перенести следующие результаты:
- VCF-файл - выдается бесплатно после теста, но содержит меньше генетических данных. STR-маркеры выделить нельзя, а выделение новых снипов может быть сложнее.
- BAM-файл - необходимо выкупить в FTDNA, на момент написания это стоит 100$. BAM-файл содержит значительно больше генетических данных, что позволяет точнее выделить и определить “качество” выделенных снипов. Если после анализа VCF-файл субклад не выделился, то анализ BAM-файл может изменить ситуацию.
- CSV-файл с данными по STR-маркерам. Это позволит заполнить значения STR-маркеров, которые невозможно или трудно надежно выделить из данных в BAM-файле.
Анализ в YFull стоит на момент написания 45€. Если вы сначала проанализировали данные в VCF-файле, то можно позже бесплатно загрузить BAM-файл. Если вы не оплатите анализ, то спустя месяц ваш результат не будет виден в дереве YFull и не будет участвовать в оценке возраста ближайшего общего предка.
В YFull можно перенести сразу BAM-файл, но можно поступить и иначе - загрузить сначала VCF-файл, а со временем выкупить BAM-файл и перенести его в YFull. Рекомендуется перенести также CSV-файл с данными по STR-маркерам.
В установках аккаунта укажите данные о регионе происхождения самого дальнего (древнего) известного мужского предка, его имя и даты жизни. Этническую принадлежность предка можно указать выбрав подходящий язык предка. На сайте YFull есть также гаплогруппные и фамильные проекты, в которые вы можете вступить.