Это, видимо, первоначальный текст, а потом был расширенный вариант статьи, подготовленный для сайта Гентиса. А теперь исходник только в виде цитат у других авторов - у Склярова, например...
В архиве интернета: https://web.archive.org/web/20120510123102/http://gentis.ru/info/articles?start=5
Там ссылка на элементы, та же статья.
Да, но вот этого фрагмента там нет:
..В каком порядке происходили мутации в линии Taxon3? Ответить на данный вопрос, имея в наличии только указанный элайнмент, невозможно, например сначала могла произойти мутация в 3-ей вариабельной позиции, а затем в 4-ой, либо наоборот, сначала в 4-ой а затем в 3-ей, или наконец, обе мутации могли произойти одновременно при одной трансмиссии, хотя это и маловероятно. Однако, если бы в нашем элайнменте присутствовал такой сиквенс:
Taxon4 AGCCTGAATCGTATTAGCATGCA
то обнаружим, что он лежит "на полпути" между вариантом Taxon3 и общим предком Anc, имея только одну мутировавшую позицию - 4-ую. Таким образом, сиквенс Taxon4 - предок сиквенса Taxon3, что не мешает обоим "жить" в одно время, ведь мы сейчас рассматриваем не реальные организмы, а участки их ДНК, которые могут мутировать с разной скоростью, вследствие чего среди живых потомков Taxon4 есть как неизменные, так и мутировавшие до состояния Taxon3. Более того, среди ныне живущих организмов вполне может встретиться и носитель предкового типа Anc, хотя со временем количество таких неизмененных вариантов убывает.
Итак, мы провели простейшую филогенетическую реконструкцию - восстановили вид общего предка трех сиквенсов, при этом столкнулись с неопределенностью порядка возникновения мутаций и видели, как добавление новых данных может изменить точность нашего анализа. Изучением истории генов по ДНК занимается молекулярная филогенетика, в которой разработаны практические методы построения таких реконструкций - филогенетических деревьев, которые описывают развитие сиквенсов от древнего предка к его ныне живущим потомкам. Обсуждение методов построения деревьев выходит за рамки нашего краткого пособия, однако ниже мы рассмотрим еще несколько вопросов, относящихся к филогенетике, понимание которых принципиально даже для начинающего специалиста по молекулярной генеалогии.
Тема: Про деревья гаплогрупп (Прочитано 12682 раз)